MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chitinophaga pinensis DSM 2588 chromosome

Total Repeats: 22683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013132	CAC	2	6	185731	185736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_013132	TAT	2	6	185773	185778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_013132	T	6	6	185784	185789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_013132	TGC	2	6	185905	185910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_013132	AAT	2	6	185912	185917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_013132	CGA	2	6	185966	185971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_013132	GCT	2	6	186005	186010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_013132	CTG	2	6	186036	186041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_013132	GCC	2	6	186198	186203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_013132	CAA	2	6	186206	186211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_013132	GCA	2	6	186213	186218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_013132	CTG	2	6	186236	186241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_013132	TAA	2	6	186246	186251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_013132	AAAG	2	8	186392	186399	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
515	NC_013132	ATA	2	6	186457	186462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_013132	TA	3	6	186469	186474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_013132	TTTA	2	8	186650	186657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_013132	ATA	2	6	186737	186742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_013132	TTA	2	6	186760	186765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_013132	TCATT	2	10	186783	186792	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
521	NC_013132	GCT	2	6	186795	186800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_013132	GA	3	6	186904	186909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_013132	TAA	2	6	186924	186929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_013132	AAT	2	6	186943	186948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013132	GAA	2	6	187020	187025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_013132	AT	4	8	187030	187037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_013132	TTTTG	2	10	187107	187116	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
528	NC_013132	ATA	2	6	187144	187149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_013132	ATC	2	6	187177	187182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_013132	AC	3	6	187230	187235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
531	NC_013132	AATG	2	8	187250	187257	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
532	NC_013132	AAATG	2	10	187280	187289	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
533	NC_013132	CAT	2	6	187316	187321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_013132	GCAA	2	8	187329	187336	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
535	NC_013132	TTA	2	6	187403	187408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_013132	AGA	3	9	187443	187451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_013132	A	7	7	187497	187503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_013132	GA	3	6	187559	187564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_013132	ACG	2	6	187597	187602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_013132	TAA	2	6	187710	187715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_013132	AAC	2	6	187780	187785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_013132	TAA	2	6	190255	190260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_013132	A	6	6	190259	190264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_013132	CAAT	2	8	190309	190316	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
545	NC_013132	TTC	3	9	190344	190352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_013132	ATC	2	6	190396	190401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_013132	TAG	2	6	190532	190537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_013132	ATC	2	6	193514	193519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_013132	TAA	2	6	194899	194904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_013132	CAG	2	6	194927	194932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_013132	CAAA	2	8	194950	194957	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
552	NC_013132	AAG	2	6	195471	195476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_013132	ATA	2	6	195528	195533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_013132	CATC	2	8	195538	195545	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_013132	AATA	2	8	195581	195588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_013132	GAA	2	6	202772	202777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_013132	CTT	2	6	202828	202833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_013132	ATT	2	6	202910	202915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_013132	CTA	2	6	207195	207200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_013132	ATC	2	6	207223	207228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_013132	CGG	2	6	209430	209435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_013132	T	7	7	209440	209446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_013132	TCA	2	6	209479	209484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_013132	TATTC	2	10	209506	209515	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
565	NC_013132	TAT	2	6	209535	209540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_013132	A	6	6	210608	210613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_013132	CCG	2	6	210696	210701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_013132	C	6	6	210804	210809	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
569	NC_013132	ATA	2	6	210849	210854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_013132	TC	3	6	210860	210865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
571	NC_013132	ATA	3	9	210875	210883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013132	TTCAT	2	10	210901	210910	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
573	NC_013132	CTC	2	6	210950	210955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_013132	AAC	2	6	210968	210973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_013132	TTC	2	6	211054	211059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_013132	A	6	6	211077	211082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_013132	T	6	6	211105	211110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_013132	ATTAA	2	10	214417	214426	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_013132	AC	3	6	214432	214437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_013132	ATT	2	6	214494	214499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_013132	CTTA	2	8	214520	214527	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
582	NC_013132	AGACAT	2	12	214533	214544	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
583	NC_013132	ATT	2	6	214575	214580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_013132	CAA	2	6	214600	214605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_013132	AT	3	6	214657	214662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_013132	GT	3	6	214666	214671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
587	NC_013132	GCA	2	6	214741	214746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_013132	A	8	8	215328	215335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_013132	AAC	2	6	215344	215349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_013132	CTT	2	6	215371	215376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_013132	AAT	2	6	215400	215405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_013132	GTC	2	6	217923	217928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_013132	TCAA	2	8	217963	217970	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
594	NC_013132	TTAA	2	8	219135	219142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_013132	T	6	6	219203	219208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_013132	AGA	2	6	219278	219283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_013132	CAT	2	6	219293	219298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_013132	AAT	2	6	219380	219385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_013132	TCT	2	6	219393	219398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_013132	A	6	6	219402	219407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_013132	TA	3	6	219421	219426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_013132	AACA	2	8	219433	219440	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
603	NC_013132	TAT	2	6	219484	219489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_013132	A	7	7	220992	220998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_013132	ATT	2	6	221017	221022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_013132	TTA	2	6	221048	221053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_013132	TTGA	2	8	223862	223869	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
608	NC_013132	TAT	2	6	223886	223891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_013132	AAT	2	6	223945	223950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_013132	A	6	6	223952	223957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_013132	ATAA	2	8	223993	224000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_013132	AAT	2	6	224512	224517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_013132	GTT	2	6	224556	224561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_013132	ATAA	2	8	224570	224577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_013132	AAC	2	6	224587	224592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_013132	TA	3	6	224597	224602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_013132	GAA	2	6	225463	225468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_013132	GTT	2	6	225477	225482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_013132	GTTTA	2	10	225485	225494	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
620	NC_013132	ATAGT	2	10	225499	225508	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
621	NC_013132	GCT	2	6	225521	225526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_013132	TCAG	2	8	225547	225554	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
623	NC_013132	T	7	7	225557	225563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_013132	A	6	6	225575	225580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_013132	T	6	6	225632	225637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_013132	CAAA	2	8	225682	225689	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
627	NC_013132	CAGC	2	8	226367	226374	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
628	NC_013132	CATCCT	2	12	227440	227451	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
629	NC_013132	TGA	2	6	227453	227458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_013132	T	6	6	227493	227498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_013132	T	8	8	227508	227515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_013132	TAT	2	6	227562	227567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_013132	TAA	2	6	227577	227582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_013132	ATTCA	2	10	228513	228522	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
635	NC_013132	TCA	2	6	228534	228539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_013132	A	7	7	228579	228585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_013132	TAAAT	2	10	228586	228595	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_013132	TAA	2	6	229666	229671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_013132	A	7	7	230665	230671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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643	NC_013132	T	6	6	231309	231314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_013132	T	6	6	231332	231337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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648	NC_013132	T	7	7	232854	232860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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666	NC_013132	AAT	2	6	240929	240934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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795	NC_013132	GTA	2	6	274983	274988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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802	NC_013132	TCA	2	6	279559	279564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
803	NC_013132	AT	3	6	279624	279629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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901	NC_013132	CAACA	2	10	320032	320041	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
902	NC_013132	TA	5	10	320051	320060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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910	NC_013132	A	7	7	320294	320300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
911	NC_013132	CTT	2	6	320385	320390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
912	NC_013132	CATG	2	8	322278	322285	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
913	NC_013132	AATT	2	8	322293	322300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
914	NC_013132	TTC	2	6	322305	322310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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952	NC_013132	A	7	7	334554	334560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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