MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012654	TTTGT	2	10	60	69	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012654	TTTAA	2	10	1598	1607	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012654	CTATA	2	10	2288	2297	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_012654	TAGCA	2	10	3002	3011	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_012654	TTTTA	2	10	11800	11809	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012654	GTTTA	2	10	11928	11937	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012654	TCATG	2	10	12824	12833	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_012654	CCCAC	2	10	18551	18560	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
9	NC_012654	TAACT	2	10	18612	18621	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_012654	CTTTT	2	10	18810	18819	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_012654	TATTT	2	10	21478	21487	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012654	AAATT	2	10	38969	38978	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012654	TAATT	2	10	41526	41535	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012654	AAATT	2	10	41541	41550	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012654	TATAT	2	10	49727	49736	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012654	TTTCT	2	10	50001	50010	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_012654	TAGTA	2	10	58380	58389	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012654	TAATA	2	10	61391	61400	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012654	TTTTA	2	10	65398	65407	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012654	ATTAC	2	10	67793	67802	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012654	TAAAG	2	10	68742	68751	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012654	ATAAA	2	10	73901	73910	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012654	ATTTA	2	10	74011	74020	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012654	TATAT	2	10	75675	75684	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012654	GATAA	2	10	75698	75707	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012654	ATTTA	2	10	75733	75742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012654	TAATT	2	10	75791	75800	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012654	TTTAT	2	10	82102	82111	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012654	TAAAA	2	10	82154	82163	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012654	AATTA	2	10	82958	82967	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012654	AAATT	2	10	89327	89336	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012654	AAATA	2	10	89632	89641	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012654	TATAA	2	10	95693	95702	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012654	ATTTA	2	10	105157	105166	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012654	TTTTA	2	10	108371	108380	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012654	TATTT	2	10	110978	110987	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012654	AATTA	2	10	115754	115763	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012654	GTTTT	2	10	119061	119070	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012654	GCTTC	2	10	119107	119116	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_012654	TTCTT	2	10	119203	119212	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_012654	CCATT	2	10	131923	131932	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_012654	TTACT	2	10	132106	132115	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_012654	TAATA	2	10	132804	132813	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012654	CTATA	2	10	134903	134912	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_012654	TTATT	2	10	134966	134975	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012654	TCTTT	2	10	138634	138643	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_012654	ATATA	2	10	140298	140307	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012654	TATCT	2	10	146054	146063	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_012654	TTTTA	2	10	146852	146861	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012654	AATAA	2	10	149889	149898	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012654	TTAAT	2	10	166014	166023	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012654	CTTTC	2	10	174582	174591	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_012654	ATATT	2	10	184533	184542	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012654	CTTTT	2	10	187496	187505	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_012654	AAAAG	2	10	187531	187540	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012654	CTTTA	2	10	190568	190577	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_012654	ATATG	2	10	192425	192434	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012654	TATTT	2	10	198047	198056	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012654	ATAAC	2	10	200572	200581	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_012654	GCCAA	2	10	223572	223581	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_012654	CATTT	2	10	224686	224695	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_012654	TTTTA	2	10	225031	225040	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012654	ATTTA	2	10	225285	225294	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012654	TTATA	2	10	227655	227664	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012654	ATTTA	2	10	232190	232199	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012654	AATTA	2	10	243928	243937	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012654	TTAAA	2	10	254793	254802	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012654	ATTTA	2	10	254925	254934	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012654	TAAAA	2	10	259413	259422	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012654	ATATT	2	10	259442	259451	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012654	AGTTA	2	10	260651	260660	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012654	CAAAA	2	10	261963	261972	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_012654	CTTTT	2	10	262717	262726	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_012654	ATTAA	2	10	267933	267942	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012654	TAATT	2	10	268000	268009	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012654	AAATG	2	10	269918	269927	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012654	AAATT	2	10	269932	269941	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.