MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725 chromosome

Total Repeats: 1329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012034	TTGA	2	8	6444	6451	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012034	GAAG	2	8	11669	11676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012034	GAAA	2	8	12246	12253	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012034	TAAA	2	8	12607	12614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012034	ATAA	2	8	23887	23894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012034	CAAG	2	8	23943	23950	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012034	GTAA	2	8	26684	26691	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012034	GTCT	2	8	26954	26961	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_012034	TTTG	2	8	27335	27342	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012034	TTTA	2	8	30855	30862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012034	CAAA	2	8	34052	34059	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_012034	ATTT	2	8	35897	35904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012034	AAAG	2	8	36727	36734	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012034	TTTG	2	8	38754	38761	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012034	AGGA	2	8	42298	42305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012034	GCCT	2	8	47856	47863	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_012034	TAAT	2	8	48701	48708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012034	AAGC	2	8	48710	48717	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012034	ATAA	2	8	48784	48791	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012034	TTTA	2	8	60995	61002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012034	TGAA	2	8	66433	66440	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012034	TTAA	2	8	67184	67191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012034	AAAG	2	8	70118	70125	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012034	AACT	2	8	70944	70951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_012034	AAAG	2	8	71721	71728	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012034	GCCA	2	8	83077	83084	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012034	TTAC	2	8	83227	83234	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_012034	CTTT	2	8	83340	83347	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_012034	GTAA	2	8	83375	83382	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012034	AGCC	2	8	83490	83497	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_012034	TGCA	2	8	83599	83606	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012034	AAAT	2	8	86755	86762	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012034	GTAT	2	8	87710	87717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012034	TAAA	2	8	89723	89730	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012034	GAAG	2	8	91891	91898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012034	AGGA	2	8	93963	93970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012034	CAAA	2	8	99162	99169	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_012034	ATAA	2	8	99192	99199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012034	ACTT	2	8	101497	101504	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012034	ATAA	2	8	106719	106726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012034	GAAG	2	8	106902	106909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012034	ATCG	2	8	108824	108831	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_012034	TAAA	2	8	109857	109864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012034	TAAA	2	8	109909	109916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012034	AAAT	2	8	110811	110818	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012034	TTAA	2	8	110855	110862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012034	AGTC	2	8	112086	112093	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_012034	TATT	2	8	112299	112306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012034	CTCC	2	8	114822	114829	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_012034	GTTT	2	8	114834	114841	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012034	AGGA	2	8	115113	115120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012034	TAAA	2	8	116243	116250	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012034	GAGT	2	8	116315	116322	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012034	ATCT	2	8	116580	116587	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_012034	ATAA	2	8	120541	120548	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012034	TGGG	2	8	120551	120558	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012034	GCAC	2	8	121262	121269	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_012034	TAAA	2	8	121851	121858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012034	CAAA	2	8	127978	127985	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_012034	TTTG	2	8	131880	131887	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012034	TTAT	2	8	131923	131930	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012034	CCTT	2	8	134704	134711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_012034	AGAA	2	8	141974	141981	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012034	ATTT	2	8	151574	151581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012034	AAAG	2	8	151684	151691	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012034	CATT	2	8	152029	152036	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_012034	AAGA	2	8	152670	152677	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012034	TGCC	2	8	153016	153023	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_012034	CTTT	2	8	153253	153260	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_012034	CTGT	2	8	153449	153456	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_012034	TGAT	2	8	155293	155300	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012034	AAAC	2	8	155939	155946	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_012034	AAAC	2	8	156019	156026	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_012034	AGGT	2	8	156215	156222	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012034	CTTT	2	8	156399	156406	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_012034	CTTT	2	8	157197	157204	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_012034	TAAT	2	8	157469	157476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012034	AATT	2	8	157518	157525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012034	AAGC	2	8	157849	157856	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_012034	AGTT	2	8	158240	158247	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012034	TGTT	2	8	158316	158323	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012034	CCGC	2	8	158694	158701	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_012034	TGTT	2	8	158959	158966	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012034	TTTC	2	8	160673	160680	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_012034	CTTT	2	8	160774	160781	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_012034	ATTT	2	8	161507	161514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012034	AAGC	2	8	161770	161777	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_012034	CAAT	2	8	164684	164691	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_012034	AGGC	2	8	165075	165082	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_012034	AAAT	2	8	165277	165284	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012034	TAAG	2	8	165592	165599	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012034	TACC	2	8	165635	165642	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_012034	GTCT	2	8	166263	166270	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_012034	AAGC	2	8	166342	166349	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_012034	TTTG	2	8	166649	166656	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012034	TTTC	2	8	166909	166916	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_012034	TTCT	2	8	166964	166971	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_012034	TATT	2	8	168069	168076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012034	GATA	2	8	168278	168285	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012034	AAAT	2	8	168311	168318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012034	TTGT	2	8	168388	168395	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012034	AAGA	2	8	168559	168566	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012034	TATT	2	8	177923	177930	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012034	ATTA	2	8	180581	180588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012034	AAAT	2	8	182735	182742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012034	AACC	2	8	182910	182917	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_012034	AAGT	3	12	183122	183133	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012034	CAAA	2	8	183350	183357	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_012034	ATTC	2	8	183456	183463	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_012034	TGCC	2	8	187074	187081	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_012034	AAAT	2	8	189160	189167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012034	CAAA	2	8	200027	200034	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_012034	AATT	2	8	200050	200057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012034	ATTT	2	8	200064	200071	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012034	CTTG	2	8	200088	200095	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_012034	TTTA	2	8	207328	207335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012034	AACA	2	8	207486	207493	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_012034	TCAA	2	8	209360	209367	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_012034	GAAT	2	8	211504	211511	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012034	AAAG	2	8	212238	212245	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012034	ATGA	2	8	223527	223534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012034	TGGA	2	8	236272	236279	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012034	CTCC	2	8	236286	236293	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
124	NC_012034	AAAG	2	8	237967	237974	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012034	AACA	2	8	244635	244642	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_012034	GTTT	2	8	256562	256569	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012034	AGGT	2	8	260628	260635	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012034	GCAA	2	8	263284	263291	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_012034	AAAC	2	8	268989	268996	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_012034	AAAG	2	8	272868	272875	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012034	TAAT	2	8	275659	275666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012034	TATT	2	8	276113	276120	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012034	AAGA	2	8	276608	276615	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012034	TTGT	2	8	278485	278492	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012034	TTAT	2	8	279147	279154	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012034	AAAG	2	8	280399	280406	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012034	TAAT	2	8	285016	285023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012034	TTTA	2	8	286199	286206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012034	TAAA	2	8	290439	290446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012034	ATTT	2	8	293255	293262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012034	ATTA	2	8	306647	306654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012034	AATT	2	8	306802	306809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012034	AAGG	2	8	307930	307937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012034	TCAT	2	8	311300	311307	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_012034	GTAT	2	8	311460	311467	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012034	TAAT	2	8	312661	312668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012034	TTTG	2	8	312673	312680	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012034	TTAC	2	8	313263	313270	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_012034	AAAT	2	8	316599	316606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012034	CTTT	2	8	318052	318059	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_012034	TCTT	2	8	318364	318371	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_012034	ATTT	2	8	318452	318459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_012034	TTCA	2	8	1021450	1021457	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

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