MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 chromosome

Total Repeats: 1290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012658	GGTAA	2	10	9645	9654	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012658	TCGTG	2	10	10436	10445	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_012658	TAAGT	2	10	12174	12183	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012658	AAGCT	2	10	12664	12673	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_012658	ATTAT	2	10	22408	22417	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012658	TTTAA	2	10	23792	23801	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012658	ATTAA	2	10	23812	23821	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012658	TATTT	2	10	23884	23893	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012658	AAATG	2	10	24392	24401	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012658	ATAAG	2	10	25851	25860	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012658	TAAAT	2	10	27977	27986	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012658	TATTT	2	10	28215	28224	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012658	TATAA	2	10	28297	28306	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012658	ATATT	2	10	31522	31531	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012658	AATAA	2	10	31580	31589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012658	TAATA	2	10	35132	35141	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012658	ATAAA	2	10	35614	35623	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012658	GGTAA	2	10	42686	42695	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012658	TCGTG	2	10	43477	43486	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_012658	TAAGT	2	10	45215	45224	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012658	AAGCT	2	10	45705	45714	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_012658	TAATT	2	10	48354	48363	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012658	GGTAA	2	10	49278	49287	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012658	TCGTG	2	10	50069	50078	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012658	TAAGT	2	10	51807	51816	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012658	AAGCT	2	10	52297	52306	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_012658	AAAAT	2	10	53658	53667	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012658	TTATA	2	10	54284	54293	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012658	GGTAA	2	10	57270	57279	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012658	TCGTG	2	10	58061	58070	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_012658	TAAGT	2	10	59799	59808	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012658	AAGCT	2	10	60289	60298	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_012658	TGATT	2	10	62039	62048	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012658	TTATA	2	10	63433	63442	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012658	GGTAA	2	10	64328	64337	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012658	TCGTG	2	10	65119	65128	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_012658	TAAGT	2	10	66859	66868	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012658	AAGCT	2	10	67349	67358	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_012658	ATTAT	2	10	70012	70021	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012658	GGTAA	2	10	70664	70673	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012658	TCGTG	2	10	71455	71464	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_012658	TAAGT	2	10	73193	73202	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012658	AAGCT	2	10	73683	73692	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_012658	AAAAT	2	10	75044	75053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012658	TTGAA	2	10	76451	76460	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012658	AAATT	2	10	87634	87643	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012658	ATTTA	2	10	89285	89294	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012658	TACAA	2	10	89543	89552	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_012658	TTTAA	2	10	89950	89959	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012658	TAAAT	2	10	92305	92314	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012658	TATAA	2	10	93400	93409	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012658	ATTTT	2	10	94469	94478	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012658	TAATA	2	10	94944	94953	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012658	ATTCT	2	10	97959	97968	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_012658	GTTAT	2	10	117332	117341	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012658	TAAAA	2	10	120186	120195	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012658	ATTTT	2	10	138914	138923	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012658	TTTAA	2	10	140406	140415	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012658	ACTTA	2	10	151768	151777	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_012658	ATAAA	2	10	162820	162829	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012658	TAATA	2	10	170772	170781	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012658	ATATA	2	10	173290	173299	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012658	TAATA	2	10	179252	179261	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012658	ATTTA	2	10	179380	179389	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012658	AAATA	2	10	182387	182396	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012658	ATAAA	2	10	182400	182409	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012658	ATTAT	2	10	182423	182432	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012658	TAATT	2	10	184221	184230	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012658	GTCTA	2	10	193149	193158	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_012658	TATTT	2	10	193269	193278	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012658	AAATA	2	10	197202	197211	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012658	TAATT	2	10	209777	209786	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012658	TAAAA	2	10	224031	224040	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012658	TAAAA	2	10	224103	224112	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012658	AAATT	2	10	226937	226946	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012658	ATTAT	2	10	229456	229465	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012658	ATTTA	2	10	229898	229907	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012658	TAATT	2	10	234001	234010	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012658	TTTTG	2	10	238080	238089	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012658	ATTAT	2	10	238156	238165	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012658	ATTAT	2	10	240465	240474	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012658	TAAAT	2	10	244983	244992	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012658	ATTTT	2	10	251447	251456	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012658	TAATT	2	10	264528	264537	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012658	GGTTT	2	10	265679	265688	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012658	ATTAA	2	10	265725	265734	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012658	TAAAA	2	10	269538	269547	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012658	TTTAA	2	10	273796	273805	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012658	ATTTT	2	10	277126	277135	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012658	TATAT	2	10	277589	277598	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012658	GAAAA	2	10	278395	278404	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012658	TATAA	2	10	278502	278511	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012658	AAAAT	2	10	279870	279879	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012658	TGCAA	2	10	280499	280508	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_012658	TTAAT	2	10	281121	281130	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012658	AATTA	2	10	284078	284087	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012658	TTTTA	2	10	286170	286179	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012658	TTTTG	2	10	287148	287157	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012658	AAAAC	2	10	294662	294671	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_012658	AACTA	2	10	296380	296389	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_012658	AAAAT	2	10	296493	296502	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012658	AATAA	2	10	296503	296512	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012658	TATAA	2	10	297439	297448	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012658	CTTAT	2	10	301577	301586	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_012658	ACTTT	2	10	301852	301861	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_012658	AATTA	2	10	303110	303119	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012658	TAGAT	2	10	307772	307781	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012658	AATTT	2	10	313130	313139	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012658	TATTT	2	10	313531	313540	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012658	AATAA	2	10	318954	318963	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012658	TAACT	2	10	326315	326324	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_012658	AAAAT	2	10	326573	326582	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012658	GTAAA	2	10	328053	328062	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012658	ATATA	2	10	328827	328836	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012658	ATATA	2	10	341641	341650	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012658	ATTAG	2	10	343669	343678	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012658	ATAAA	2	10	343800	343809	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012658	AAAAG	2	10	348957	348966	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012658	ATAAA	2	10	350200	350209	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012658	ATATA	2	10	350219	350228	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012658	TTATT	2	10	351442	351451	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012658	ATTTT	2	10	359586	359595	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012658	TATTT	2	10	368465	368474	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012658	ATTAT	2	10	368514	368523	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012658	ATAGA	2	10	370459	370468	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012658	ACTAT	2	10	370478	370487	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_012658	TATGA	2	10	374169	374178	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012658	TTATT	2	10	374385	374394	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012658	TTTTA	2	10	374504	374513	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012658	TTTTA	2	10	375667	375676	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012658	TCAAT	2	10	377114	377123	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_012658	ATATA	2	10	377203	377212	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012658	AATAA	2	10	379270	379279	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012658	ATTTA	2	10	381043	381052	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012658	AATTA	2	10	381089	381098	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012658	AAACA	2	10	385839	385848	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_012658	AATTT	2	10	391880	391889	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012658	TTTAA	2	10	393898	393907	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012658	CAGTT	2	10	396703	396712	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_012658	AAATA	2	10	396769	396778	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012658	ATATA	2	10	399836	399845	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012658	AATTA	2	10	401907	401916	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012658	TTAAT	2	10	407165	407174	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012658	AAAAT	2	10	410208	410217	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012658	TTTAG	2	10	410238	410247	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012658	TAAAA	2	10	413094	413103	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012658	TAAAA	2	10	421242	421251	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012658	TATAA	2	10	424152	424161	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012658	AGTAT	2	10	426404	426413	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012658	ATTTT	2	10	426455	426464	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012658	ATTTT	2	10	426633	426642	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012658	TAAAA	2	10	426736	426745	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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