MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ

Total Repeats: 250

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012654	CTTT	2	8	33	40	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012654	AGTT	2	8	49	56	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012654	TAAT	2	8	495	502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012654	ATCT	2	8	626	633	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012654	TAAT	2	8	1952	1959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012654	CTTT	2	8	2438	2445	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012654	ATTA	2	8	2501	2508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012654	TCAT	2	8	2513	2520	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_012654	ATAA	2	8	2676	2683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012654	ATTA	2	8	2739	2746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012654	ATTT	2	8	2775	2782	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012654	ATTA	2	8	7024	7031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012654	AAAT	2	8	12714	12721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012654	CAAA	2	8	12727	12734	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012654	CAAT	2	8	12763	12770	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_012654	ATAA	2	8	12790	12797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012654	CTAT	2	8	13136	13143	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012654	TAAA	2	8	13294	13301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012654	TAAT	2	8	13492	13499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012654	ATTA	2	8	18221	18228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012654	AATT	2	8	18261	18268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012654	ATTT	2	8	18513	18520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012654	TCTT	2	8	18523	18530	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012654	CTTT	2	8	19168	19175	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_012654	TAAT	2	8	21538	21545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012654	CAAA	2	8	21633	21640	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_012654	CATT	2	8	36221	36228	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_012654	TTTA	2	8	37804	37811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012654	TAAT	2	8	37964	37971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012654	TAAA	2	8	38074	38081	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012654	CCCT	2	8	38815	38822	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_012654	TCAA	2	8	39025	39032	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_012654	ATTT	2	8	41619	41626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012654	TATT	2	8	42558	42565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012654	ATAA	2	8	42639	42646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012654	AATT	2	8	43328	43335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012654	TTCT	2	8	44656	44663	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_012654	ATTA	2	8	44752	44759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012654	TTTA	2	8	48948	48955	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012654	TTGT	2	8	49536	49543	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012654	GTTT	2	8	49780	49787	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012654	CTAT	2	8	49878	49885	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_012654	TTCT	2	8	50055	50062	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_012654	TCCT	2	8	50131	50138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012654	TAAT	2	8	54222	54229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012654	AATT	2	8	54243	54250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012654	TAAT	2	8	54284	54291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012654	TAAT	2	8	56536	56543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012654	TTTG	2	8	57422	57429	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012654	GGTT	2	8	60640	60647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012654	TTGT	2	8	61163	61170	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012654	TTCA	2	8	61214	61221	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012654	TTAA	2	8	61251	61258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012654	TACA	2	8	61363	61370	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_012654	TTCA	2	8	61418	61425	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_012654	AAAT	2	8	61460	61467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012654	TTTA	2	8	61578	61585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012654	ATTA	2	8	64530	64537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012654	ATTA	2	8	65508	65515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012654	ATTT	2	8	65993	66000	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012654	CTAC	2	8	66270	66277	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012654	CTTC	2	8	67554	67561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_012654	ATTA	2	8	67579	67586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012654	ATCT	2	8	67680	67687	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012654	TAAA	2	8	68798	68805	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012654	TAGT	2	8	71444	71451	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012654	AATT	2	8	74376	74383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012654	TAGT	2	8	75931	75938	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012654	AAAG	2	8	78694	78701	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012654	AGAA	2	8	80845	80852	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012654	TAAA	2	8	81041	81048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012654	TGTA	2	8	82601	82608	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012654	TACT	2	8	82672	82679	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_012654	ATAA	2	8	82846	82853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012654	GGTA	2	8	82917	82924	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012654	TTAT	2	8	82927	82934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012654	CTTC	2	8	88474	88481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_012654	TAAT	2	8	88520	88527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012654	AAAG	2	8	88656	88663	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012654	CTTT	2	8	88681	88688	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_012654	TTTA	2	8	89024	89031	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012654	AATT	2	8	89147	89154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012654	TAAG	2	8	89263	89270	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012654	AAAT	2	8	89401	89408	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012654	TAAA	2	8	89648	89655	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012654	TTTA	2	8	89689	89696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012654	TGAA	2	8	92462	92469	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012654	CTAT	2	8	93530	93537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_012654	AATT	2	8	97632	97639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012654	CTTT	2	8	97650	97657	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_012654	CTTT	2	8	100767	100774	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_012654	TTAA	2	8	100792	100799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012654	TTAT	2	8	100853	100860	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012654	TTAA	2	8	101179	101186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012654	TTTC	2	8	101838	101845	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_012654	ATAA	2	8	102259	102266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012654	TATT	2	8	102875	102882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012654	TAAT	2	8	102913	102920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012654	TAAT	2	8	103294	103301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012654	AAGA	2	8	103431	103438	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012654	CTTT	2	8	103461	103468	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_012654	TTAA	2	8	103802	103809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012654	TAAA	2	8	103874	103881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012654	AATT	2	8	105045	105052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012654	TATT	2	8	105142	105149	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012654	TCCA	2	8	105167	105174	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_012654	TCCA	2	8	108602	108609	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_012654	GCAA	2	8	109624	109631	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_012654	ATTT	2	8	109642	109649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012654	ATTT	2	8	110529	110536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012654	ATTA	2	8	110833	110840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012654	TAAT	2	8	112113	112120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012654	ATTC	2	8	113681	113688	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_012654	TTAC	2	8	113778	113785	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_012654	CTTT	2	8	114119	114126	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_012654	CAAA	2	8	114169	114176	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_012654	CCTT	2	8	114484	114491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_012654	TCAT	2	8	115724	115731	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_012654	AGCA	2	8	115879	115886	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_012654	CCTC	2	8	115919	115926	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
121	NC_012654	TTAA	2	8	115940	115947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012654	CATT	2	8	116387	116394	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_012654	TAAA	2	8	116479	116486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012654	TATT	2	8	117880	117887	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012654	ATTT	2	8	118130	118137	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012654	TAAT	2	8	118195	118202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012654	ATTA	2	8	118443	118450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012654	AAAT	2	8	118526	118533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012654	ATAC	2	8	118568	118575	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_012654	TACC	2	8	118898	118905	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_012654	ATGA	2	8	119092	119099	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012654	TAAA	2	8	119140	119147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012654	TTTA	2	8	119686	119693	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012654	ATTT	2	8	127298	127305	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012654	TAAA	2	8	128183	128190	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012654	ATTA	2	8	132270	132277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012654	AAAT	2	8	132761	132768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012654	TATT	2	8	136343	136350	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012654	TAAA	2	8	136399	136406	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012654	TATT	2	8	136598	136605	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012654	TTTA	2	8	136614	136621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012654	CTTT	2	8	137526	137533	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_012654	TAAA	2	8	138059	138066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012654	AAGG	2	8	138363	138370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012654	TAAT	2	8	142016	142023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012654	TAGA	2	8	145561	145568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012654	ACTT	2	8	146366	146373	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_012654	ATTT	2	8	146374	146381	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012654	TTCT	2	8	146824	146831	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_012654	TATC	2	8	147878	147885	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_012654	TATT	2	8	148201	148208	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012654	TTTA	2	8	148236	148243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012654	TCCT	2	8	148769	148776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_012654	ATTT	2	8	149034	149041	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_012654	ATTT	2	8	150040	150047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_012654	TAAA	2	8	155871	155878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.