MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 1316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012751	AGAA	2	8	469	476	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012751	GTTT	2	8	567	574	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012751	CTTT	2	8	630	637	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_012751	TTTA	2	8	642	649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012751	CTTT	2	8	3863	3870	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012751	TGCT	2	8	3982	3989	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012751	GAAA	2	8	4528	4535	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012751	GAAA	2	8	5225	5232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012751	ACTT	2	8	6263	6270	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_012751	AATA	2	8	6446	6453	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012751	TATG	2	8	6602	6609	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012751	TCCC	2	8	13076	13083	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_012751	TTTA	2	8	13094	13101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012751	TTCG	2	8	13196	13203	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012751	ATTT	2	8	15061	15068	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012751	CTTA	2	8	15878	15885	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_012751	AAAT	2	8	15891	15898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012751	TTTA	2	8	16574	16581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012751	TAAA	2	8	17055	17062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012751	TGTC	2	8	19136	19143	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_012751	TCAA	2	8	20383	20390	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_012751	AATT	3	12	20395	20406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012751	ATTT	2	8	20459	20466	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012751	CCAA	2	8	25093	25100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012751	CATG	2	8	25111	25118	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012751	TTAA	2	8	25182	25189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012751	ATTC	2	8	25417	25424	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_012751	ATAA	2	8	25804	25811	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012751	TGAA	2	8	26171	26178	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012751	AAAG	2	8	43507	43514	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012751	TAAT	2	8	48781	48788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012751	TGAA	2	8	48797	48804	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012751	AATG	2	8	49410	49417	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012751	TAAA	2	8	56256	56263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012751	AAAT	2	8	56305	56312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012751	TTGT	2	8	57094	57101	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012751	CAGA	2	8	59284	59291	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_012751	GAAA	2	8	59378	59385	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012751	ACGT	2	8	61327	61334	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012751	ATCA	2	8	76408	76415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_012751	AATG	2	8	76546	76553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012751	ACTG	2	8	77660	77667	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_012751	CAGT	2	8	77675	77682	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_012751	ATTT	2	8	86370	86377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012751	TAGA	2	8	89376	89383	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012751	TAAA	2	8	95431	95438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012751	GATG	2	8	99184	99191	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012751	ATTT	2	8	99888	99895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012751	TCAA	2	8	99909	99916	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_012751	TAAA	2	8	100074	100081	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012751	TGAT	2	8	100538	100545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012751	GATC	2	8	106813	106820	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012751	AAAT	2	8	107176	107183	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012751	ATGA	2	8	107214	107221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012751	CAAT	2	8	108063	108070	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_012751	TGTT	2	8	108153	108160	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012751	TGAC	2	8	110025	110032	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_012751	TTTG	2	8	114556	114563	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012751	CAGA	2	8	114816	114823	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_012751	ATCA	2	8	114860	114867	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_012751	ATCA	2	8	114937	114944	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_012751	AAGA	2	8	114956	114963	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012751	AGCT	2	8	115392	115399	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_012751	ATTA	3	12	116420	116431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012751	ATTT	2	8	120066	120073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012751	TCAT	2	8	120077	120084	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_012751	AAAT	2	8	121983	121990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012751	AGTA	2	8	122016	122023	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012751	AAGT	2	8	122037	122044	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012751	ATTT	2	8	122108	122115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012751	AACG	2	8	122582	122589	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_012751	ACAA	2	8	122723	122730	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_012751	TAAA	2	8	122751	122758	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012751	TTTA	2	8	127296	127303	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012751	ATTT	2	8	130714	130721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012751	CACT	2	8	141080	141087	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_012751	TTCG	2	8	143404	143411	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_012751	GTTT	2	8	143911	143918	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012751	TTTA	2	8	145020	145027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012751	ATTT	2	8	151564	151571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012751	TTAA	7	28	154995	155022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012751	ATCA	2	8	155769	155776	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_012751	GTGA	2	8	159301	159308	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012751	TTTG	2	8	166789	166796	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012751	ATTT	2	8	166883	166890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012751	ATTC	2	8	168398	168405	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_012751	CCTC	2	8	170748	170755	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
88	NC_012751	TGTC	2	8	172144	172151	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_012751	AAAT	2	8	172173	172180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012751	TTAA	2	8	172208	172215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012751	GTAT	2	8	172297	172304	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012751	ATCA	2	8	178905	178912	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_012751	AAAT	2	8	179038	179045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012751	TAAA	2	8	179255	179262	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012751	ATGA	2	8	181271	181278	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012751	TTTA	2	8	183191	183198	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012751	TGAC	2	8	185592	185599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_012751	ATAA	2	8	185673	185680	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012751	AAGC	2	8	185726	185733	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_012751	AACC	2	8	185960	185967	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_012751	GATG	2	8	186912	186919	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012751	AATA	2	8	187480	187487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012751	AAAG	2	8	187803	187810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012751	AGTG	2	8	188208	188215	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012751	ATCT	2	8	193728	193735	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012751	TACT	2	8	194876	194883	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_012751	AAAC	2	8	195146	195153	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_012751	TTGC	2	8	195227	195234	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_012751	AATC	2	8	195275	195282	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_012751	TTAT	2	8	196626	196633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012751	TAAT	2	8	197727	197734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012751	TTAG	2	8	202938	202945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012751	TATT	2	8	203496	203503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012751	ATTG	2	8	203629	203636	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012751	GATT	2	8	210957	210964	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012751	CTAT	2	8	211984	211991	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_012751	AGCT	2	8	212050	212057	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_012751	GTTT	2	8	212064	212071	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012751	ATGA	2	8	217765	217772	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012751	TCGT	2	8	220038	220045	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_012751	ACTC	2	8	221528	221535	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_012751	ATTT	2	8	222803	222810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012751	TCAA	2	8	224307	224314	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_012751	TAAA	2	8	225436	225443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012751	ATTC	2	8	230435	230442	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_012751	CTTT	2	8	230547	230554	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_012751	GTTT	2	8	233006	233013	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012751	ATTT	2	8	234211	234218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012751	ATTT	2	8	241153	241160	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012751	AAAT	2	8	243357	243364	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012751	TAAA	2	8	244396	244403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012751	TTGA	2	8	246391	246398	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012751	TTCA	2	8	246430	246437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_012751	TAAA	2	8	251460	251467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012751	TTTA	2	8	252022	252029	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012751	ATTA	2	8	252047	252054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012751	TTAA	2	8	252056	252063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012751	ATTT	2	8	253816	253823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012751	AAAT	2	8	253857	253864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012751	GGGA	2	8	253958	253965	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012751	TTCA	2	8	254009	254016	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_012751	TACA	2	8	254281	254288	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_012751	TTTC	2	8	255562	255569	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_012751	TCAA	2	8	259012	259019	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_012751	GACA	2	8	259078	259085	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_012751	TTTC	2	8	261753	261760	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_012751	GAAA	2	8	261798	261805	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012751	CCTT	2	8	261857	261864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_012751	GAAA	2	8	262013	262020	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012751	TAGC	2	8	262810	262817	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_012751	TGCC	2	8	262964	262971	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_012751	CATG	2	8	263052	263059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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