MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Catenulispora acidiphila DSM 44928 chromosome

Total Repeats: 28185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28001	NC_013131	CG	3	6	10402648	10402653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28002	NC_013131	GCC	3	9	10402657	10402665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28003	NC_013131	TGC	2	6	10403770	10403775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28004	NC_013131	GTG	2	6	10403795	10403800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28005	NC_013131	CTG	2	6	10403814	10403819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28006	NC_013131	GGGC	2	8	10403849	10403856	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28007	NC_013131	GAGC	2	8	10403867	10403874	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28008	NC_013131	CAG	2	6	10403927	10403932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28009	NC_013131	CGA	2	6	10403957	10403962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28010	NC_013131	CGCCC	2	10	10404653	10404662	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
28011	NC_013131	CGG	2	6	10404675	10404680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28012	NC_013131	GTC	2	6	10404693	10404698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28013	NC_013131	GA	3	6	10404782	10404787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28014	NC_013131	CGG	2	6	10404802	10404807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28015	NC_013131	CCG	2	6	10404831	10404836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28016	NC_013131	TGA	2	6	10404860	10404865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28017	NC_013131	GGC	2	6	10404866	10404871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28018	NC_013131	AG	3	6	10404915	10404920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28019	NC_013131	TCG	2	6	10405732	10405737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28020	NC_013131	GCCT	2	8	10405756	10405763	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28021	NC_013131	CGG	2	6	10405779	10405784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28022	NC_013131	CGCAG	2	10	10405802	10405811	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28023	NC_013131	ACGA	2	8	10405817	10405824	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28024	NC_013131	CGGC	2	8	10405895	10405902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28025	NC_013131	CCG	2	6	10405908	10405913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28026	NC_013131	GCGG	2	8	10405952	10405959	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28027	NC_013131	T	6	6	10406023	10406028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28028	NC_013131	CGA	2	6	10406038	10406043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28029	NC_013131	AGG	2	6	10406081	10406086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28030	NC_013131	CAC	2	6	10406145	10406150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28031	NC_013131	GTC	2	6	10406152	10406157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28032	NC_013131	GCGCCG	2	12	10406190	10406201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28033	NC_013131	GC	3	6	10406203	10406208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28034	NC_013131	GCCGG	2	10	10407189	10407198	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28035	NC_013131	CGGCG	2	10	10407215	10407224	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28036	NC_013131	CTGGT	2	10	10407940	10407949	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28037	NC_013131	CTG	2	6	10408016	10408021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28038	NC_013131	CGG	2	6	10408040	10408045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28039	NC_013131	CGG	2	6	10408050	10408055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28040	NC_013131	GCG	2	6	10408086	10408091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28041	NC_013131	CAG	2	6	10408123	10408128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28042	NC_013131	GGA	2	6	10408995	10409000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28043	NC_013131	GCAG	2	8	10409010	10409017	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28044	NC_013131	GCG	2	6	10409046	10409051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28045	NC_013131	TGC	2	6	10409287	10409292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28046	NC_013131	GTC	2	6	10409294	10409299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28047	NC_013131	GGT	2	6	10409300	10409305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28048	NC_013131	CCA	2	6	10409334	10409339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28049	NC_013131	GGC	2	6	10409412	10409417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28050	NC_013131	TCG	2	6	10409424	10409429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28051	NC_013131	GTC	2	6	10409472	10409477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28052	NC_013131	CT	3	6	10409481	10409486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28053	NC_013131	CGGC	2	8	10409508	10409515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28054	NC_013131	AGA	2	6	10409544	10409549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28055	NC_013131	CGT	2	6	10410416	10410421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28056	NC_013131	TGG	2	6	10410432	10410437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28057	NC_013131	GTG	2	6	10410810	10410815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28058	NC_013131	GCG	2	6	10410839	10410844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28059	NC_013131	CGG	2	6	10410855	10410860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28060	NC_013131	GCG	2	6	10410880	10410885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28061	NC_013131	GCG	2	6	10410893	10410898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28062	NC_013131	TGG	2	6	10411465	10411470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28063	NC_013131	GCCGC	2	10	10411500	10411509	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28064	NC_013131	GAG	2	6	10411521	10411526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28065	NC_013131	CGGGCT	2	12	10411555	10411566	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28066	NC_013131	TGGG	2	8	10412228	10412235	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
28067	NC_013131	GCC	2	6	10412252	10412257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28068	NC_013131	CGG	3	9	10412287	10412295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28069	NC_013131	GTC	2	6	10412814	10412819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28070	NC_013131	GCC	2	6	10412826	10412831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28071	NC_013131	CT	3	6	10412853	10412858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28072	NC_013131	CGC	2	6	10413089	10413094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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28074	NC_013131	CTC	3	9	10413205	10413213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28075	NC_013131	TGC	2	6	10413214	10413219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28076	NC_013131	GCG	2	6	10413883	10413888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28077	NC_013131	GCAG	2	8	10413905	10413912	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28078	NC_013131	CGG	2	6	10413921	10413926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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28080	NC_013131	TGG	2	6	10414014	10414019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28081	NC_013131	GAA	2	6	10414038	10414043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28082	NC_013131	CGC	2	6	10414148	10414153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28083	NC_013131	GCC	2	6	10414984	10414989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28084	NC_013131	GTCGC	2	10	10414996	10415005	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28085	NC_013131	GGCCG	2	10	10417936	10417945	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28086	NC_013131	GTG	2	6	10418005	10418010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28087	NC_013131	GCA	2	6	10418035	10418040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28088	NC_013131	AC	3	6	10418077	10418082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28089	NC_013131	GCC	2	6	10419929	10419934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28090	NC_013131	GTGAAG	2	12	10419947	10419958	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
28091	NC_013131	AG	4	8	10419957	10419964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28092	NC_013131	CCGG	2	8	10419968	10419975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28093	NC_013131	CCGG	2	8	10419984	10419991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28094	NC_013131	TGC	2	6	10421002	10421007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28095	NC_013131	TC	3	6	10421022	10421027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28096	NC_013131	GTC	2	6	10421035	10421040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28097	NC_013131	GCC	2	6	10421047	10421052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28098	NC_013131	CTC	2	6	10421182	10421187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28099	NC_013131	CGGC	3	12	10421290	10421301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28100	NC_013131	GGC	2	6	10422612	10422617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28101	NC_013131	TG	3	6	10422629	10422634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28102	NC_013131	CGC	2	6	10423630	10423635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28103	NC_013131	AGC	2	6	10423668	10423673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28104	NC_013131	GGTG	2	8	10423677	10423684	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
28105	NC_013131	CGC	2	6	10424392	10424397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28106	NC_013131	GAC	2	6	10424410	10424415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28107	NC_013131	AGA	2	6	10424436	10424441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28108	NC_013131	GAT	2	6	10424446	10424451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28109	NC_013131	CCGT	2	8	10424559	10424566	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28110	NC_013131	GC	3	6	10424691	10424696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28111	NC_013131	CGTG	2	8	10424721	10424728	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28112	NC_013131	TGA	2	6	10425813	10425818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28113	NC_013131	GAT	2	6	10425843	10425848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28114	NC_013131	CG	3	6	10426315	10426320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28115	NC_013131	TCGA	2	8	10426372	10426379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28116	NC_013131	CGC	2	6	10426380	10426385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28117	NC_013131	GCCG	2	8	10427207	10427214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28118	NC_013131	CTA	2	6	10428052	10428057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28119	NC_013131	GAC	2	6	10428078	10428083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28120	NC_013131	GAG	2	6	10428109	10428114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28121	NC_013131	ACG	2	6	10431872	10431877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28122	NC_013131	G	6	6	10432039	10432044	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28123	NC_013131	GAG	2	6	10432101	10432106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28124	NC_013131	GCC	2	6	10434500	10434505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28125	NC_013131	GGC	2	6	10434510	10434515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28126	NC_013131	CCG	2	6	10434516	10434521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28127	NC_013131	GCC	2	6	10434579	10434584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28128	NC_013131	GGC	2	6	10434596	10434601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28129	NC_013131	GC	3	6	10434626	10434631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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28133	NC_013131	GGT	2	6	10436322	10436327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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28141	NC_013131	CGG	2	6	10439261	10439266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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28153	NC_013131	CG	3	6	10455228	10455233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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28155	NC_013131	GA	4	8	10455724	10455731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28156	NC_013131	GTAGG	2	10	10455740	10455749	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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28185	NC_013131	GCG	2	6	10467765	10467770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.