MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis B/TZ1A828/OT chromosome

Total Repeats: 361

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012687	TC	3	6	2258	2263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012687	GA	3	6	7586	7591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012687	TA	3	6	11837	11842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012687	TA	3	6	13927	13932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012687	TA	4	8	14151	14158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012687	AG	3	6	18103	18108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012687	GA	3	6	18116	18121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012687	CT	3	6	19038	19043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012687	AG	3	6	21104	21109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012687	GA	3	6	21262	21267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012687	AG	3	6	21779	21784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012687	CT	3	6	21848	21853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012687	GA	3	6	27101	27106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012687	CT	3	6	27108	27113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012687	TC	3	6	28476	28481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_012687	AG	3	6	28559	28564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012687	GA	3	6	36972	36977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012687	AT	3	6	37074	37079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012687	CT	3	6	39341	39346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012687	CT	3	6	40712	40717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012687	AG	3	6	42838	42843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012687	TC	3	6	44396	44401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_012687	AG	3	6	48631	48636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012687	TG	4	8	51978	51985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012687	GA	3	6	56079	56084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012687	GA	3	6	61295	61300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012687	AG	4	8	65314	65321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012687	CT	3	6	68525	68530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_012687	TA	3	6	69644	69649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012687	CT	3	6	72380	72385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_012687	TA	3	6	85736	85741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012687	GA	3	6	91089	91094	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012687	CT	3	6	93439	93444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012687	GA	3	6	93925	93930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012687	GA	3	6	93967	93972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012687	TC	3	6	100463	100468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012687	AT	3	6	100514	100519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012687	TA	3	6	107190	107195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012687	TG	3	6	116432	116437	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012687	AG	4	8	119019	119026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012687	GA	3	6	120841	120846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012687	TG	3	6	121100	121105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012687	CT	3	6	121725	121730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_012687	TC	3	6	122637	122642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012687	GA	3	6	122967	122972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012687	TA	3	6	123075	123080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012687	GT	3	6	124065	124070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012687	CT	3	6	128599	128604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012687	TC	3	6	130921	130926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012687	AG	3	6	130998	131003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012687	AG	3	6	131023	131028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012687	TG	3	6	133830	133835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012687	AG	3	6	138669	138674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012687	GA	3	6	138732	138737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012687	AT	3	6	142964	142969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012687	AG	3	6	157770	157775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012687	TC	3	6	172238	172243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_012687	AG	3	6	172370	172375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012687	CT	3	6	172388	172393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012687	TG	3	6	178877	178882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012687	CT	3	6	183603	183608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012687	GA	4	8	183645	183652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012687	GA	3	6	183849	183854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012687	TA	3	6	184092	184097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012687	GA	3	6	184205	184210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012687	GA	3	6	184308	184313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012687	TC	3	6	184715	184720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_012687	GA	3	6	184947	184952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012687	AT	3	6	194362	194367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012687	AT	3	6	197513	197518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012687	AG	3	6	198809	198814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012687	TC	3	6	201799	201804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_012687	AG	3	6	203631	203636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012687	CT	3	6	203643	203648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_012687	CT	3	6	205557	205562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012687	GA	4	8	208616	208623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012687	CT	4	8	208664	208671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_012687	AG	4	8	219934	219941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012687	TA	3	6	221488	221493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012687	CT	3	6	223129	223134	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_012687	TC	3	6	226130	226135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_012687	AG	3	6	226161	226166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012687	TC	3	6	240361	240366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_012687	AG	3	6	240387	240392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012687	CA	3	6	245313	245318	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_012687	GT	3	6	245530	245535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012687	GA	3	6	252398	252403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012687	TG	3	6	252508	252513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012687	AG	3	6	253310	253315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012687	AG	3	6	254319	254324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012687	TA	3	6	256119	256124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012687	CA	3	6	257222	257227	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_012687	AG	3	6	258398	258403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012687	TC	3	6	258424	258429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_012687	AG	3	6	259902	259907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012687	TA	3	6	266265	266270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012687	CA	3	6	268072	268077	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_012687	TC	3	6	269972	269977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012687	TA	3	6	275525	275530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012687	AT	4	8	286085	286092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012687	CT	3	6	286937	286942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_012687	TC	4	8	287028	287035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_012687	TC	3	6	288719	288724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_012687	TC	3	6	288776	288781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_012687	CT	3	6	289249	289254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_012687	AT	3	6	301262	301267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012687	CA	3	6	303591	303596	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_012687	GA	3	6	308322	308327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012687	AG	3	6	317528	317533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012687	CT	3	6	349474	349479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_012687	CT	3	6	352545	352550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_012687	TC	3	6	356771	356776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_012687	TC	3	6	360601	360606	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_012687	CT	3	6	360687	360692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_012687	AC	3	6	364019	364024	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_012687	GA	3	6	365929	365934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012687	TC	3	6	366007	366012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_012687	TA	3	6	366208	366213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012687	GC	3	6	367737	367742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_012687	TC	3	6	368041	368046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_012687	TA	3	6	368111	368116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012687	AC	3	6	368848	368853	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_012687	CT	4	8	369020	369027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_012687	CT	3	6	369253	369258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012687	CA	3	6	369262	369267	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_012687	GT	3	6	369580	369585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012687	CT	4	8	383347	383354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_012687	GA	3	6	388054	388059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012687	CG	3	6	393185	393190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_012687	CA	3	6	394235	394240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_012687	TC	3	6	396782	396787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_012687	CT	3	6	397272	397277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_012687	GA	3	6	397402	397407	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012687	GA	3	6	397533	397538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012687	CT	3	6	411630	411635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_012687	CT	3	6	412617	412622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_012687	TC	3	6	429351	429356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_012687	AT	3	6	429403	429408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012687	CT	3	6	429894	429899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_012687	AG	4	8	430105	430112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012687	CT	3	6	431344	431349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_012687	CT	3	6	432367	432372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_012687	AG	3	6	432714	432719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012687	GA	3	6	434409	434414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012687	AC	3	6	438407	438412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_012687	CT	3	6	442678	442683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_012687	AC	3	6	442716	442721	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_012687	CA	3	6	445185	445190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_012687	CT	3	6	446589	446594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_012687	TC	3	6	455869	455874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_012687	AG	3	6	462011	462016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012687	TC	3	6	468549	468554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_012687	AT	3	6	468618	468623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012687	GA	4	8	469992	469999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.