MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chitinophaga pinensis DSM 2588 chromosome

Total Repeats: 22683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013132	CCG	2	6	1783393	1783398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5002	NC_013132	TCA	2	6	1783410	1783415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_013132	A	6	6	1783454	1783459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_013132	AT	3	6	1785914	1785919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_013132	TCC	2	6	1785936	1785941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5006	NC_013132	CA	3	6	1785947	1785952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5007	NC_013132	TTA	2	6	1785989	1785994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_013132	ATTAA	2	10	1786009	1786018	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_013132	AAG	2	6	1786026	1786031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_013132	GTA	2	6	1786919	1786924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_013132	AAAT	2	8	1787691	1787698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_013132	ATT	2	6	1787699	1787704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_013132	ATGT	2	8	1787742	1787749	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_013132	TGC	2	6	1787815	1787820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_013132	CGT	2	6	1787839	1787844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_013132	CTT	2	6	1787883	1787888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_013132	TAA	2	6	1787900	1787905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_013132	TAAA	2	8	1787919	1787926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_013132	A	6	6	1787924	1787929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_013132	CGG	2	6	1787967	1787972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_013132	CTT	2	6	1788008	1788013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_013132	TAAA	2	8	1792720	1792727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_013132	AC	3	6	1792784	1792789	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5024	NC_013132	TGA	2	6	1792815	1792820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_013132	ATA	2	6	1794884	1794889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_013132	TAC	2	6	1794899	1794904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_013132	T	7	7	1794938	1794944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_013132	TTTAT	2	10	1796031	1796040	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_013132	T	6	6	1796151	1796156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_013132	GTT	2	6	1796165	1796170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_013132	TAGTT	2	10	1796177	1796186	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_013132	AG	3	6	1796205	1796210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_013132	GA	3	6	1796228	1796233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_013132	ATT	2	6	1796272	1796277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_013132	CAA	2	6	1796327	1796332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_013132	TTC	2	6	1796337	1796342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_013132	CA	3	6	1796362	1796367	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5038	NC_013132	A	6	6	1796373	1796378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_013132	ATC	2	6	1797465	1797470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_013132	A	7	7	1797471	1797477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_013132	AGC	2	6	1798659	1798664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_013132	GA	3	6	1798711	1798716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_013132	T	7	7	1799796	1799802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_013132	AAT	2	6	1799808	1799813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_013132	CTTTT	2	10	1799871	1799880	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5046	NC_013132	TA	3	6	1799890	1799895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_013132	TGC	2	6	1799922	1799927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_013132	T	6	6	1799929	1799934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_013132	ATA	2	6	1799984	1799989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_013132	AGG	2	6	1799993	1799998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_013132	GTT	2	6	1800006	1800011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_013132	TAT	2	6	1800024	1800029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_013132	TCT	2	6	1802102	1802107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_013132	ATT	2	6	1802108	1802113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_013132	ATT	2	6	1803493	1803498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_013132	A	8	8	1803506	1803513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_013132	CTG	2	6	1803544	1803549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_013132	ACC	3	9	1803587	1803595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5059	NC_013132	CAG	2	6	1803636	1803641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_013132	ATT	2	6	1803701	1803706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_013132	ATAC	2	8	1803708	1803715	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5062	NC_013132	AATG	2	8	1803737	1803744	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_013132	TAAA	2	8	1803820	1803827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_013132	GT	3	6	1803854	1803859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_013132	TGG	2	6	1803871	1803876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_013132	ATA	2	6	1803913	1803918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_013132	GCA	2	6	1803919	1803924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_013132	ACA	2	6	1803932	1803937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_013132	ATT	2	6	1803988	1803993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_013132	ACA	2	6	1804000	1804005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_013132	ATT	2	6	1804032	1804037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_013132	CAT	2	6	1804142	1804147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_013132	TATTT	2	10	1804148	1804157	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_013132	CTG	2	6	1804159	1804164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_013132	ATT	2	6	1804167	1804172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_013132	T	7	7	1804180	1804186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_013132	ATT	2	6	1805107	1805112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_013132	TTA	2	6	1805125	1805130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_013132	TC	3	6	1805132	1805137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5080	NC_013132	AAC	2	6	1805150	1805155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_013132	CAA	2	6	1805166	1805171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_013132	GCA	2	6	1805175	1805180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_013132	TGC	2	6	1805184	1805189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_013132	TAA	2	6	1805203	1805208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_013132	TAT	2	6	1805237	1805242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_013132	TTA	2	6	1807877	1807882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_013132	TGCAT	2	10	1807909	1807918	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5088	NC_013132	TTA	2	6	1807979	1807984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_013132	ACG	2	6	1811688	1811693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_013132	GT	3	6	1811695	1811700	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_013132	TATTTT	2	12	1811715	1811726	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_013132	CAG	2	6	1811732	1811737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_013132	GGC	2	6	1813938	1813943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_013132	GTT	2	6	1815513	1815518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_013132	CTATTT	2	12	1817833	1817844	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5096	NC_013132	CCTGA	2	10	1817854	1817863	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5097	NC_013132	CGC	2	6	1817871	1817876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5098	NC_013132	TAC	2	6	1817889	1817894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_013132	ATCA	2	8	1817957	1817964	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5100	NC_013132	ACT	2	6	1817981	1817986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_013132	CAA	2	6	1822261	1822266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_013132	GAAT	2	8	1822285	1822292	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_013132	A	6	6	1822299	1822304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_013132	GTT	2	6	1822400	1822405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_013132	AAT	2	6	1822430	1822435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_013132	AGA	2	6	1822442	1822447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_013132	TAA	2	6	1824082	1824087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_013132	TAA	2	6	1824965	1824970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_013132	GTTT	2	8	1825023	1825030	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_013132	CTT	2	6	1825064	1825069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_013132	GCAA	2	8	1827737	1827744	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5112	NC_013132	TAA	2	6	1827753	1827758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_013132	A	6	6	1827757	1827762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_013132	T	7	7	1827795	1827801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_013132	AGG	2	6	1827803	1827808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_013132	A	6	6	1827822	1827827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_013132	AAT	2	6	1827838	1827843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_013132	ATA	2	6	1827953	1827958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_013132	CTA	2	6	1827982	1827987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_013132	TGT	2	6	1828521	1828526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_013132	AAC	2	6	1831895	1831900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_013132	GCGG	2	8	1831984	1831991	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5123	NC_013132	TTA	2	6	1832015	1832020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_013132	GTA	2	6	1832043	1832048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_013132	GCA	2	6	1832064	1832069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_013132	AT	3	6	1832175	1832180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_013132	TGGT	2	8	1832249	1832256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_013132	TGA	2	6	1832260	1832265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_013132	CAG	2	6	1832315	1832320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_013132	CAA	2	6	1832339	1832344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_013132	AGT	2	6	1832351	1832356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_013132	T	8	8	1832356	1832363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_013132	AT	4	8	1832420	1832427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_013132	AGGC	2	8	1832462	1832469	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5135	NC_013132	ACA	2	6	1832532	1832537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5136	NC_013132	ACT	2	6	1832632	1832637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5137	NC_013132	TTA	3	9	1832640	1832648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_013132	ATTTT	2	10	1832993	1833002	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5139	NC_013132	TGC	2	6	1833032	1833037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5140	NC_013132	T	8	8	1833144	1833151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5141	NC_013132	TAC	2	6	1833153	1833158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5142	NC_013132	GAT	2	6	1833630	1833635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_013132	TA	3	6	1833661	1833666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5144	NC_013132	TTC	2	6	1833680	1833685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5145	NC_013132	CTTCAT	2	12	1833706	1833717	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5146	NC_013132	TTC	2	6	1833733	1833738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5147	NC_013132	GAA	2	6	1833749	1833754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5148	NC_013132	TAC	2	6	1833762	1833767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5149	NC_013132	TTA	2	6	1833772	1833777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5150	NC_013132	ATA	2	6	1833806	1833811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5151	NC_013132	TTG	2	6	1833841	1833846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5152	NC_013132	ATG	2	6	1833848	1833853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5153	NC_013132	ACTG	2	8	1833890	1833897	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5154	NC_013132	TAA	3	9	1833904	1833912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5155	NC_013132	GCA	3	9	1833913	1833921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5158	NC_013132	TTG	2	6	1834207	1834212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5159	NC_013132	ATT	2	6	1834224	1834229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5160	NC_013132	GTA	2	6	1834264	1834269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5161	NC_013132	TATT	2	8	1834366	1834373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5162	NC_013132	ACT	2	6	1834399	1834404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5164	NC_013132	TTA	2	6	1834480	1834485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5166	NC_013132	T	6	6	1835156	1835161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5167	NC_013132	CT	3	6	1835164	1835169	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5168	NC_013132	TA	3	6	1835193	1835198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5169	NC_013132	GCT	2	6	1835241	1835246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5171	NC_013132	GTA	2	6	1835274	1835279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5172	NC_013132	ACA	2	6	1835353	1835358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5173	NC_013132	ATC	2	6	1835411	1835416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5175	NC_013132	TGTAA	2	10	1840140	1840149	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5182	NC_013132	TTA	2	6	1841857	1841862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5211	NC_013132	ATT	2	6	1854680	1854685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5212	NC_013132	ATT	2	6	1857211	1857216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5222	NC_013132	C	7	7	1863708	1863714	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5223	NC_013132	AAT	2	6	1863717	1863722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5225	NC_013132	AAT	2	6	1863732	1863737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5229	NC_013132	AAT	2	6	1863772	1863777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5231	NC_013132	AAT	2	6	1863787	1863792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5244	NC_013132	AT	3	6	1878242	1878247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5245	NC_013132	T	7	7	1878262	1878268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5246	NC_013132	TCT	2	6	1878270	1878275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5249	NC_013132	ATT	2	6	1878311	1878316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5251	NC_013132	GT	3	6	1878348	1878353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5252	NC_013132	A	7	7	1878402	1878408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_013132	ATT	2	6	1879417	1879422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_013132	AAC	2	6	1879426	1879431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5255	NC_013132	T	6	6	1881427	1881432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5256	NC_013132	T	6	6	1881483	1881488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5257	NC_013132	GCA	2	6	1881530	1881535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5258	NC_013132	GCAAA	2	10	1881541	1881550	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5259	NC_013132	A	8	8	1881564	1881571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5260	NC_013132	AAT	2	6	1881609	1881614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5261	NC_013132	GCG	2	6	1881629	1881634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5262	NC_013132	GCT	2	6	1882211	1882216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5264	NC_013132	A	6	6	1884379	1884384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5265	NC_013132	A	6	6	1884468	1884473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5266	NC_013132	TTG	2	6	1884500	1884505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5343	NC_013132	GTA	2	6	1925218	1925223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5353	NC_013132	AATG	2	8	1925944	1925951	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5355	NC_013132	AATG	2	8	1925987	1925994	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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