MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Liberibacter asiaticus str. psy62 chromosome

Total Repeats: 871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012985	TTTA	2	8	865	872	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012985	ATAA	2	8	11054	11061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012985	GCGA	2	8	11572	11579	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_012985	ATGG	2	8	11663	11670	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012985	AGTA	2	8	11693	11700	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012985	TCAT	2	8	11712	11719	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012985	CAGT	2	8	11752	11759	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012985	AGTG	2	8	12079	12086	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012985	AGAT	2	8	12517	12524	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012985	AATA	2	8	12763	12770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012985	ATGG	2	8	18738	18745	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012985	AAAC	2	8	19520	19527	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012985	TTCT	2	8	24172	24179	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012985	CAAC	2	8	30726	30733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012985	AAAC	2	8	30744	30751	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_012985	AATA	2	8	32998	33005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012985	ATCA	2	8	34535	34542	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012985	TTGA	2	8	34655	34662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012985	CACT	2	8	34862	34869	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012985	AAGC	2	8	37478	37485	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_012985	AGAA	2	8	37879	37886	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012985	TTCT	2	8	39079	39086	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_012985	GTTA	2	8	39328	39335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012985	TCTT	2	8	41528	41535	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_012985	TTTA	2	8	42320	42327	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012985	ATAA	2	8	42354	42361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012985	TGTA	2	8	42698	42705	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012985	TAGT	2	8	43940	43947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012985	AGCA	2	8	48041	48048	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_012985	CTTC	2	8	48286	48293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_012985	GCCT	2	8	56435	56442	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_012985	ATTT	2	8	56566	56573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012985	TATT	2	8	56699	56706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012985	GTTA	2	8	56899	56906	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012985	CTTT	2	8	57772	57779	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_012985	ATTG	2	8	62167	62174	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012985	CATA	2	8	66244	66251	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_012985	TAGA	2	8	70931	70938	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012985	ATTC	2	8	71295	71302	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012985	TCCT	2	8	71329	71336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012985	GTCG	2	8	71655	71662	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_012985	GAAA	2	8	73806	73813	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012985	ATTA	2	8	75396	75403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012985	AATG	2	8	75404	75411	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012985	GGAA	2	8	75887	75894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012985	AAGA	2	8	76137	76144	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012985	GAAA	2	8	76157	76164	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012985	AATA	2	8	81735	81742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012985	CATC	2	8	81817	81824	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012985	TTTA	2	8	83616	83623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012985	CATT	2	8	83765	83772	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_012985	ACAA	2	8	84111	84118	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012985	TTTA	2	8	84168	84175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012985	GAAA	2	8	84727	84734	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012985	ATAA	2	8	84947	84954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012985	AATT	2	8	85636	85643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012985	GTAT	2	8	87810	87817	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012985	AAAG	2	8	88985	88992	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012985	ATTT	2	8	89309	89316	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012985	TTCA	2	8	91285	91292	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_012985	AAAT	2	8	93330	93337	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012985	CTAT	2	8	93438	93445	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_012985	AACG	2	8	93472	93479	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_012985	ATTT	2	8	93507	93514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012985	CAAT	2	8	93558	93565	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_012985	TTAA	2	8	93941	93948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012985	AATG	2	8	99341	99348	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012985	CAAT	2	8	99380	99387	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_012985	ATTA	2	8	100675	100682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012985	CATA	2	8	104617	104624	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_012985	AAGT	2	8	106531	106538	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012985	CTTT	2	8	107958	107965	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_012985	ATTG	2	8	113744	113751	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012985	AAGA	2	8	116580	116587	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012985	ATAA	2	8	116612	116619	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012985	CAGT	2	8	117845	117852	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_012985	ATTG	2	8	124044	124051	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012985	TTGA	2	8	124168	124175	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012985	AATC	2	8	124278	124285	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_012985	TAGA	2	8	124302	124309	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012985	TATT	2	8	124377	124384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012985	CATA	2	8	124456	124463	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_012985	TTTC	2	8	125782	125789	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_012985	CTAA	2	8	125790	125797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_012985	AAAT	2	8	131777	131784	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012985	ACCT	2	8	138189	138196	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_012985	AAAC	2	8	141430	141437	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_012985	AATA	2	8	144685	144692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012985	AATT	2	8	148427	148434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012985	TCTT	2	8	155174	155181	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_012985	ATAA	2	8	156459	156466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012985	AAAT	2	8	159508	159515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012985	TCAT	2	8	159892	159899	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_012985	CAAT	2	8	161716	161723	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_012985	ATTG	2	8	166444	166451	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012985	ACTA	2	8	167539	167546	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_012985	ACAT	2	8	167713	167720	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_012985	AAAT	2	8	167855	167862	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012985	ACAA	2	8	168056	168063	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_012985	TTAA	2	8	171354	171361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012985	TTCA	2	8	177791	177798	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_012985	AATT	2	8	180034	180041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012985	CAAA	2	8	180096	180103	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_012985	AACC	2	8	180135	180142	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_012985	ATTT	2	8	183175	183182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012985	AATA	2	8	185453	185460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012985	TCTA	2	8	187719	187726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_012985	AGGG	2	8	188280	188287	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012985	ATTA	2	8	194775	194782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012985	GTTA	2	8	197516	197523	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012985	AATT	2	8	197780	197787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012985	ACAA	2	8	199274	199281	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_012985	ATGA	2	8	201472	201479	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012985	ATTC	2	8	202096	202103	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_012985	AAAT	2	8	202333	202340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012985	TCAT	2	8	202497	202504	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_012985	TCTT	3	12	203324	203335	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_012985	TAAG	2	8	203607	203614	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012985	AAAT	2	8	205007	205014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012985	ATTT	2	8	205049	205056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012985	CCAA	2	8	205201	205208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_012985	TAAA	2	8	206581	206588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012985	AATA	2	8	206646	206653	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012985	CAAA	2	8	210644	210651	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_012985	CAAA	2	8	210730	210737	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_012985	ACCA	2	8	214348	214355	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_012985	TTAC	2	8	217407	217414	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_012985	ATGA	2	8	217580	217587	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012985	ATAC	2	8	217702	217709	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_012985	CTTA	2	8	223137	223144	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_012985	TTTC	2	8	225476	225483	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_012985	TTCT	2	8	226270	226277	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_012985	AAAT	2	8	234294	234301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012985	CTAA	2	8	234334	234341	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_012985	ATTT	3	12	234555	234566	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012985	TGAT	2	8	234595	234602	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012985	ATCT	2	8	234692	234699	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_012985	TAGT	2	8	234708	234715	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012985	TAAC	2	8	235198	235205	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_012985	GATT	2	8	235310	235317	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012985	GGCA	2	8	235543	235550	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_012985	AATG	2	8	235750	235757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012985	TCCT	2	8	235999	236006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_012985	AAAT	2	8	239416	239423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012985	AATC	2	8	239650	239657	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_012985	TCCA	2	8	242164	242171	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_012985	TCGA	2	8	246775	246782	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_012985	AAGG	2	8	246892	246899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012985	TTGC	2	8	247783	247790	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_012985	ATTT	2	8	256268	256275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012985	TAAC	2	8	256383	256390	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_012985	TTTC	2	8	257128	257135	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_012985	ATCA	2	8	258705	258712	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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