MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725 chromosome

Total Repeats: 190

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012034	GTAAAA	2	12	35070	35081	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012034	TTTTGT	2	12	66469	66480	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012034	AGATTA	2	12	83094	83105	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012034	TTTTTG	2	12	106762	106773	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012034	CTTTTT	2	12	114845	114856	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_012034	TGTTGC	2	12	153601	153612	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_012034	GTGCAT	2	12	153647	153658	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_012034	AAGCAA	2	12	154706	154717	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_012034	TTTAAT	2	12	156742	156753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012034	AACTTG	2	12	157052	157063	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_012034	CTTTGT	2	12	158101	158112	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_012034	AGGTGA	2	12	158569	158580	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012034	TCGTTT	2	12	166936	166947	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012034	TGACAA	2	12	182858	182869	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_012034	GGATAA	2	12	195684	195695	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012034	TAAAAA	2	12	223513	223524	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012034	ATTTTT	2	12	275456	275467	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012034	AAAATT	2	12	276515	276526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012034	TGTCAT	2	12	329432	329443	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_012034	TCTATT	2	12	333311	333322	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_012034	ATTTTT	2	12	337495	337506	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012034	GACTTT	2	12	338040	338051	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_012034	TAGTTA	2	12	339179	339190	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012034	ATTTTT	2	12	344850	344861	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012034	AGGAGA	2	12	344898	344909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012034	TAATTT	2	12	377198	377209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012034	ACTTTC	2	12	379548	379559	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012034	TCGTTT	2	12	432930	432941	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012034	TAAAAT	2	12	436496	436507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012034	AAGGCT	2	12	450052	450063	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_012034	GAGAAG	2	12	450599	450610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012034	TACTTA	2	12	458630	458641	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_012034	TCGTTT	2	12	467034	467045	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012034	TGGGAG	2	12	467283	467294	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012034	ACTTTC	2	12	475403	475414	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012034	GTTGTA	2	12	541226	541237	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012034	TTTTAT	2	12	542360	542371	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012034	AAGTCA	2	12	546749	546760	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_012034	ACTTTC	2	12	556319	556330	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012034	TGAAAA	2	12	563661	563672	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012034	ATTTTT	2	12	568298	568309	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012034	TCGTTT	2	12	685122	685133	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_012034	ACTTTC	2	12	694764	694775	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012034	CTTATT	2	12	714316	714327	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_012034	TAATAT	2	12	724868	724879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012034	AATTAA	2	12	742582	742593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012034	ATGAAA	2	12	749929	749940	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012034	ATGACA	2	12	757822	757833	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_012034	ATTAAT	2	12	759652	759663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012034	GGTTTG	2	12	766076	766087	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012034	CTTATC	2	12	768546	768557	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012034	ATCAAA	2	12	779010	779021	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_012034	TTAAAA	2	12	822025	822036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012034	CTTTTT	2	12	823936	823947	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_012034	GTTTTT	2	12	844241	844252	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012034	TTTGCA	2	12	956987	956998	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_012034	CATTTA	2	12	957054	957065	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_012034	GTGAGA	2	12	966144	966155	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012034	TTACAA	2	12	971488	971499	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_012034	CTTTTT	2	12	996812	996823	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_012034	TGAAAG	2	12	1003085	1003096	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012034	TTCATT	2	12	1009240	1009251	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012034	ATGTTT	2	12	1023047	1023058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012034	TTAATT	2	12	1044369	1044380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012034	AAATAA	2	12	1063265	1063276	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012034	AAAAAG	2	12	1074361	1074372	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012034	TGAAAA	2	12	1099027	1099038	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012034	GTTTTT	2	12	1112018	1112029	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012034	AATTTT	2	12	1117225	1117236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012034	ATTTTT	2	12	1118164	1118175	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012034	TCGTTT	2	12	1257601	1257612	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_012034	TTTTCT	2	12	1258027	1258038	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_012034	TAAATT	2	12	1275548	1275559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012034	AGAAGT	2	12	1296145	1296156	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012034	CTTTTT	2	12	1348403	1348414	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_012034	AAATTA	2	12	1437231	1437242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012034	AAGAAA	2	12	1474560	1474571	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012034	ACCTCA	2	12	1478942	1478953	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_012034	TTTCTG	2	12	1479409	1479420	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_012034	CTTTTT	2	12	1552387	1552398	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_012034	TTATAA	2	12	1565341	1565352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012034	AATTTT	2	12	1575137	1575148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012034	GTAATT	2	12	1575192	1575203	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012034	TATTTT	2	12	1596391	1596402	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012034	TCTTTT	2	12	1596456	1596467	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_012034	TATATT	2	12	1603523	1603534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012034	TGAAAA	2	12	1649208	1649219	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012034	AACAAA	2	12	1657738	1657749	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_012034	GAAAAT	2	12	1657801	1657812	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012034	ATGACA	2	12	1661090	1661101	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_012034	TTAAAT	2	12	1674977	1674988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012034	AAAACG	2	12	1686644	1686655	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_012034	GACTTT	2	12	1724840	1724851	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_012034	AATCTC	2	12	1737874	1737885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012034	CTTTTT	2	12	1772925	1772936	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_012034	AGCCTT	2	12	1796439	1796450	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012034	TTTTTC	2	12	1834001	1834012	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_012034	ATTTTT	2	12	1834555	1834566	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012034	TCTTAA	2	12	1851209	1851220	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_012034	AATTAT	2	12	1857924	1857935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012034	ATTCTT	2	12	1863212	1863223	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_012034	AATTTT	2	12	1909674	1909685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012034	GCAATT	2	12	1924711	1924722	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_012034	AATTTT	2	12	1938270	1938281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012034	TTTACT	2	12	1959556	1959567	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_012034	TTTTGT	2	12	2024798	2024809	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012034	TATCAA	2	12	2050056	2050067	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_012034	AATAAA	2	12	2062030	2062041	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012034	TTTTTA	2	12	2078818	2078829	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012034	AATAAA	2	12	2083132	2083143	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012034	TTTGTT	2	12	2084923	2084934	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012034	TTTTTA	2	12	2089053	2089064	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012034	TAAAAA	2	12	2096667	2096678	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012034	ATTTTA	2	12	2098560	2098571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012034	TAAAAA	2	12	2107503	2107514	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012034	TTCAGG	2	12	2110952	2110963	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_012034	GTGAGT	2	12	2112925	2112936	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012034	AAAAAC	2	12	2118924	2118935	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_012034	TAGTTA	2	12	2123686	2123697	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012034	AATCTT	2	12	2132708	2132719	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_012034	CTTTAG	2	12	2132956	2132967	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_012034	TAACTA	2	12	2135195	2135206	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_012034	ACCTTG	2	12	2138546	2138557	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012034	CTTTAA	3	18	2138655	2138672	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_012034	TTAATA	2	12	2139150	2139161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012034	AAAATT	2	12	2149205	2149216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012034	ATTATA	2	12	2165619	2165630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012034	ACCACA	2	12	2176401	2176412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_012034	TGTCAA	2	12	2187485	2187496	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_012034	TTTTTG	2	12	2217589	2217600	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012034	TTTGTT	2	12	2219616	2219627	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012034	AACCTT	2	12	2224637	2224648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_012034	TGAGTA	2	12	2233144	2233155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012034	TTTCCA	2	12	2259065	2259076	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012034	GGTTTT	2	12	2313470	2313481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012034	AAAAAG	2	12	2316132	2316143	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012034	ACTTCT	2	12	2327886	2327897	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_012034	AATCTT	2	12	2331584	2331595	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_012034	TCAAAT	2	12	2334012	2334023	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_012034	GAAAGT	2	12	2353263	2353274	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012034	TTTTTA	2	12	2376445	2376456	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_012034	TAATTA	2	12	2419191	2419202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_012034	AATCTT	2	12	2528013	2528024	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_012034	TAAATT	2	12	2556054	2556065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012034	GAGGAA	2	12	2561403	2561414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012034	ATTTTT	2	12	2606756	2606767	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_012034	ACAAAA	2	12	2639243	2639254	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.