MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742502

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011885	GTTCA	2	10	2740	2749	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011885	CTAAC	2	10	6468	6477	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_011885	TTGGC	2	10	14145	14154	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011885	ACCCG	2	10	18915	18924	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_011885	CCTGA	2	10	19059	19068	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_011885	GAGAA	2	10	30594	30603	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011885	AACTC	2	10	36674	36683	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_011885	ATTTA	2	10	46343	46352	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011885	AACCA	2	10	50085	50094	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_011885	ATGAG	2	10	51182	51191	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011885	CGTAC	2	10	53291	53300	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_011885	AGTCT	2	10	53301	53310	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011885	CGAAC	2	10	53369	53378	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_011885	TTGGC	2	10	68340	68349	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011885	CTAGG	2	10	70998	71007	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011885	TCCCT	2	10	71120	71129	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_011885	AGCCA	2	10	78810	78819	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_011885	GAGCT	2	10	81092	81101	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011885	TCATG	2	10	81422	81431	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011885	TTGTA	2	10	90430	90439	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011885	CAATT	2	10	102063	102072	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011885	TATGA	2	10	105578	105587	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011885	TGAGG	2	10	108741	108750	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011885	ACTGG	2	10	112321	112330	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011885	TTGAC	2	10	120621	120630	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011885	GTTTT	2	10	130747	130756	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011885	CTCAT	2	10	132118	132127	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_011885	TCAAC	2	10	132948	132957	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_011885	CGAAA	2	10	134006	134015	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_011885	AACTG	2	10	143570	143579	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011885	TTGGT	2	10	151116	151125	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011885	CCCAA	2	10	153772	153781	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
33	NC_011885	TCTAC	2	10	165767	165776	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_011885	TTGCC	2	10	165846	165855	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_011885	GACCA	2	10	169897	169906	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_011885	CCAAA	2	10	172421	172430	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_011885	AGCAG	2	10	176897	176906	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.