MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Sulcia muelleri SMDSEM

Total Repeats: 374

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013123	TAA	2	6	12005	12010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013123	ACA	2	6	12024	12029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013123	TAA	2	6	12093	12098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013123	TTA	2	6	12125	12130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013123	TAA	2	6	12191	12196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013123	AAG	2	6	12258	12263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013123	ACA	2	6	12324	12329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013123	TCC	2	6	12366	12371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_013123	AAT	2	6	12572	12577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013123	TAT	2	6	19111	19116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013123	TAA	2	6	19123	19128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013123	AAT	3	9	19163	19171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013123	AAT	2	6	19747	19752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013123	TAT	2	6	21754	21759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013123	TCG	2	6	22611	22616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013123	TTA	2	6	22689	22694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013123	AAT	2	6	26762	26767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013123	TAA	2	6	34698	34703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013123	TAA	2	6	45264	45269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013123	AGA	2	6	46554	46559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013123	AAT	2	6	46584	46589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013123	ATA	2	6	46620	46625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013123	ATT	2	6	46665	46670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013123	ATT	2	6	46675	46680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013123	TTC	2	6	47960	47965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013123	TCA	2	6	47966	47971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013123	ATT	2	6	48132	48137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013123	TTA	2	6	48154	48159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013123	TAA	2	6	48853	48858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013123	ATT	3	9	48881	48889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013123	ACC	2	6	59875	59880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_013123	ATT	2	6	61633	61638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013123	ATT	2	6	61661	61666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013123	TAA	2	6	61692	61697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013123	CAT	2	6	62656	62661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013123	TTA	2	6	62697	62702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013123	AAG	2	6	62752	62757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013123	ATA	2	6	62831	62836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013123	TTA	2	6	63686	63691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013123	ATT	2	6	74250	74255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013123	TAA	2	6	74282	74287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013123	GGT	2	6	74413	74418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013123	AAT	2	6	76007	76012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013123	CAG	2	6	76014	76019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013123	AAT	2	6	76060	76065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013123	AAT	2	6	76325	76330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013123	TAT	15	45	76749	76793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013123	ATT	2	6	76824	76829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013123	ATT	2	6	76832	76837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013123	ATT	2	6	76840	76845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013123	ATT	2	6	76849	76854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013123	TAA	2	6	76989	76994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013123	TTA	2	6	77012	77017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013123	GTT	2	6	77061	77066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013123	GTT	2	6	77083	77088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013123	GTT	2	6	77105	77110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013123	GTT	2	6	77127	77132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013123	GTT	2	6	77149	77154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013123	GTT	2	6	77171	77176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013123	GTT	2	6	77193	77198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013123	GTT	2	6	77215	77220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013123	GAT	2	6	77251	77256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013123	GAA	2	6	77301	77306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013123	GAA	2	6	77361	77366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013123	TAA	2	6	86811	86816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013123	ATT	2	6	86842	86847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013123	ATT	2	6	86853	86858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013123	GAA	2	6	86939	86944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013123	TTA	2	6	87158	87163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013123	TTA	2	6	87180	87185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013123	GCA	2	6	87318	87323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013123	ACT	2	6	87400	87405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013123	CAG	2	6	87483	87488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013123	GTT	2	6	87549	87554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013123	AGT	2	6	87564	87569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013123	GAT	2	6	87782	87787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013123	AAT	2	6	87803	87808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013123	GAG	2	6	87844	87849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013123	GAT	2	6	87922	87927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013123	TGC	2	6	88005	88010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013123	GTC	2	6	88017	88022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013123	TTA	3	9	88071	88079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013123	TAA	2	6	88107	88112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013123	GAC	2	6	88144	88149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013123	ATC	2	6	88155	88160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013123	GCA	2	6	88212	88217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013123	GTG	2	6	88325	88330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013123	TAA	2	6	88432	88437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013123	ACT	2	6	88669	88674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013123	AGG	2	6	88828	88833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013123	AGA	2	6	88862	88867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013123	AAG	2	6	88880	88885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013123	AGA	2	6	88889	88894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013123	TGG	2	6	88900	88905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013123	CAT	2	6	89027	89032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013123	GCG	2	6	89106	89111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013123	TAT	2	6	89135	89140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013123	ATT	2	6	89178	89183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013123	ATA	2	6	89186	89191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013123	ATA	2	6	89243	89248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013123	TAG	2	6	89255	89260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013123	CGT	2	6	89453	89458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013123	ATT	2	6	89487	89492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013123	AAT	2	6	89505	89510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013123	GGA	2	6	89625	89630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013123	GCA	2	6	89733	89738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013123	CTA	2	6	89795	89800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013123	AAC	2	6	89880	89885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013123	GAA	2	6	89925	89930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013123	GAT	2	6	89946	89951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013123	AGC	2	6	89972	89977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013123	ATA	2	6	90029	90034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013123	ATT	2	6	90305	90310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013123	TGA	2	6	90328	90333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013123	TGC	2	6	90344	90349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013123	GAT	2	6	90712	90717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013123	CGG	2	6	90805	90810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013123	GTA	2	6	90921	90926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013123	ACC	2	6	91076	91081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_013123	GTG	2	6	91127	91132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013123	GGT	2	6	91147	91152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013123	GGT	2	6	91291	91296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013123	GAA	2	6	91424	91429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013123	CGT	2	6	91486	91491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013123	CTT	2	6	91679	91684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013123	AGT	2	6	91750	91755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013123	AGA	3	9	91797	91805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013123	CAA	2	6	91860	91865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013123	GTT	2	6	94378	94383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013123	ATT	2	6	94415	94420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013123	TAA	2	6	94443	94448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013123	GAA	2	6	94484	94489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013123	ATG	2	6	94543	94548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013123	ATT	2	6	94555	94560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013123	GGA	2	6	94815	94820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013123	AGA	2	6	95061	95066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013123	ATT	2	6	95077	95082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013123	AAG	2	6	95159	95164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013123	ATT	2	6	95199	95204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013123	ATT	2	6	95211	95216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013123	ATT	2	6	95241	95246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_013123	TTA	2	6	207651	207656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_013123	ATT	2	6	207664	207669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_013123	TTA	2	6	207672	207677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_013123	ATT	2	6	207685	207690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_013123	TTA	2	6	207693	207698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_013123	ATT	2	6	207713	207718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_013123	TTA	2	6	207721	207726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_013123	TAT	2	6	207737	207742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_013123	CAT	2	6	209471	209476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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287	NC_013123	AAT	2	6	209927	209932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_013123	GTG	2	6	225470	225475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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313	NC_013123	TAA	2	6	232939	232944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_013123	TAT	2	6	233303	233308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
322	NC_013123	TTA	2	6	233333	233338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.