MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 4613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012751	ATT	2	6	556	561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012751	ATT	2	6	698	703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012751	TAA	2	6	768	773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012751	ATT	2	6	799	804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012751	TTA	2	6	1761	1766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012751	AAT	2	6	3214	3219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012751	TGT	2	6	3311	3316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012751	TGA	2	6	3321	3326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012751	TAT	2	6	3350	3355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012751	CTA	2	6	3578	3583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012751	TAA	2	6	3739	3744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012751	CCT	2	6	3758	3763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_012751	CTG	2	6	3800	3805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012751	ATG	2	6	4017	4022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012751	ATA	2	6	4179	4184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012751	TTA	2	6	4481	4486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012751	GCT	2	6	4513	4518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012751	CCT	2	6	5020	5025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_012751	CAT	2	6	5054	5059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012751	TTC	2	6	5121	5126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012751	ATT	2	6	5170	5175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012751	TAT	2	6	6176	6181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012751	ACA	2	6	6201	6206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012751	AAT	2	6	6234	6239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012751	TAC	2	6	6276	6281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012751	ATT	3	9	6386	6394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012751	ATT	2	6	6472	6477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012751	AAT	2	6	6478	6483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012751	TTA	2	6	6500	6505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012751	TAA	2	6	6507	6512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012751	ATT	2	6	6567	6572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012751	ATA	2	6	6577	6582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012751	ATA	2	6	6624	6629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012751	CAA	2	6	6686	6691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012751	ATG	2	6	9503	9508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012751	TAA	2	6	9606	9611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012751	ATG	2	6	9628	9633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012751	TGA	2	6	12818	12823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012751	TTG	2	6	12926	12931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012751	TCC	2	6	13162	13167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_012751	TGA	2	6	13247	13252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012751	GAT	2	6	13255	13260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012751	TTA	2	6	15044	15049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012751	CAG	2	6	15160	15165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012751	TGG	2	6	15197	15202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012751	ACA	2	6	15204	15209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012751	GTT	2	6	15225	15230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012751	TAA	2	6	15856	15861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012751	ATG	2	6	16035	16040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012751	AAG	2	6	16073	16078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012751	CAT	2	6	16102	16107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012751	TAT	2	6	16113	16118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012751	CGG	2	6	16145	16150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012751	GGA	2	6	16207	16212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012751	TAA	2	6	16341	16346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012751	ACG	2	6	16359	16364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012751	ATT	2	6	16414	16419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012751	GGA	2	6	16543	16548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012751	CAG	2	6	16556	16561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012751	AGA	2	6	16563	16568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012751	ATT	2	6	16684	16689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012751	CAG	2	6	16742	16747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012751	TGG	2	6	17006	17011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012751	TCA	2	6	17140	17145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012751	TGA	2	6	19122	19127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012751	AGT	2	6	19157	19162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012751	ACC	2	6	19183	19188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_012751	TTA	2	6	19262	19267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012751	TGA	2	6	20280	20285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012751	TTG	2	6	20354	20359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012751	CAA	2	6	20361	20366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012751	ATC	2	6	20367	20372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012751	TTA	2	6	20489	20494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012751	TGA	2	6	22845	22850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012751	CTT	2	6	24844	24849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012751	GCG	2	6	24894	24899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012751	CAT	2	6	25075	25080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012751	CTG	2	6	25192	25197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012751	TGA	2	6	25198	25203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012751	GGC	2	6	25274	25279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012751	GAC	2	6	25552	25557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012751	TCT	2	6	25623	25628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012751	TCA	2	6	25650	25655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_012751	TTC	2	6	25817	25822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012751	TCA	2	6	25827	25832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012751	GAG	2	6	26068	26073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012751	AGT	2	6	26115	26120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012751	CGT	2	6	26127	26132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_012751	GAT	2	6	26232	26237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012751	ATT	2	6	26251	26256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012751	ATA	2	6	26398	26403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012751	TAG	2	6	30033	30038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012751	GAA	2	6	42578	42583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012751	TGA	2	6	43554	43559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012751	GAT	2	6	43643	43648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012751	TGC	2	6	43688	43693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012751	ACA	2	6	43708	43713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012751	AAG	2	6	49365	49370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012751	AGG	2	6	50472	50477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012751	TTA	2	6	52216	52221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012751	ACT	2	6	57080	57085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012751	TGG	2	6	59233	59238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012751	TCC	2	6	59247	59252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_012751	ATC	2	6	59469	59474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012751	AGC	2	6	59514	59519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012751	ATA	2	6	60804	60809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012751	TAT	2	6	71515	71520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012751	TCA	2	6	71586	71591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012751	AAT	2	6	71600	71605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012751	ATT	3	9	76362	76370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012751	TGT	2	6	76443	76448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012751	TAA	2	6	76512	76517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012751	AGA	2	6	78524	78529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012751	ATT	2	6	78634	78639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012751	TTA	2	6	82335	82340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012751	TTA	2	6	86885	86890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012751	AAT	2	6	89268	89273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012751	ATT	2	6	89290	89295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012751	ATC	2	6	89509	89514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012751	AGA	2	6	90204	90209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012751	AGT	2	6	91109	91114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012751	CTA	2	6	91131	91136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012751	TTA	2	6	91143	91148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012751	GAT	2	6	94963	94968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012751	ATG	2	6	94996	95001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012751	TAA	2	6	96704	96709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012751	CAA	2	6	96752	96757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_012751	ATT	2	6	97134	97139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012751	TCA	2	6	98687	98692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012751	TGA	2	6	99861	99866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012751	ATT	2	6	100021	100026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012751	ATC	2	6	100036	100041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_012751	TCA	2	6	100159	100164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012751	AGT	2	6	100176	100181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012751	CTT	2	6	100413	100418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_012751	CTG	2	6	100445	100450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_012751	TGA	2	6	100560	100565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012751	ATT	2	6	101828	101833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012751	CAT	2	6	102068	102073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_012751	TGG	2	6	106852	106857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_012751	CAT	2	6	186450	186455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_012751	ATC	2	6	186712	186717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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276	NC_012751	AAT	2	6	186876	186881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_012751	CTG	2	6	186903	186908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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293	NC_012751	TGT	2	6	188185	188190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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