MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Catenulispora acidiphila DSM 44928 chromosome

Total Repeats: 28185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013131	CGA	2	6	220378	220383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_013131	GC	3	6	220449	220454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
503	NC_013131	CTGC	2	8	220559	220566	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
504	NC_013131	CGCT	2	8	220633	220640	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
505	NC_013131	GCG	2	6	220652	220657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_013131	CAT	2	6	222059	222064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_013131	GCC	2	6	222075	222080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_013131	CCGA	2	8	222148	222155	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
509	NC_013131	CG	3	6	222428	222433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
510	NC_013131	GAAGGT	2	12	230815	230826	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_013131	AGA	2	6	231637	231642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_013131	TC	3	6	232258	232263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_013131	GC	3	6	232331	232336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_013131	CTA	2	6	233105	233110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_013131	TCCG	2	8	233114	233121	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
516	NC_013131	CG	3	6	233120	233125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_013131	TCCAAC	2	12	233188	233199	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
518	NC_013131	TC	3	6	235216	235221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
519	NC_013131	TTTC	2	8	235226	235233	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
520	NC_013131	TCTG	2	8	235252	235259	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
521	NC_013131	GCC	2	6	237402	237407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_013131	CCA	2	6	237408	237413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_013131	GAT	2	6	237419	237424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_013131	GAG	2	6	237467	237472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013131	ATC	2	6	237522	237527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_013131	C	6	6	237546	237551	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
527	NC_013131	GCAC	2	8	237573	237580	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
528	NC_013131	CG	3	6	237587	237592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
529	NC_013131	CGTCG	2	10	237594	237603	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
530	NC_013131	TTC	2	6	240198	240203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_013131	TGCC	2	8	240272	240279	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
532	NC_013131	GGA	2	6	240315	240320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_013131	TTTC	2	8	240343	240350	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
534	NC_013131	TGC	2	6	240438	240443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_013131	GCA	2	6	240449	240454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_013131	GGTT	2	8	240486	240493	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_013131	CGC	2	6	240498	240503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_013131	CTC	2	6	240626	240631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_013131	CAC	2	6	240632	240637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_013131	TGT	2	6	240670	240675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_013131	TC	3	6	240711	240716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
542	NC_013131	GTT	2	6	240772	240777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_013131	TG	3	6	240919	240924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_013131	CCT	2	6	240933	240938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_013131	CGTC	2	8	240952	240959	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
546	NC_013131	GT	3	6	241079	241084	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
547	NC_013131	CCTG	2	8	241135	241142	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
548	NC_013131	GAG	2	6	241192	241197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_013131	AAG	2	6	241210	241215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_013131	TGG	2	6	241244	241249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_013131	TGTT	2	8	241276	241283	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
552	NC_013131	ATGG	2	8	244230	244237	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_013131	CGCGG	2	10	247036	247045	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
554	NC_013131	GAG	2	6	247050	247055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_013131	GACC	2	8	247064	247071	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
556	NC_013131	CGG	2	6	247104	247109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_013131	CTG	2	6	250540	250545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_013131	CCG	2	6	250562	250567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_013131	GAG	2	6	250576	250581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_013131	GCC	2	6	250582	250587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_013131	CGA	2	6	250590	250595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_013131	CGG	2	6	250611	250616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_013131	CGGC	2	8	252431	252438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
564	NC_013131	TGG	2	6	252490	252495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_013131	GC	3	6	252511	252516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
566	NC_013131	CGA	2	6	252577	252582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_013131	CCG	2	6	252589	252594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_013131	GT	3	6	252618	252623	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
569	NC_013131	GCA	2	6	252640	252645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_013131	GGA	2	6	252689	252694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_013131	CATA	2	8	252708	252715	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
572	NC_013131	CGG	2	6	252757	252762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_013131	GCC	2	6	252768	252773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_013131	GCG	2	6	252807	252812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_013131	GTG	2	6	252827	252832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_013131	CCA	2	6	252846	252851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_013131	AG	3	6	252876	252881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
578	NC_013131	G	6	6	252881	252886	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
579	NC_013131	CCA	2	6	255215	255220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_013131	GAC	2	6	259824	259829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_013131	CCG	2	6	261892	261897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_013131	GCGCGT	2	12	261901	261912	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_013131	GT	3	6	261911	261916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
584	NC_013131	GCA	2	6	261930	261935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_013131	TCCGT	2	10	261948	261957	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
586	NC_013131	TGCT	2	8	261971	261978	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
587	NC_013131	CTG	2	6	261994	261999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_013131	CCGG	2	8	262020	262027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
589	NC_013131	C	6	6	262204	262209	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
590	NC_013131	CGC	2	6	262217	262222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_013131	TCG	2	6	262241	262246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_013131	CG	3	6	262285	262290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
593	NC_013131	CGG	2	6	262303	262308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_013131	GTG	2	6	262323	262328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_013131	GCG	2	6	262336	262341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_013131	CGC	2	6	262359	262364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_013131	AGG	2	6	262379	262384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
598	NC_013131	GAT	2	6	262413	262418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_013131	GCG	2	6	262471	262476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_013131	GTC	2	6	262485	262490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_013131	GATG	2	8	262522	262529	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
602	NC_013131	TTTC	2	8	262603	262610	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
603	NC_013131	TGA	2	6	262632	262637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_013131	CGA	2	6	262673	262678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_013131	CAG	2	6	262693	262698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_013131	AAG	2	6	262764	262769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_013131	CGG	2	6	262861	262866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_013131	GTA	2	6	263082	263087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_013131	CGG	2	6	263111	263116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_013131	GCG	2	6	263118	263123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_013131	CGG	2	6	263125	263130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_013131	GT	3	6	263245	263250	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_013131	CGA	2	6	263313	263318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_013131	ACGTA	2	10	263355	263364	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
615	NC_013131	CTG	2	6	263382	263387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_013131	GGA	2	6	263393	263398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_013131	TCC	2	6	263471	263476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_013131	GC	3	6	263483	263488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
619	NC_013131	TC	3	6	263510	263515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
620	NC_013131	GTG	2	6	263534	263539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_013131	CGG	2	6	264533	264538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_013131	GTGCG	2	10	264584	264593	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
623	NC_013131	GCG	2	6	264613	264618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_013131	CA	3	6	264625	264630	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
625	NC_013131	CCGGG	2	10	264649	264658	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
626	NC_013131	GAG	2	6	264669	264674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_013131	CGG	2	6	265139	265144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_013131	ACG	2	6	265158	265163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_013131	TGG	2	6	265186	265191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_013131	GCT	2	6	265204	265209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_013131	TTG	2	6	265293	265298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_013131	CTC	2	6	266342	266347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_013131	AGGG	2	8	266354	266361	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
634	NC_013131	GAC	2	6	267272	267277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_013131	GCG	2	6	267280	267285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_013131	CTCG	2	8	267309	267316	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
637	NC_013131	GCG	3	9	267317	267325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_013131	TGC	2	6	267353	267358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_013131	GC	3	6	267373	267378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
640	NC_013131	TGC	2	6	267379	267384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_013131	CGG	2	6	267408	267413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_013131	GC	3	6	267458	267463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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651	NC_013131	CG	3	6	267712	267717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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662	NC_013131	TGCT	2	8	271111	271118	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
663	NC_013131	CGG	2	6	272280	272285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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773	NC_013131	TGG	2	6	322569	322574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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922	NC_013131	GCCA	2	8	379818	379825	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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924	NC_013131	GCCA	2	8	379842	379849	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
925	NC_013131	GCCA	2	8	379858	379865	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1000	NC_013131	GC	3	6	406947	406952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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