MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ

Total Repeats: 1728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012654	A	6	6	233429	233434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_012654	TA	4	8	233465	233472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_012654	TA	3	6	233487	233492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_012654	AAAATA	2	12	233973	233984	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_012654	TA	3	6	233983	233988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_012654	TA	3	6	234001	234006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_012654	TAG	2	6	234014	234019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_012654	AT	3	6	234031	234036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_012654	AT	3	6	234064	234069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_012654	ATT	2	6	234085	234090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_012654	TTC	2	6	234107	234112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_012654	TTC	2	6	234130	234135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_012654	AT	3	6	234447	234452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_012654	AT	3	6	234462	234467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_012654	A	6	6	234484	234489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_012654	ATT	2	6	234494	234499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_012654	AAT	2	6	234513	234518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_012654	ATT	2	6	234532	234537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_012654	TGT	2	6	234570	234575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_012654	TAT	2	6	239114	239119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_012654	T	6	6	239119	239124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_012654	AT	3	6	239125	239130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_012654	AAT	2	6	239144	239149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_012654	A	6	6	239153	239158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_012654	TAA	2	6	239159	239164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_012654	TTAC	2	8	239181	239188	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_012654	TA	3	6	239193	239198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_012654	T	6	6	239203	239208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_012654	TA	3	6	239276	239281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_012654	TAA	2	6	239362	239367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_012654	TCA	2	6	243862	243867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_012654	CT	3	6	243870	243875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_012654	AATTA	2	10	243928	243937	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_012654	TAAT	2	8	243944	243951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_012654	AAC	2	6	243958	243963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_012654	AT	4	8	244025	244032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_012654	TAT	2	6	244062	244067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_012654	T	6	6	244067	244072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_012654	AT	4	8	244073	244080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_012654	AAT	2	6	244092	244097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_012654	A	6	6	244101	244106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_012654	TAA	2	6	244107	244112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_012654	A	6	6	244122	244127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_012654	TTAC	2	8	244129	244136	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1545	NC_012654	TA	3	6	244141	244146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_012654	AAT	2	6	245094	245099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_012654	AAT	2	6	245205	245210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_012654	CTCC	2	8	247108	247115	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1549	NC_012654	T	6	6	247132	247137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_012654	TAT	2	6	247153	247158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_012654	ATT	2	6	247173	247178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_012654	TC	3	6	247199	247204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_012654	TAT	2	6	247212	247217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_012654	CCA	2	6	247239	247244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_012654	CAC	2	6	247290	247295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_012654	TAC	2	6	247393	247398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_012654	GCA	2	6	247429	247434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_012654	GAT	2	6	247492	247497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_012654	ACC	2	6	247587	247592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_012654	TA	3	6	247682	247687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_012654	TAG	2	6	247708	247713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_012654	TCC	2	6	251727	251732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_012654	AAT	2	6	251763	251768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_012654	TAAT	3	12	251765	251776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_012654	TTA	2	6	251780	251785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_012654	TTA	2	6	251827	251832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_012654	AT	3	6	252204	252209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_012654	CCT	2	6	253312	253317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1569	NC_012654	TTTA	2	8	253337	253344	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_012654	C	6	6	253408	253413	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1571	NC_012654	T	6	6	253426	253431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_012654	TTA	2	6	253489	253494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_012654	TAAT	2	8	253498	253505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_012654	TAT	2	6	253506	253511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_012654	A	7	7	253519	253525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_012654	T	6	6	253535	253540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_012654	TTA	2	6	253563	253568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1580	NC_012654	TAT	2	6	254175	254180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1582	NC_012654	TAT	2	6	254190	254195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_012654	A	6	6	254203	254208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_012654	AT	3	6	254445	254450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_012654	TA	3	6	254458	254463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_012654	TCC	2	6	254466	254471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1589	NC_012654	TA	3	6	254551	254556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1591	NC_012654	TTA	2	6	254627	254632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_012654	ATT	2	6	254645	254650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_012654	ATT	2	6	254677	254682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_012654	AT	3	6	254719	254724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_012654	TTAAA	2	10	254793	254802	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_012654	TATT	2	8	254823	254830	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1603	NC_012654	ATTTA	2	10	254925	254934	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_012654	TAT	2	6	254948	254953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_012654	ATA	2	6	254974	254979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_012654	A	6	6	254988	254993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1608	NC_012654	CCT	2	6	255230	255235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1609	NC_012654	TCAT	2	8	255253	255260	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1610	NC_012654	ATTC	2	8	255297	255304	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_012654	AGT	2	6	255322	255327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_012654	T	7	7	255347	255353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_012654	TA	3	6	255373	255378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_012654	TAA	2	6	255402	255407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1616	NC_012654	CTT	2	6	255658	255663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_012654	TA	3	6	255666	255671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_012654	ATTT	2	8	255692	255699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_012654	TTAT	2	8	255740	255747	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_012654	TAA	2	6	255756	255761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_012654	ATA	2	6	255878	255883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1624	NC_012654	TCC	2	6	256343	256348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1625	NC_012654	T	6	6	256392	256397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_012654	TTTC	2	8	256422	256429	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1627	NC_012654	T	7	7	256459	256465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_012654	T	6	6	256916	256921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_012654	ATTA	3	12	256922	256933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_012654	TAA	2	6	256939	256944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1632	NC_012654	TTA	2	6	257599	257604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_012654	T	7	7	257652	257658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_012654	ATT	2	6	257668	257673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_012654	TAAA	2	8	257705	257712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_012654	ATT	2	6	257732	257737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_012654	ACC	2	6	257966	257971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1638	NC_012654	TAA	2	6	258036	258041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1640	NC_012654	A	6	6	258098	258103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1689	NC_012654	CTC	2	6	263836	263841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1728	NC_012654	CTAA	2	8	269955	269962	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

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