MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725 chromosome

Total Repeats: 543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012034	AATTG	2	10	9113	9122	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012034	ATTCA	2	10	11562	11571	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_012034	AGTTT	2	10	21799	21808	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012034	ATAGA	2	10	23925	23934	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012034	ATATT	2	10	24256	24265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012034	AGTTT	2	10	24279	24288	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012034	GTTAT	2	10	26611	26620	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012034	TTAAA	2	10	30449	30458	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012034	GATTA	2	10	34992	35001	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012034	TAAAA	2	10	39118	39127	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012034	AAATC	2	10	42139	42148	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_012034	ATTTA	2	10	83187	83196	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012034	GGAAG	2	10	83321	83330	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012034	TTTTC	2	10	83585	83594	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_012034	GAAGA	2	10	87256	87265	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012034	TTGTT	2	10	87438	87447	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012034	AGTAG	2	10	87821	87830	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012034	TAGAA	2	10	88310	88319	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012034	GAAGG	2	10	91924	91933	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012034	TTTTG	2	10	100919	100928	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012034	AATTA	2	10	101556	101565	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012034	TAAAA	2	10	109587	109596	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012034	GAAGG	2	10	109963	109972	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012034	ATTCA	2	10	112272	112281	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012034	GATAT	2	10	117464	117473	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012034	ATAAA	2	10	119147	119156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012034	TAGCT	2	10	120718	120727	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_012034	GGATT	2	10	121451	121460	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012034	AATTT	2	10	129136	129145	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012034	ATTTA	2	10	131910	131919	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012034	ATTTT	2	10	142882	142891	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012034	TGTTC	2	10	152814	152823	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_012034	ATGGT	2	10	159286	159295	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012034	TTGTT	2	10	159347	159356	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012034	ATGTT	2	10	159950	159959	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012034	ATCCA	2	10	161803	161812	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_012034	AGGTT	2	10	161964	161973	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012034	ATAAA	2	10	162116	162125	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012034	TGATA	2	10	162169	162178	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012034	TTTCA	2	10	164279	164288	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_012034	TTTCA	2	10	164346	164355	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_012034	AAAGG	2	10	165714	165723	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012034	ACTTC	2	10	166592	166601	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_012034	ATTTT	2	10	167167	167176	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012034	ATTTT	2	10	168129	168138	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012034	AGAAT	2	10	168706	168715	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012034	GCTTT	2	10	180485	180494	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_012034	AGCCA	2	10	183240	183249	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_012034	TAAAA	2	10	189071	189080	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012034	TTTTG	2	10	189129	189138	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012034	AAAAT	2	10	200785	200794	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012034	TTATA	2	10	207336	207345	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012034	TAAAA	2	10	238239	238248	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012034	AATTA	2	10	256548	256557	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012034	CAGGG	2	10	263395	263404	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_012034	CTTTT	2	10	267932	267941	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_012034	ATTTT	2	10	268960	268969	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012034	TTATA	2	10	269920	269929	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012034	TGTTT	2	10	275749	275758	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012034	CTAAT	2	10	276153	276162	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_012034	TCAAA	2	10	281621	281630	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_012034	TAAAA	2	10	284948	284957	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012034	GGGAA	2	10	286314	286323	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012034	ATAAA	2	10	290405	290414	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012034	TAAGA	2	10	294053	294062	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012034	TTTTA	2	10	307966	307975	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012034	ATAAA	2	10	308746	308755	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012034	TGATA	2	10	308799	308808	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012034	GAAGA	2	10	311007	311016	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012034	TTGTT	2	10	311189	311198	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012034	ATTTT	2	10	316722	316731	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012034	TAAAA	2	10	326962	326971	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012034	ATTTG	2	10	326988	326997	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012034	TGGAA	2	10	327767	327776	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012034	AAAGG	2	10	328299	328308	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012034	AAGAG	2	10	328351	328360	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012034	GTTAT	2	10	328412	328421	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012034	ACTTC	2	10	329089	329098	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_012034	ATTTT	2	10	329663	329672	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012034	TAAGA	2	10	332739	332748	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012034	ATTTT	2	10	333073	333082	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012034	TTTTC	2	10	333285	333294	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_012034	ATTTT	2	10	337235	337244	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012034	AACTA	2	10	337660	337669	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_012034	TAGAA	2	10	337764	337773	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012034	CAATA	2	10	337824	337833	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_012034	TGATT	2	10	338350	338359	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012034	TAACC	2	10	338787	338796	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_012034	TCAAA	2	10	340850	340859	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_012034	AAAAC	2	10	340864	340873	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_012034	ATTTT	2	10	344590	344599	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012034	ATGAA	2	10	353437	353446	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012034	TAAAA	2	10	356308	356317	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012034	TTTTA	2	10	360890	360899	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012034	ATATA	2	10	363743	363752	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012034	ATATA	2	10	371464	371473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012034	AAAAT	2	10	375795	375804	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012034	ATATC	2	10	379010	379019	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_012034	TCTTT	2	10	380375	380384	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_012034	CATAT	2	10	380475	380484	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_012034	TTTTA	2	10	381061	381070	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012034	TAAAA	2	10	389468	389477	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012034	ATAAA	2	10	391604	391613	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012034	AACAA	2	10	394940	394949	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_012034	TTAAA	2	10	407570	407579	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012034	GAAAA	2	10	419183	419192	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012034	TGATT	2	10	420635	420644	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012034	TGACG	2	10	427545	427554	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_012034	ATAAA	2	10	431545	431554	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012034	TAATT	2	10	437866	437875	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012034	TAGTT	2	10	438157	438166	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012034	TATTT	2	10	445021	445030	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012034	TATAA	2	10	445055	445064	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012034	TGGTG	2	10	450337	450346	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012034	TCGTG	2	10	451210	451219	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_012034	GGGAG	2	10	452516	452525	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012034	AGGGG	2	10	453890	453899	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012034	CCGAA	2	10	453922	453931	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_012034	AAAAG	2	10	465779	465788	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012034	ACGTT	2	10	466425	466434	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_012034	ATTTT	2	10	467264	467273	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012034	TTTTA	2	10	482707	482716	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012034	GATAA	2	10	500870	500879	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012034	AGAAA	2	10	521779	521788	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012034	TCTTG	2	10	521852	521861	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_012034	GTTTT	2	10	537922	537931	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012034	ATATA	2	10	541249	541258	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012034	CATTT	2	10	541928	541937	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_012034	ATTTT	2	10	542102	542111	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012034	TTTAA	2	10	546123	546132	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012034	GCAAA	2	10	546693	546702	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_012034	ATTAT	2	10	546817	546826	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012034	GAAGA	2	10	549613	549622	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012034	TTGTT	2	10	551074	551083	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012034	AGTAG	2	10	551457	551466	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012034	AATAA	2	10	551930	551939	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012034	GTTCT	2	10	559408	559417	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_012034	TTTTG	2	10	559709	559718	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012034	AATAC	2	10	559826	559835	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_012034	TATAT	2	10	561180	561189	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012034	AGAAA	2	10	563701	563710	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012034	AATAT	2	10	564043	564052	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012034	TAATA	2	10	565731	565740	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012034	AGAAA	2	10	568790	568799	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012034	AATTT	2	10	571372	571381	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012034	AATAT	2	10	586015	586024	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012034	AAATT	2	10	589663	589672	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012034	ATTTT	2	10	597762	597771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012034	AATAT	2	10	597835	597844	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012034	AAAAG	2	10	601775	601784	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012034	ATTAT	2	10	602750	602759	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_012034	ATTTT	2	10	685352	685361	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_012034	ATTTA	2	10	768167	768176	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_012034	TCAAG	2	10	1444512	1444521	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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286	NC_012034	TCTAT	2	10	1477742	1477751	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
287	NC_012034	TTTCA	2	10	1478245	1478254	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
288	NC_012034	TGCCC	2	10	1478897	1478906	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
289	NC_012034	TATTG	2	10	1497663	1497672	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_012034	ATTTT	2	10	1522550	1522559	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_012034	ACATC	2	10	1544957	1544966	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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295	NC_012034	TTATA	2	10	1563214	1563223	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_012034	CAAAA	2	10	1757261	1757270	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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365	NC_012034	TACTT	2	10	1997705	1997714	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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432	NC_012034	TATAA	2	10	2384596	2384605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_012034	TTTAT	2	10	2388056	2388065	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_012034	TTCTT	2	10	2392724	2392733	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
435	NC_012034	CTTTT	2	10	2394306	2394315	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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441	NC_012034	TAATT	2	10	2435210	2435219	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_012034	CAATA	2	10	2441665	2441674	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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444	NC_012034	TGAAT	2	10	2442513	2442522	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
445	NC_012034	ATATA	2	10	2449030	2449039	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_012034	ATATA	2	10	2453794	2453803	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_012034	TAAAA	2	10	2525960	2525969	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_012034	ACTCA	2	10	2527842	2527851	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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454	NC_012034	TACTT	2	10	2529351	2529360	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
455	NC_012034	AGTAA	2	10	2529600	2529609	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
456	NC_012034	GTACT	2	10	2531431	2531440	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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461	NC_012034	TAAAA	2	10	2555326	2555335	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_012034	TTTCT	2	10	2555939	2555948	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
463	NC_012034	TATTG	2	10	2556024	2556033	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
464	NC_012034	TTTTA	2	10	2559537	2559546	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_012034	TTTGT	2	10	2567671	2567680	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
466	NC_012034	GCTCC	2	10	2568758	2568767	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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470	NC_012034	ATTTT	2	10	2619547	2619556	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_012034	TTTGT	2	10	2625151	2625160	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
472	NC_012034	CAAGG	2	10	2628753	2628762	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
473	NC_012034	TGCTT	2	10	2632279	2632288	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
474	NC_012034	ATAAA	2	10	2646491	2646500	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_012034	TGCAT	2	10	2664658	2664667	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
476	NC_012034	CTTTT	2	10	2676877	2676886	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
477	NC_012034	ACATC	2	10	2680694	2680703	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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482	NC_012034	TCAAA	2	10	2689187	2689196	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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486	NC_012034	CTCCC	2	10	2705268	2705277	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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489	NC_012034	TAAAA	2	10	2707972	2707981	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_012034	GTTTC	2	10	2709568	2709577	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
491	NC_012034	TTTGT	2	10	2717680	2717689	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
492	NC_012034	TAAAA	2	10	2717751	2717760	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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494	NC_012034	CAAAA	2	10	2732946	2732955	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
495	NC_012034	TTAAA	2	10	2734272	2734281	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
496	NC_012034	ATTAA	2	10	2735283	2735292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
497	NC_012034	TTATA	2	10	2735709	2735718	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
498	NC_012034	TTTAA	2	10	2750053	2750062	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_012034	AATTT	2	10	2753665	2753674	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_012034	TAATA	2	10	2758579	2758588	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

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