MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum A2 str. Kyoto chromosome

Total Repeats: 25076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_012563	ATTA	2	8	4130952	4130959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25002	NC_012563	T	6	6	4130972	4130977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25003	NC_012563	CTT	2	6	4130987	4130992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25004	NC_012563	ATA	2	6	4130995	4131000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25005	NC_012563	TA	3	6	4131007	4131012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25006	NC_012563	TAA	2	6	4131031	4131036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25007	NC_012563	TAT	2	6	4131059	4131064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25008	NC_012563	AATATA	2	12	4131070	4131081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25009	NC_012563	AAAT	2	8	4131088	4131095	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25010	NC_012563	A	6	6	4131113	4131118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25011	NC_012563	AAAT	2	8	4131132	4131139	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25012	NC_012563	TC	3	6	4132502	4132507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25013	NC_012563	CTC	2	6	4132516	4132521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25014	NC_012563	TCC	2	6	4137893	4137898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25015	NC_012563	ACA	2	6	4138218	4138223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25016	NC_012563	T	6	6	4138233	4138238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25017	NC_012563	TAC	2	6	4138245	4138250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25018	NC_012563	AAT	2	6	4138279	4138284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25019	NC_012563	A	7	7	4138317	4138323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25020	NC_012563	TAG	2	6	4138336	4138341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25021	NC_012563	CCT	2	6	4138615	4138620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25022	NC_012563	ACC	2	6	4139079	4139084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25023	NC_012563	CCT	2	6	4139381	4139386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25024	NC_012563	CAG	2	6	4139415	4139420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25025	NC_012563	AAT	2	6	4139439	4139444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25026	NC_012563	TAT	2	6	4139459	4139464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25027	NC_012563	TTA	2	6	4140638	4140643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25028	NC_012563	CTA	2	6	4140709	4140714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25029	NC_012563	CAT	2	6	4140738	4140743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25030	NC_012563	AT	4	8	4140756	4140763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25031	NC_012563	AT	4	8	4140801	4140808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25032	NC_012563	TTTA	2	8	4140833	4140840	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25033	NC_012563	A	7	7	4140845	4140851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25034	NC_012563	TTAA	2	8	4140876	4140883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25035	NC_012563	A	7	7	4140882	4140888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25036	NC_012563	TC	3	6	4141104	4141109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25037	NC_012563	TTATTC	2	12	4142254	4142265	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25038	NC_012563	TA	3	6	4142309	4142314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25039	NC_012563	TA	4	8	4142330	4142337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25040	NC_012563	ATT	2	6	4142368	4142373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25041	NC_012563	ATTT	2	8	4142388	4142395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25042	NC_012563	AT	3	6	4142398	4142403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25043	NC_012563	AGG	2	6	4144693	4144698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25044	NC_012563	T	7	7	4144699	4144705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25045	NC_012563	ATT	2	6	4145559	4145564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25046	NC_012563	TCC	2	6	4146105	4146110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25047	NC_012563	TCC	2	6	4146990	4146995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25048	NC_012563	CAC	2	6	4147768	4147773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25049	NC_012563	TAAT	2	8	4147775	4147782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25050	NC_012563	TA	3	6	4147798	4147803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25051	NC_012563	AAT	2	6	4147815	4147820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25052	NC_012563	TTA	2	6	4147841	4147846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25053	NC_012563	TAA	2	6	4147852	4147857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25054	NC_012563	A	6	6	4147856	4147861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25055	NC_012563	TCT	2	6	4148704	4148709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25056	NC_012563	CTT	2	6	4148725	4148730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25057	NC_012563	T	7	7	4148729	4148735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25058	NC_012563	ATT	2	6	4148736	4148741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25059	NC_012563	T	7	7	4148740	4148746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25060	NC_012563	ATT	2	6	4148755	4148760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25061	NC_012563	ATA	2	6	4152807	4152812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25062	NC_012563	AAAG	2	8	4152816	4152823	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25063	NC_012563	CCT	2	6	4154134	4154139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25064	NC_012563	T	6	6	4154706	4154711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25065	NC_012563	CCT	2	6	4154891	4154896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25066	NC_012563	AAT	2	6	4154911	4154916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25067	NC_012563	TA	3	6	4154995	4155000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25068	NC_012563	T	7	7	4155052	4155058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25069	NC_012563	CTT	2	6	4155067	4155072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25070	NC_012563	TA	3	6	4155080	4155085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25071	NC_012563	ATT	3	9	4155095	4155103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25072	NC_012563	T	7	7	4155187	4155193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25073	NC_012563	TTAT	2	8	4155236	4155243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25074	NC_012563	T	6	6	4155256	4155261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25075	NC_012563	T	6	6	4155263	4155268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25076	NC_012563	TTA	2	6	4155272	4155277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.