MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 9733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4003	NC_012751	GC	3	6	966793	966798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_012751	A	6	6	966830	966835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_012751	AATC	2	8	966897	966904	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4006	NC_012751	GCA	2	6	966953	966958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_012751	A	6	6	966966	966971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_012751	CGC	2	6	967100	967105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4009	NC_012751	TGGC	2	8	967125	967132	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4010	NC_012751	AAT	2	6	967167	967172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_012751	CGT	2	6	967184	967189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_012751	CA	3	6	967316	967321	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4013	NC_012751	AGT	2	6	967323	967328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_012751	TTA	2	6	967371	967376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_012751	A	6	6	967442	967447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_012751	ATCAA	2	10	967459	967468	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4017	NC_012751	ATT	2	6	967550	967555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_012751	T	6	6	967661	967666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_012751	TTTA	2	8	967725	967732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_012751	GCC	2	6	967743	967748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_012751	T	7	7	967854	967860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4024	NC_012751	TGA	2	6	968027	968032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4032	NC_012751	AG	3	6	968293	968298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_012751	TAAT	2	8	968308	968315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4043	NC_012751	TC	3	6	971130	971135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4044	NC_012751	G	6	6	971138	971143	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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4063	NC_012751	CTC	2	6	977913	977918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4072	NC_012751	T	6	6	982310	982315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_012751	GACT	2	8	982351	982358	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4099	NC_012751	TGTC	2	8	986666	986673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4100	NC_012751	T	6	6	988020	988025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4117	NC_012751	GA	3	6	988698	988703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_012751	TGA	2	6	988781	988786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_012751	GAA	2	6	988791	988796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_012751	TG	3	6	988831	988836	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_012751	GAC	2	6	988846	988851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_012751	GAG	2	6	988858	988863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_012751	GGCA	2	8	988913	988920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4124	NC_012751	TCC	2	6	988947	988952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4131	NC_012751	A	7	7	990119	990125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_012751	TAC	2	6	990166	990171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_012751	C	6	6	990232	990237	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4134	NC_012751	AC	3	6	990252	990257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4135	NC_012751	TTC	2	6	990260	990265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4137	NC_012751	GGC	2	6	990762	990767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4138	NC_012751	GT	3	6	990770	990775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4257	NC_012751	CTT	2	6	1005675	1005680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4264	NC_012751	AATA	2	8	1006031	1006038	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_012751	CAT	2	6	1006136	1006141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4266	NC_012751	GAAC	2	8	1006168	1006175	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4267	NC_012751	CAT	2	6	1006280	1006285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4268	NC_012751	GGAT	2	8	1006306	1006313	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4269	NC_012751	CG	3	6	1006411	1006416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4405	NC_012751	TCA	2	6	1020845	1020850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4406	NC_012751	TCA	2	6	1020871	1020876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4407	NC_012751	GATA	2	8	1020919	1020926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4408	NC_012751	CAGA	2	8	1020929	1020936	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4409	NC_012751	A	6	6	1020936	1020941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4410	NC_012751	ACC	2	6	1021839	1021844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4411	NC_012751	GTA	2	6	1021850	1021855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4412	NC_012751	TAC	2	6	1021899	1021904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4413	NC_012751	ATG	2	6	1021905	1021910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4414	NC_012751	T	6	6	1022008	1022013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4415	NC_012751	AG	3	6	1022050	1022055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4416	NC_012751	A	6	6	1022059	1022064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4417	NC_012751	A	6	6	1022068	1022073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4418	NC_012751	CGT	2	6	1022146	1022151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4419	NC_012751	CTGTT	2	10	1022415	1022424	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4420	NC_012751	TTCA	2	8	1022510	1022517	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4421	NC_012751	CAT	2	6	1022548	1022553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4423	NC_012751	CGC	2	6	1022773	1022778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4424	NC_012751	ATC	2	6	1022783	1022788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4425	NC_012751	CCG	2	6	1022841	1022846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4426	NC_012751	AC	3	6	1023013	1023018	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4427	NC_012751	ATG	2	6	1023028	1023033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4428	NC_012751	CAT	2	6	1023086	1023091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4429	NC_012751	TAA	2	6	1023093	1023098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4430	NC_012751	CCA	2	6	1023099	1023104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4431	NC_012751	TAG	3	9	1023118	1023126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4432	NC_012751	TAG	2	6	1023131	1023136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4433	NC_012751	TCTT	2	8	1023137	1023144	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4434	NC_012751	TTG	2	6	1023197	1023202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4435	NC_012751	T	7	7	1023206	1023212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4436	NC_012751	CAT	2	6	1023263	1023268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4437	NC_012751	A	6	6	1023332	1023337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4438	NC_012751	TA	3	6	1023338	1023343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4439	NC_012751	T	7	7	1023359	1023365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4440	NC_012751	TTCTAT	2	12	1023372	1023383	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4441	NC_012751	T	7	7	1023427	1023433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4442	NC_012751	GAAAA	2	10	1023943	1023952	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4443	NC_012751	TAAA	2	8	1024055	1024062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4444	NC_012751	TGA	2	6	1024083	1024088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4445	NC_012751	AC	3	6	1024156	1024161	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4446	NC_012751	GCA	2	6	1024168	1024173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4447	NC_012751	AGT	2	6	1024185	1024190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4448	NC_012751	TC	3	6	1024249	1024254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4449	NC_012751	GATT	2	8	1024283	1024290	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4450	NC_012751	AACAGG	2	12	1025649	1025660	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4451	NC_012751	AAG	2	6	1025669	1025674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4452	NC_012751	TTG	2	6	1026195	1026200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4453	NC_012751	T	9	9	1026228	1026236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4454	NC_012751	ATT	2	6	1026400	1026405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4455	NC_012751	AGG	2	6	1026408	1026413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4457	NC_012751	ACA	2	6	1026691	1026696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4460	NC_012751	A	6	6	1027422	1027427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4461	NC_012751	GTT	2	6	1027498	1027503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4463	NC_012751	TTC	2	6	1027933	1027938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4465	NC_012751	ACA	2	6	1028200	1028205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4466	NC_012751	A	7	7	1028211	1028217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4467	NC_012751	GCG	2	6	1028227	1028232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4468	NC_012751	CAA	2	6	1028281	1028286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4470	NC_012751	TA	3	6	1028368	1028373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4471	NC_012751	A	7	7	1028971	1028977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4472	NC_012751	TGG	2	6	1029033	1029038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4480	NC_012751	CGC	2	6	1030631	1030636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4481	NC_012751	AG	4	8	1030654	1030661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4482	NC_012751	CAG	2	6	1030684	1030689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4483	NC_012751	AGC	2	6	1030761	1030766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4484	NC_012751	GGT	2	6	1030795	1030800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4485	NC_012751	GGA	2	6	1030901	1030906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4488	NC_012751	A	6	6	1031066	1031071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4489	NC_012751	A	6	6	1033218	1033223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4492	NC_012751	T	6	6	1034920	1034925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4493	NC_012751	T	6	6	1034941	1034946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4494	NC_012751	CAC	2	6	1034947	1034952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4496	NC_012751	GCTT	2	8	1035008	1035015	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4497	NC_012751	AGT	3	9	1035047	1035055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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