MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium aurimucosum ATCC 700975 chromosome

Total Repeats: 269

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012590	GCGTT	2	10	15362	15371	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_012590	AGTTT	2	10	39666	39675	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012590	CGGCA	2	10	41400	41409	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_012590	TTCGG	2	10	43476	43485	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_012590	CCCAA	2	10	43831	43840	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_012590	TTCGG	2	10	50655	50664	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_012590	CCCAA	2	10	51010	51019	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_012590	GGTTG	2	10	53129	53138	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012590	TCGGT	2	10	54427	54436	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_012590	CCCAA	2	10	54782	54791	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_012590	TCATC	2	10	57090	57099	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_012590	CGAGG	2	10	58304	58313	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_012590	GACGC	2	10	58440	58449	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_012590	GGTTG	2	10	59908	59917	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012590	CTTCT	2	10	61669	61678	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_012590	CTAAG	2	10	70032	70041	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_012590	CACAC	2	10	97321	97330	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_012590	TTGAG	2	10	112262	112271	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012590	GTGAT	2	10	119060	119069	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012590	AGCGG	2	10	180535	180544	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012590	GCTAG	2	10	180590	180599	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_012590	GTGTC	2	10	193712	193721	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_012590	TACCT	2	10	198074	198083	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_012590	ACTGC	2	10	208806	208815	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_012590	TACGT	2	10	215407	215416	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_012590	TGGTT	2	10	227610	227619	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012590	AAGAA	2	10	245449	245458	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012590	GCGCC	2	10	253136	253145	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
29	NC_012590	CATAA	2	10	272406	272415	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_012590	GTTAT	2	10	273950	273959	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012590	GTAAG	2	10	284765	284774	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012590	TTCGG	2	10	294498	294507	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_012590	CCCAA	2	10	294853	294862	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
34	NC_012590	TTCAG	2	10	296213	296222	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_012590	GCAAA	2	10	365326	365335	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_012590	CCCGG	2	10	386827	386836	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_012590	AGGCT	2	10	396721	396730	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_012590	TCCTT	2	10	412960	412969	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_012590	GCCAA	2	10	417056	417065	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_012590	CCTTT	2	10	423389	423398	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_012590	GCACT	2	10	428182	428191	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_012590	TAGGG	2	10	433674	433683	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012590	TTCGG	2	10	458139	458148	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_012590	CCCAA	2	10	458494	458503	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
45	NC_012590	CGGCT	2	10	460921	460930	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_012590	ACTCC	2	10	468652	468661	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
47	NC_012590	AGGGG	2	10	488745	488754	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012590	GGGGC	2	10	493846	493855	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
49	NC_012590	CAGTG	2	10	519843	519852	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_012590	GCCAG	2	10	552515	552524	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_012590	AGAGT	2	10	568486	568495	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012590	GGGCA	2	10	576635	576644	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
53	NC_012590	CAGAG	2	10	601220	601229	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_012590	TGAGG	2	10	612030	612039	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012590	TGCGT	2	10	619749	619758	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_012590	TCGCT	2	10	645505	645514	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_012590	GGCGT	2	10	654686	654695	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_012590	GCCGC	2	10	656020	656029	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
59	NC_012590	CACGT	2	10	689389	689398	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_012590	GCAGC	2	10	722215	722224	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_012590	ACGGC	2	10	722597	722606	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_012590	CGCGC	2	10	723589	723598	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
63	NC_012590	GGCTG	2	10	725668	725677	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_012590	TGGGC	2	10	734996	735005	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_012590	TGGGT	2	10	742124	742133	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012590	ACCGA	2	10	745425	745434	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_012590	CCCCA	2	10	769954	769963	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
68	NC_012590	CTAGA	2	10	774487	774496	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_012590	CGCGG	2	10	798219	798228	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
70	NC_012590	AAGTA	2	10	799923	799932	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012590	TCGTG	2	10	816413	816422	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_012590	CGTCA	2	10	816747	816756	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_012590	TGGTG	2	10	816940	816949	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012590	GGGAG	2	10	817920	817929	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012590	TTGTG	2	10	818362	818371	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012590	GTTCG	2	10	819632	819641	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_012590	TTCGG	2	10	822702	822711	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_012590	CCCAA	2	10	823057	823066	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
79	NC_012590	CGGCG	2	10	833035	833044	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
80	NC_012590	CATGC	2	10	839168	839177	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_012590	AGGAA	2	10	842695	842704	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012590	GGGTG	2	10	845645	845654	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012590	GGTTG	2	10	855350	855359	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012590	GGGTG	2	10	887354	887363	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012590	AGGTT	2	10	887424	887433	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012590	TGTCC	2	10	900503	900512	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_012590	GGCGC	2	10	901611	901620	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
88	NC_012590	CACCC	2	10	901844	901853	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
89	NC_012590	GCAGA	2	10	905169	905178	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_012590	TGGGG	2	10	924961	924970	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012590	TACCG	2	10	944038	944047	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_012590	TACTT	2	10	954409	954418	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_012590	ATGCT	2	10	983637	983646	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_012590	GAAAG	2	10	989013	989022	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012590	GCTCA	2	10	993394	993403	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_012590	CCCCG	2	10	997793	997802	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
97	NC_012590	GTGAT	2	10	999106	999115	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012590	TGAAA	2	10	1012517	1012526	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012590	TTGCG	2	10	1013802	1013811	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_012590	AGCGC	2	10	1025096	1025105	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_012590	CAAAG	2	10	1025112	1025121	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_012590	TAATC	2	10	1059766	1059775	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_012590	CAACC	2	10	1061559	1061568	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
104	NC_012590	CGCCC	2	10	1083800	1083809	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
105	NC_012590	GCCCA	2	10	1085780	1085789	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
106	NC_012590	CTAGA	2	10	1094167	1094176	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_012590	TCCAC	2	10	1099721	1099730	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
108	NC_012590	TAGTC	2	10	1103548	1103557	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_012590	TGGGG	2	10	1104825	1104834	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012590	GCTGT	2	10	1114086	1114095	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_012590	AGGGT	2	10	1121544	1121553	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012590	AGTGT	2	10	1154313	1154322	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012590	GTTAC	2	10	1174939	1174948	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_012590	TCCTT	2	10	1178928	1178937	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_012590	GTGCT	2	10	1190156	1190165	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_012590	GGGGT	2	10	1197667	1197676	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012590	AGAAA	2	10	1204974	1204983	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012590	CTTAG	2	10	1219335	1219344	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_012590	TGCCG	2	10	1221600	1221609	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_012590	GAGGT	2	10	1222066	1222075	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012590	TCGGA	2	10	1276674	1276683	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_012590	GGCAC	2	10	1276963	1276972	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_012590	AGGAA	2	10	1277149	1277158	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012590	GCTGA	2	10	1277358	1277367	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_012590	CGTGG	2	10	1278479	1278488	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_012590	GGCGA	2	10	1312934	1312943	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
127	NC_012590	AAGGG	2	10	1321337	1321346	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012590	GATAA	2	10	1327506	1327515	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012590	GGTAC	2	10	1328636	1328645	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_012590	CGCGC	2	10	1331316	1331325	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
131	NC_012590	GCCCC	2	10	1344171	1344180	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
132	NC_012590	TTCGG	2	10	1359993	1360002	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_012590	CCCAA	2	10	1360348	1360357	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
134	NC_012590	CTCTT	2	10	1361086	1361095	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_012590	GGGGC	2	10	1372742	1372751	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
136	NC_012590	CGAGG	2	10	1382358	1382367	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
137	NC_012590	GGGGA	2	10	1420750	1420759	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012590	TTTCA	2	10	1425730	1425739	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_012590	TTTCC	2	10	1428494	1428503	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_012590	CGAAG	2	10	1435948	1435957	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_012590	GCGCA	2	10	1441831	1441840	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_012590	ACCGA	2	10	1482121	1482130	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_012590	CACAA	2	10	1483393	1483402	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_012590	CTCCC	2	10	1483835	1483844	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
145	NC_012590	GTTGG	2	10	1484128	1484137	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012590	ATTTT	2	10	1485490	1485499	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012590	CAACA	2	10	1485729	1485738	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_012590	TGACG	2	10	1486314	1486323	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_012590	CACGA	2	10	1486648	1486657	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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151	NC_012590	CCAAG	2	10	1487495	1487504	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
152	NC_012590	TGGGC	2	10	1487653	1487662	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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154	NC_012590	CCCAA	2	10	1490490	1490499	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
155	NC_012590	AAGAA	2	10	1497222	1497231	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
156	NC_012590	CTACC	2	10	1511109	1511118	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
157	NC_012590	GAGCT	2	10	1529830	1529839	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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160	NC_012590	GCGCA	2	10	1568554	1568563	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
161	NC_012590	CTTTC	2	10	1581684	1581693	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
162	NC_012590	CCCAA	2	10	1584734	1584743	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
163	NC_012590	CGTTC	2	10	1596922	1596931	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
164	NC_012590	TTTCC	2	10	1640575	1640584	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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167	NC_012590	TCCTA	2	10	1673730	1673739	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
168	NC_012590	GTCTA	2	10	1698401	1698410	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
169	NC_012590	AGGAA	2	10	1707538	1707547	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_012590	CACCC	2	10	1738499	1738508	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
172	NC_012590	CTAAG	2	10	1801847	1801856	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
173	NC_012590	AGGGC	2	10	1812043	1812052	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
174	NC_012590	CCGCT	2	10	1836231	1836240	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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181	NC_012590	CAGCA	2	10	1910964	1910973	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
182	NC_012590	TCGTT	2	10	1917234	1917243	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
183	NC_012590	GTCGC	2	10	1932233	1932242	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
184	NC_012590	GGGCT	2	10	1947095	1947104	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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186	NC_012590	TGCAG	2	10	1959165	1959174	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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188	NC_012590	GCGCC	2	10	1961125	1961134	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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196	NC_012590	GGCAG	2	10	2012018	2012027	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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262	NC_012590	CAACA	2	10	2662768	2662777	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
263	NC_012590	TGACG	2	10	2663353	2663362	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
264	NC_012590	CACGA	2	10	2663687	2663696	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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267	NC_012590	ATTTT	2	10	2683294	2683303	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_012590	CCCAA	2	10	2705318	2705327	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
269	NC_012590	GCCAC	2	10	2718651	2718660	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.