MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter lari RM2100 megaplasmid pCL2100

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012040	ATT	2	6	7284	7289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012040	ATT	2	6	7358	7363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012040	ATT	2	6	8004	8009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012040	TAT	2	6	8015	8020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012040	TAT	2	6	9023	9028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012040	ATT	2	6	9214	9219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012040	TAA	2	6	9225	9230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012040	ACA	2	6	9256	9261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012040	TAT	2	6	10112	10117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012040	TAA	2	6	10248	10253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012040	TAT	2	6	10319	10324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012040	TTG	2	6	10895	10900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012040	ATC	2	6	10922	10927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012040	TCT	2	6	10967	10972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012040	TCT	2	6	11090	11095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012040	CTT	2	6	11154	11159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012040	TTA	2	6	11240	11245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012040	ATA	2	6	11278	11283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012040	ATT	2	6	16092	16097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012040	ATA	2	6	16101	16106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012040	TTA	2	6	16153	16158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012040	GCC	2	6	16172	16177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_012040	CTT	2	6	16209	16214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012040	AAG	2	6	16297	16302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012040	GAA	2	6	16467	16472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012040	TAA	2	6	17404	17409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012040	TAT	2	6	17533	17538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012040	TCT	2	6	17546	17551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012040	CTT	2	6	17556	17561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012040	AAT	2	6	17569	17574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012040	CTT	2	6	19281	19286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012040	ATA	2	6	25856	25861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012040	AAG	2	6	25928	25933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012040	TTA	2	6	27572	27577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012040	TTA	2	6	28268	28273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012040	TTA	2	6	35665	35670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012040	TTA	2	6	36263	36268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012040	TTA	2	6	36361	36366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012040	AGG	2	6	36375	36380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012040	TAT	2	6	36406	36411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012040	ATT	2	6	36570	36575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012040	ATT	2	6	36593	36598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012040	CAT	2	6	36622	36627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012040	AAT	2	6	36683	36688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012040	AGG	2	6	36777	36782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012040	ATT	2	6	36903	36908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012040	TAG	2	6	37643	37648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012040	AGT	2	6	38819	38824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012040	AAT	2	6	38904	38909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012040	TGA	2	6	40233	40238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012040	TAG	2	6	40255	40260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012040	ATT	2	6	42339	42344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012040	ATT	2	6	42410	42415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012040	CAC	2	6	42446	42451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_012040	TCT	2	6	42563	42568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012040	AAT	2	6	42621	42626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012040	ATT	2	6	42643	42648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012040	TAA	3	9	42664	42672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012040	AGT	2	6	43188	43193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012040	AAT	2	6	43273	43278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012040	TAA	2	6	45132	45137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012040	ATT	2	6	45166	45171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012040	GTA	2	6	45567	45572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012040	TGA	2	6	45695	45700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012040	ATA	2	6	45759	45764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012040	TGA	2	6	45788	45793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012040	AAT	2	6	45837	45842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012040	CAA	2	6	45931	45936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012040	AAG	2	6	46073	46078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012040	TTA	3	9	46174	46182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012040	AAT	2	6	46185	46190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.