MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 9733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012751	CTT	2	6	262084	262089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_012751	CTT	2	6	262096	262101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_012751	CTT	2	6	262108	262113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_012751	CTT	2	6	262120	262125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_012751	CTT	2	6	262144	262149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_012751	TTC	2	6	262169	262174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_012751	TCA	2	6	262183	262188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_012751	A	6	6	262223	262228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_012751	CTT	2	6	262252	262257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_012751	ATA	2	6	262265	262270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_012751	CAA	2	6	262271	262276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_012751	ATAAG	2	10	262323	262332	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_012751	CAT	2	6	262343	262348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_012751	T	6	6	262366	262371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_012751	TCT	2	6	262413	262418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_012751	ACAGG	2	10	262546	262555	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1017	NC_012751	AAGGT	2	10	262564	262573	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_012751	TGC	2	6	262596	262601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_012751	T	6	6	262619	262624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_012751	CAT	2	6	262637	262642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_012751	TCG	2	6	262647	262652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_012751	T	6	6	262760	262765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_012751	TAGC	2	8	262810	262817	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_012751	AG	3	6	262894	262899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_012751	GCT	2	6	262954	262959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_012751	TGCC	2	8	262964	262971	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_012751	AAT	2	6	262981	262986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_012751	CATG	2	8	263052	263059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1029	NC_012751	TCT	2	6	263106	263111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_012751	CCA	3	9	263147	263155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_012751	TAT	2	6	263270	263275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_012751	T	6	6	263275	263280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_012751	CTT	2	6	263299	263304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_012751	CTGT	2	8	263348	263355	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_012751	AAC	2	6	263388	263393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_012751	AAG	2	6	263445	263450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_012751	TCCT	2	8	263456	263463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_012751	T	6	6	263482	263487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_012751	CT	3	6	263506	263511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_012751	TTC	2	6	263552	263557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_012751	ACA	2	6	263574	263579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_012751	ATC	2	6	263582	263587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_012751	ACT	2	6	263598	263603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_012751	AGT	2	6	263691	263696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_012751	CCT	2	6	263709	263714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_012751	TA	3	6	263738	263743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_012751	T	6	6	263777	263782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_012751	TTTC	2	8	263790	263797	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_012751	TGT	2	6	263839	263844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_012751	T	6	6	263914	263919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_012751	T	7	7	264059	264065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_012751	T	6	6	264072	264077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_012751	GTT	2	6	264117	264122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_012751	TAA	2	6	264128	264133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_012751	ATTA	2	8	264164	264171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_012751	GT	3	6	264192	264197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_012751	AGA	2	6	264234	264239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_012751	TCA	2	6	264256	264261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_012751	CTTT	2	8	264283	264290	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_012751	TA	3	6	264313	264318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_012751	ATT	2	6	264332	264337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_012751	GTT	3	9	264382	264390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_012751	TTA	2	6	264403	264408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_012751	AGTAA	2	10	264505	264514	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_012751	CCT	2	6	264675	264680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_012751	GAAC	2	8	264710	264717	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_012751	CTT	2	6	264721	264726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_012751	GAC	2	6	264794	264799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_012751	TTAG	2	8	264877	264884	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_012751	CTC	2	6	264916	264921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_012751	TGAA	2	8	265727	265734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_012751	TCGAA	2	10	265764	265773	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1073	NC_012751	AAAT	2	8	266588	266595	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_012751	CA	3	6	266615	266620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_012751	GAA	2	6	268836	268841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_012751	A	6	6	268840	268845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_012751	GTC	2	6	268847	268852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_012751	GGT	2	6	268868	268873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_012751	AATAAA	2	12	269709	269720	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_012751	TAT	2	6	269734	269739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_012751	ATC	2	6	270311	270316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_012751	A	6	6	270337	270342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_012751	TAAA	2	8	270352	270359	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_012751	A	7	7	275325	275331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_012751	A	6	6	280972	280977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_012751	T	6	6	280978	280983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_012751	TTA	2	6	280986	280991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_012751	CAA	2	6	281022	281027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_012751	AT	3	6	281028	281033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_012751	A	6	6	281066	281071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_012751	T	6	6	281098	281103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_012751	TTC	2	6	281107	281112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_012751	ATTT	2	8	281132	281139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_012751	ATTA	2	8	281145	281152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_012751	CTTAA	2	10	281155	281164	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1096	NC_012751	A	6	6	281163	281168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_012751	AAT	2	6	281186	281191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_012751	TTA	2	6	281197	281202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_012751	A	6	6	281213	281218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_012751	AAT	2	6	281281	281286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_012751	A	6	6	281288	281293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_012751	ATT	2	6	281299	281304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_012751	A	7	7	281357	281363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_012751	TCAA	2	8	281365	281372	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_012751	GTT	2	6	281385	281390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_012751	TACATT	2	12	281397	281408	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1107	NC_012751	ATTT	2	8	281413	281420	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_012751	ATG	2	6	281423	281428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_012751	T	7	7	281462	281468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_012751	AAAC	2	8	282822	282829	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_012751	TG	3	6	282859	282864	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_012751	GTTT	2	8	282878	282885	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_012751	CTG	2	6	285096	285101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_012751	TCT	2	6	285132	285137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_012751	GAT	2	6	285184	285189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_012751	GTT	2	6	285823	285828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_012751	CAG	2	6	286030	286035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_012751	TGCT	2	8	286126	286133	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_012751	TTC	2	6	286919	286924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_012751	ATT	2	6	286943	286948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_012751	TGA	2	6	288024	288029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_012751	GGA	2	6	288043	288048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_012751	TC	3	6	288111	288116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_012751	AATG	2	8	288120	288127	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_012751	ATA	2	6	288159	288164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_012751	GCAA	2	8	288202	288209	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1127	NC_012751	TCT	2	6	288255	288260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_012751	ACTG	2	8	288266	288273	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_012751	T	6	6	288308	288313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_012751	CTT	2	6	288358	288363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_012751	ATC	2	6	288429	288434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_012751	GCT	2	6	288449	288454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_012751	ATG	2	6	288572	288577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_012751	TGT	2	6	288625	288630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_012751	TCA	2	6	288720	288725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1137	NC_012751	GCC	3	9	288791	288799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1411	NC_012751	AAATT	2	10	337011	337020	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_012751	A	6	6	337023	337028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1452	NC_012751	T	6	6	347316	347321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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