MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter lari RM2100 megaplasmid pCL2100

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012040	TGTTT	2	10	7219	7228	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012040	CTATA	2	10	9111	9120	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_012040	TGTTT	2	10	9185	9194	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012040	ATAAA	2	10	10493	10502	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012040	CAAAG	2	10	16081	16090	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_012040	TAATT	2	10	16370	16379	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012040	CAAAG	2	10	19154	19163	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_012040	AGAAA	2	10	25911	25920	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012040	AAATC	2	10	35225	35234	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_012040	TAAGA	2	10	36446	36455	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012040	TAAGA	2	10	36848	36857	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012040	TTTAT	2	10	36949	36958	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012040	TAAAT	2	10	38875	38884	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012040	TTAAT	2	10	40204	40213	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012040	TCAAA	2	10	42744	42753	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_012040	AAATT	2	10	42754	42763	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012040	TAAAT	2	10	43244	43253	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012040	GTTTT	2	10	45150	45159	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012040	ATAAA	2	10	45820	45829	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.