MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Sulcia muelleri SMDSEM

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013123	TAAAT	2	10	1881	1890	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013123	TAAAT	2	10	6201	6210	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013123	ATTTA	2	10	12197	12206	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013123	TATTT	2	10	12643	12652	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013123	ATTAT	5	25	21755	21779	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013123	AATTG	3	15	22664	22678	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013123	TCATA	2	10	35124	35133	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013123	AATAA	3	15	45291	45305	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013123	AAAAT	2	10	46537	46546	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013123	TAACA	2	10	46646	46655	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_013123	TAAAT	2	10	46686	46695	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013123	AAATT	2	10	48103	48112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013123	ATTTT	2	10	48948	48957	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013123	TTATA	2	10	48959	48968	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013123	TATAT	2	10	57947	57956	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013123	TTTAA	2	10	72948	72957	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013123	GTTAA	2	10	73646	73655	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013123	CTTTT	2	10	75694	75703	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013123	TATTT	7	35	75711	75745	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013123	AATTT	6	30	75746	75775	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013123	AAAAT	2	10	76070	76079	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013123	AAAAT	2	10	76126	76135	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013123	AAAAT	2	10	76182	76191	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013123	AAAAT	2	10	76238	76247	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013123	AAAAT	2	10	76294	76303	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013123	AATAT	3	15	76337	76351	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013123	ATATA	76	380	76354	76733	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013123	TAAAT	2	10	76739	76748	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013123	TAGAT	4	20	77041	77060	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013123	TAGAT	2	10	77073	77082	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013123	TAGAT	2	10	77095	77104	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013123	TAGAT	2	10	77117	77126	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013123	TAGAT	2	10	77139	77148	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013123	TAGAT	2	10	77161	77170	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013123	TAGAT	2	10	77183	77192	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013123	TAGAT	2	10	77205	77214	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013123	TAGAT	2	10	77227	77236	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013123	TATAA	2	10	77290	77299	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013123	TATAA	5	25	78751	78775	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013123	AAAAT	2	10	86826	86835	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013123	GGTAA	2	10	87221	87230	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013123	AGGAG	2	10	88813	88822	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013123	GAAAA	2	10	89076	89085	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013123	GAAGA	2	10	89385	89394	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013123	GTTAA	2	10	90446	90455	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013123	CACTT	2	10	95334	95343	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_013123	ATTAA	2	10	96209	96218	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013123	TATAT	6	30	101473	101502	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013123	TTTGA	2	10	101516	101525	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013123	AATTA	2	10	101543	101552	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013123	ATATT	5	25	105530	105554	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013123	GAATT	8	40	105555	105594	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013123	CTTGA	2	10	107639	107648	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_013123	TGAAA	2	10	107663	107672	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013123	TGAAA	2	10	107699	107708	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013123	ATTTA	5	25	108689	108713	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013123	TTTTA	2	10	111235	111244	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013123	TAATG	2	10	125001	125010	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013123	TGGGG	2	10	149935	149944	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013123	ATTTA	2	10	157406	157415	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013123	AATTT	2	10	177568	177577	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013123	TAATT	2	10	177946	177955	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013123	AATTT	2	10	178091	178100	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013123	AATTA	2	10	179780	179789	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013123	TATTT	2	10	180047	180056	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013123	TAATT	2	10	180146	180155	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013123	GTAAT	2	10	185980	185989	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013123	AATTT	2	10	186068	186077	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013123	GATAA	2	10	186179	186188	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013123	ATATA	2	10	191498	191507	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013123	ATAAA	2	10	191508	191517	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013123	TAAAA	2	10	198757	198766	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013123	TAGAT	4	20	209788	209807	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013123	ATTTT	3	15	222891	222905	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013123	ATTTT	2	10	224965	224974	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013123	ATTAT	6	30	225431	225460	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013123	ATTTT	2	10	226024	226033	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013123	TTTTA	2	10	232315	232324	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013123	ATTAA	4	20	237605	237624	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013123	GAAAT	2	10	250003	250012	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013123	ATTTT	2	10	250282	250291	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013123	GTATA	2	10	250815	250824	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013123	TTATA	3	15	255418	255432	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013123	ATTCT	19	95	255660	255754	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_013123	TATAA	2	10	255923	255932	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013123	TATAA	2	10	255939	255948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013123	TATAA	2	10	255955	255964	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013123	TATAA	2	10	255971	255980	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013123	TATAA	2	10	255987	255996	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013123	TATAA	2	10	256003	256012	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013123	TATAA	2	10	256019	256028	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013123	TATAA	2	10	256035	256044	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013123	AAATA	2	10	256060	256069	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013123	TAGGT	3	15	256131	256145	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013123	ATTTT	2	10	256590	256599	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013123	ATTTT	2	10	256604	256613	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013123	ATTTT	2	10	256618	256627	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013123	ATTTT	2	10	256632	256641	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013123	ATTTT	2	10	256646	256655	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013123	ATTTT	2	10	256660	256669	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013123	ATTTT	2	10	256674	256683	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013123	ATTTT	2	10	256688	256697	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013123	ATTTT	2	10	256702	256711	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013123	ATTAA	2	10	272177	272186	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.