MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum) plasmid pHD5AT

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012752	A	8	8	862	869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012752	A	6	6	942	947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012752	T	7	7	1080	1086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012752	A	6	6	1093	1098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012752	A	7	7	1309	1315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012752	T	6	6	1374	1379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012752	A	6	6	1408	1413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012752	T	7	7	1504	1510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012752	A	6	6	1883	1888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012752	T	6	6	1944	1949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012752	A	6	6	1964	1969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012752	A	6	6	2030	2035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012752	A	7	7	2210	2216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012752	A	8	8	2299	2306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012752	A	7	7	3007	3013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012752	T	7	7	3055	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012752	T	7	7	5242	5248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012752	T	6	6	7387	7392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012752	A	7	7	7604	7610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012752	G	6	6	8306	8311	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012752	T	7	7	8501	8507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012752	T	6	6	8560	8565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012752	T	6	6	8577	8582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012752	T	6	6	8642	8647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012752	T	6	6	8669	8674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012752	T	6	6	8981	8986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012752	T	6	6	9188	9193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012752	T	6	6	9269	9274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012752	T	7	7	9486	9492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012752	T	6	6	9664	9669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012752	T	6	6	9844	9849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012752	T	6	6	10022	10027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012752	A	6	6	10047	10052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012752	T	6	6	10072	10077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012752	T	9	9	10089	10097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012752	T	6	6	10215	10220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012752	A	6	6	10428	10433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012752	T	7	7	10539	10545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012752	A	6	6	11504	11509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012752	A	6	6	11544	11549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012752	T	7	7	11756	11762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012752	A	6	6	11851	11856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012752	A	7	7	11877	11883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012752	T	8	8	11888	11895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012752	T	8	8	11942	11949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012752	A	6	6	12205	12210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012752	T	7	7	12236	12242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012752	A	7	7	12491	12497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012752	T	6	6	15501	15506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012752	T	7	7	15566	15572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012752	T	7	7	16524	16530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012752	A	8	8	16531	16538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012752	T	6	6	16689	16694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012752	T	6	6	16789	16794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012752	T	6	6	16960	16965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012752	T	7	7	16989	16995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012752	A	7	7	17090	17096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012752	A	7	7	17120	17126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012752	A	7	7	17149	17155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012752	T	6	6	17168	17173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012752	C	6	6	22645	22650	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_012752	T	6	6	22662	22667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012752	A	7	7	27500	27506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012752	T	6	6	33648	33653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012752	A	6	6	34068	34073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012752	A	6	6	34082	34087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012752	A	6	6	41835	41840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012752	A	6	6	44288	44293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012752	A	6	6	44843	44848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012752	A	7	7	47411	47417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012752	A	7	7	55243	55249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012752	T	6	6	55296	55301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012752	T	6	6	55321	55326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012752	T	7	7	55331	55337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012752	T	7	7	55381	55387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012752	A	6	6	55445	55450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012752	T	6	6	56010	56015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012752	A	8	8	56099	56106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012752	T	7	7	56185	56191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012752	T	6	6	56197	56202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012752	T	6	6	56395	56400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012752	T	7	7	56424	56430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012752	T	6	6	57614	57619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012752	A	7	7	58419	58425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012752	T	6	6	58513	58518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012752	T	6	6	58520	58525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012752	A	7	7	58560	58566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012752	A	6	6	58674	58679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012752	T	6	6	58818	58823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012752	A	6	6	58883	58888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012752	T	6	6	59002	59007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.