MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 20181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_012032	ATGG	2	8	3189019	3189026	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_012032	CTG	2	6	3189101	3189106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12503	NC_012032	GT	3	6	3190272	3190277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_012032	GAT	2	6	3190285	3190290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_012032	GAC	2	6	3190297	3190302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12506	NC_012032	AAC	2	6	3190354	3190359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12507	NC_012032	AC	3	6	3190418	3190423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12508	NC_012032	CCA	2	6	3190425	3190430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12509	NC_012032	GTC	2	6	3190448	3190453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_012032	CGA	2	6	3190536	3190541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12511	NC_012032	ATG	2	6	3190581	3190586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_012032	GAA	2	6	3190589	3190594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_012032	TC	3	6	3190629	3190634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12514	NC_012032	ATT	2	6	3190692	3190697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_012032	CAA	2	6	3190700	3190705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_012032	TGG	2	6	3191855	3191860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_012032	CGG	2	6	3191871	3191876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12518	NC_012032	GGGT	2	8	3191887	3191894	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_012032	CTCA	2	8	3191929	3191936	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12520	NC_012032	CAG	2	6	3191948	3191953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12521	NC_012032	AGT	2	6	3192003	3192008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_012032	CGG	2	6	3192018	3192023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12523	NC_012032	GGAAC	2	10	3192119	3192128	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12524	NC_012032	CGT	2	6	3192151	3192156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12525	NC_012032	TCA	2	6	3192190	3192195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12526	NC_012032	TGG	2	6	3192235	3192240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_012032	GGT	2	6	3192289	3192294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_012032	GTT	2	6	3192437	3192442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_012032	TGC	2	6	3192824	3192829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12530	NC_012032	ATC	2	6	3192913	3192918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12531	NC_012032	GCAT	2	8	3192930	3192937	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12532	NC_012032	GGT	2	6	3193012	3193017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_012032	CAC	2	6	3193160	3193165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12534	NC_012032	GGT	2	6	3193247	3193252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_012032	CAG	2	6	3193488	3193493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12536	NC_012032	CAC	2	6	3193499	3193504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12537	NC_012032	CAG	2	6	3193848	3193853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12538	NC_012032	GCT	2	6	3193857	3193862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12539	NC_012032	AGC	2	6	3193871	3193876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12540	NC_012032	AAG	2	6	3193903	3193908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_012032	CTAC	2	8	3193926	3193933	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12542	NC_012032	GAT	2	6	3193964	3193969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_012032	ACG	2	6	3193977	3193982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12544	NC_012032	ACA	2	6	3193989	3193994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12545	NC_012032	CA	4	8	3194060	3194067	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12546	NC_012032	TCC	2	6	3194081	3194086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12547	NC_012032	AG	3	6	3194106	3194111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12548	NC_012032	C	6	6	3194176	3194181	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12549	NC_012032	ACG	2	6	3194274	3194279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12550	NC_012032	CTC	2	6	3194309	3194314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12551	NC_012032	ACA	2	6	3194335	3194340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12552	NC_012032	CGC	2	6	3194390	3194395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12553	NC_012032	TTG	2	6	3195688	3195693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_012032	GCC	2	6	3195712	3195717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12555	NC_012032	TG	3	6	3196770	3196775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_012032	CTC	2	6	3197160	3197165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12557	NC_012032	TCT	2	6	3197617	3197622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12558	NC_012032	CATAG	2	10	3198147	3198156	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12559	NC_012032	TTTC	2	8	3199810	3199817	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12560	NC_012032	TCA	2	6	3199848	3199853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12561	NC_012032	AC	3	6	3199956	3199961	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12562	NC_012032	ATT	2	6	3199969	3199974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_012032	CTG	2	6	3199982	3199987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12564	NC_012032	TGAT	2	8	3200042	3200049	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_012032	CTG	2	6	3200054	3200059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12566	NC_012032	CCG	2	6	3200062	3200067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12567	NC_012032	TCA	2	6	3200869	3200874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12568	NC_012032	TGTT	2	8	3200897	3200904	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_012032	TAA	2	6	3201423	3201428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_012032	ATC	2	6	3201475	3201480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12571	NC_012032	TGC	2	6	3201513	3201518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12572	NC_012032	AC	3	6	3201531	3201536	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12573	NC_012032	CGT	2	6	3201553	3201558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12574	NC_012032	ATCGA	2	10	3201603	3201612	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12575	NC_012032	GAA	2	6	3201621	3201626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12576	NC_012032	T	6	6	3201645	3201650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12577	NC_012032	CTG	2	6	3201715	3201720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12578	NC_012032	GAA	2	6	3201722	3201727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_012032	TTA	2	6	3201807	3201812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12580	NC_012032	TTG	2	6	3201829	3201834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12581	NC_012032	GTC	2	6	3204996	3205001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12582	NC_012032	T	6	6	3205004	3205009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12583	NC_012032	GGA	2	6	3205947	3205952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12584	NC_012032	CCA	2	6	3207199	3207204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12585	NC_012032	TGA	2	6	3207560	3207565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12586	NC_012032	ACGC	2	8	3207625	3207632	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12587	NC_012032	AAC	2	6	3209317	3209322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12588	NC_012032	GTT	2	6	3210172	3210177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12589	NC_012032	CAA	2	6	3210194	3210199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12590	NC_012032	GA	3	6	3210273	3210278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12591	NC_012032	GAG	2	6	3214115	3214120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_012032	GAG	2	6	3214357	3214362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_012032	GGA	2	6	3214779	3214784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_012032	AGCG	2	8	3215395	3215402	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12595	NC_012032	GGA	2	6	3215827	3215832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_012032	AGT	2	6	3217124	3217129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12597	NC_012032	CA	3	6	3218492	3218497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12598	NC_012032	GTA	2	6	3218510	3218515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_012032	GAGC	2	8	3218617	3218624	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12600	NC_012032	GCA	2	6	3219546	3219551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12601	NC_012032	CGG	2	6	3219552	3219557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12602	NC_012032	CCG	3	9	3219561	3219569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12603	NC_012032	AGG	2	6	3219573	3219578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_012032	GTG	2	6	3219735	3219740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12605	NC_012032	TGT	2	6	3220626	3220631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12607	NC_012032	GAC	2	6	3220647	3220652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12608	NC_012032	GCC	2	6	3220705	3220710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12609	NC_012032	GCA	2	6	3220712	3220717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12610	NC_012032	GCA	2	6	3221464	3221469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12611	NC_012032	GTG	2	6	3224132	3224137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_012032	GGT	2	6	3224142	3224147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_012032	GAG	2	6	3224148	3224153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_012032	AAC	2	6	3224602	3224607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12615	NC_012032	TA	3	6	3224622	3224627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12616	NC_012032	TCC	2	6	3226143	3226148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12617	NC_012032	CT	3	6	3226150	3226155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12618	NC_012032	AAC	2	6	3226182	3226187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12619	NC_012032	TCT	2	6	3226952	3226957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12620	NC_012032	CTGC	2	8	3226981	3226988	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12621	NC_012032	TCA	2	6	3227013	3227018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12622	NC_012032	TAGA	2	8	3227023	3227030	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12623	NC_012032	GAG	2	6	3228105	3228110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12624	NC_012032	CAA	2	6	3228131	3228136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12625	NC_012032	TCA	2	6	3228143	3228148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12627	NC_012032	TAC	2	6	3230731	3230736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12752	NC_012032	AAT	2	6	3267508	3267513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12757	NC_012032	CTG	2	6	3268513	3268518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12758	NC_012032	GGC	2	6	3268706	3268711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12787	NC_012032	TC	3	6	3272423	3272428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12866	NC_012032	CATA	2	8	3288720	3288727	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12867	NC_012032	CCT	2	6	3289317	3289322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12873	NC_012032	TGA	2	6	3289526	3289531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12878	NC_012032	ATG	2	6	3289616	3289621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12879	NC_012032	CATTG	2	10	3289658	3289667	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12880	NC_012032	GCT	2	6	3289680	3289685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12882	NC_012032	ACAGC	2	10	3289775	3289784	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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