MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 20181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012032	ATTGG	2	10	1020877	1020886	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_012032	GC	3	6	1020894	1020899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4503	NC_012032	AATG	2	8	1021028	1021035	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_012032	CTT	2	6	1021075	1021080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_012032	CA	3	6	1021091	1021096	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4506	NC_012032	CCCGCT	2	12	1021110	1021121	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4507	NC_012032	GAAC	2	8	1021145	1021152	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4508	NC_012032	CGTG	2	8	1021161	1021168	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4509	NC_012032	GTTC	2	8	1021234	1021241	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4510	NC_012032	CA	3	6	1021247	1021252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4511	NC_012032	CGG	2	6	1021331	1021336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_012032	CGC	2	6	1021446	1021451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4513	NC_012032	GGT	2	6	1021470	1021475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_012032	CA	3	6	1021521	1021526	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4515	NC_012032	CATG	2	8	1021539	1021546	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4516	NC_012032	AAG	2	6	1021575	1021580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_012032	GAT	2	6	1021584	1021589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_012032	ACA	2	6	1022060	1022065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_012032	TCTG	2	8	1022069	1022076	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4520	NC_012032	TAG	2	6	1022082	1022087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_012032	AGCGA	2	10	1023360	1023369	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4522	NC_012032	GGGT	2	8	1023395	1023402	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_012032	CACC	2	8	1023416	1023423	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4524	NC_012032	CCT	2	6	1024644	1024649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4525	NC_012032	CCT	2	6	1027850	1027855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4526	NC_012032	GAT	2	6	1030286	1030291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_012032	C	6	6	1031970	1031975	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4528	NC_012032	ACG	2	6	1031992	1031997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_012032	CTC	2	6	1033283	1033288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4530	NC_012032	AACC	2	8	1038162	1038169	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4531	NC_012032	TTGA	2	8	1041964	1041971	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_012032	AT	3	6	1041979	1041984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_012032	AGA	2	6	1041987	1041992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_012032	GAT	2	6	1042538	1042543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_012032	ATC	2	6	1042581	1042586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_012032	TGG	2	6	1042630	1042635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_012032	G	7	7	1042659	1042665	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_012032	CGG	2	6	1042669	1042674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_012032	G	6	6	1042723	1042728	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_012032	CGG	2	6	1042732	1042737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_012032	G	6	6	1042805	1042810	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_012032	CGG	2	6	1042814	1042819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_012032	TGG	2	6	1042839	1042844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_012032	G	7	7	1042868	1042874	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_012032	TCG	2	6	1042877	1042882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_012032	G	7	7	1042932	1042938	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_012032	TCG	2	6	1042941	1042946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_012032	GGTAA	2	10	1042990	1042999	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_012032	G	7	7	1043015	1043021	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_012032	GGTAA	2	10	1043073	1043082	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_012032	CA	3	6	1043334	1043339	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4552	NC_012032	TCT	2	6	1043382	1043387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_012032	CAG	2	6	1043821	1043826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_012032	TGC	2	6	1043859	1043864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_012032	TTG	2	6	1043888	1043893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_012032	GAT	2	6	1043902	1043907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_012032	CAG	2	6	1043937	1043942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_012032	GC	3	6	1043970	1043975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4559	NC_012032	CGGT	2	8	1043977	1043984	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4560	NC_012032	GCA	3	9	1043985	1043993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_012032	CCGC	2	8	1044000	1044007	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4562	NC_012032	GTT	2	6	1044094	1044099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_012032	AAC	2	6	1044495	1044500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_012032	GCTC	2	8	1044538	1044545	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4565	NC_012032	TGC	2	6	1044584	1044589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_012032	T	6	6	1044717	1044722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_012032	CAC	2	6	1044782	1044787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4568	NC_012032	CGT	2	6	1044916	1044921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_012032	CCTGC	2	10	1045129	1045138	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4570	NC_012032	CCCG	2	8	1045168	1045175	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4571	NC_012032	TGA	2	6	1045289	1045294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_012032	AGG	2	6	1045313	1045318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_012032	TGA	3	9	1045351	1045359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_012032	CTG	2	6	1045380	1045385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_012032	CGG	2	6	1045387	1045392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_012032	ACGG	2	8	1045432	1045439	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4577	NC_012032	GGA	3	9	1045652	1045660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_012032	TC	3	6	1045719	1045724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4579	NC_012032	CCG	2	6	1045835	1045840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4580	NC_012032	CTG	2	6	1045858	1045863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_012032	CAA	2	6	1045886	1045891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_012032	GCAT	2	8	1045912	1045919	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4583	NC_012032	CGATG	2	10	1045927	1045936	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4584	NC_012032	GCA	2	6	1046020	1046025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_012032	CG	3	6	1046045	1046050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4586	NC_012032	ATTC	2	8	1046078	1046085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4587	NC_012032	GCG	2	6	1046108	1046113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_012032	G	6	6	1046211	1046216	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_012032	G	6	6	1046226	1046231	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_012032	GTGA	2	8	1046244	1046251	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_012032	TGT	2	6	1046329	1046334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_012032	GCA	2	6	1046368	1046373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_012032	ATG	2	6	1046407	1046412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_012032	CTG	2	6	1046448	1046453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_012032	AGC	2	6	1046455	1046460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_012032	G	6	6	1046574	1046579	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_012032	GTGA	2	8	1046592	1046599	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_012032	GCA	2	6	1046716	1046721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_012032	ATG	2	6	1046755	1046760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_012032	CTG	2	6	1046796	1046801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_012032	AGC	2	6	1046803	1046808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_012032	G	6	6	1046907	1046912	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_012032	G	6	6	1046922	1046927	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_012032	GTGA	2	8	1046940	1046947	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_012032	GCA	2	6	1047064	1047069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_012032	ATCC	2	8	1047122	1047129	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4607	NC_012032	TCA	2	6	1047311	1047316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_012032	CCA	2	6	1047325	1047330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4609	NC_012032	CAC	2	6	1047339	1047344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4610	NC_012032	CCA	2	6	1047349	1047354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4611	NC_012032	CTA	2	6	1048758	1048763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_012032	CAC	2	6	1048778	1048783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4613	NC_012032	TC	3	6	1048900	1048905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4614	NC_012032	AG	3	6	1048986	1048991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_012032	GCCT	2	8	1049010	1049017	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4616	NC_012032	ATC	2	6	1049020	1049025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_012032	GTA	2	6	1051222	1051227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_012032	CTCC	2	8	1051245	1051252	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4619	NC_012032	GCC	2	6	1051265	1051270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4620	NC_012032	TCC	2	6	1052338	1052343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4621	NC_012032	CAC	2	6	1052402	1052407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4622	NC_012032	T	6	6	1052419	1052424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_012032	CAA	2	6	1052425	1052430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_012032	ATC	2	6	1055290	1055295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_012032	CGC	2	6	1055346	1055351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4626	NC_012032	CAT	2	6	1055365	1055370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_012032	TCC	2	6	1056450	1056455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4628	NC_012032	TGGGG	2	10	1056476	1056485	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_012032	GC	4	8	1056575	1056582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4630	NC_012032	TCC	2	6	1056621	1056626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4631	NC_012032	GGGC	2	8	1056639	1056646	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4632	NC_012032	C	6	6	1056661	1056666	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4633	NC_012032	CGTGG	2	10	1056728	1056737	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4634	NC_012032	GTGGC	2	10	1056738	1056747	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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4636	NC_012032	CCTG	2	8	1056865	1056872	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4641	NC_012032	GGGC	2	8	1057165	1057172	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4642	NC_012032	CACCC	2	10	1057188	1057197	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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4762	NC_012032	TCA	2	6	1085722	1085727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4763	NC_012032	ACC	2	6	1087122	1087127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4764	NC_012032	TGG	2	6	1087175	1087180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4766	NC_012032	CCA	2	6	1087247	1087252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4767	NC_012032	GGT	2	6	1087256	1087261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4884	NC_012032	GTA	2	6	1111231	1111236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4886	NC_012032	CAG	2	6	1111327	1111332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4887	NC_012032	TCT	2	6	1111353	1111358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4888	NC_012032	TCC	2	6	1111374	1111379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4889	NC_012032	GCC	2	6	1111388	1111393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4890	NC_012032	GAAGT	2	10	1111400	1111409	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4891	NC_012032	G	7	7	1111451	1111457	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4892	NC_012032	ATG	2	6	1111559	1111564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4893	NC_012032	ACACC	2	10	1111615	1111624	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4894	NC_012032	ATC	2	6	1111664	1111669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4901	NC_012032	TGAG	2	8	1113930	1113937	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4997	NC_012032	CGC	2	6	1129629	1129634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4998	NC_012032	AC	3	6	1129636	1129641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4999	NC_012032	GGCAA	2	10	1129654	1129663	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5000	NC_012032	TGA	2	6	1129769	1129774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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