MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742502

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011885	TAAG	2	8	2601	2608	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011885	AGCT	2	8	2690	2697	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011885	TCGG	2	8	4624	4631	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011885	ATTG	2	8	7431	7438	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011885	TAAG	2	8	7459	7466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011885	ACTT	2	8	8088	8095	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011885	AGTA	2	8	8103	8110	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011885	AGCG	2	8	8115	8122	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011885	GAAC	2	8	9585	9592	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011885	TACT	2	8	13752	13759	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011885	GTAA	2	8	15445	15452	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011885	GGCC	2	8	15557	15564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011885	TAAG	2	8	16833	16840	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011885	TCCT	2	8	17100	17107	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011885	ATGA	2	8	18565	18572	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011885	GCAA	2	8	23679	23686	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011885	ATCA	2	8	23900	23907	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011885	CTAA	2	8	23951	23958	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011885	AGAT	2	8	28612	28619	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011885	TGGC	2	8	31024	31031	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011885	AGGG	2	8	35641	35648	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011885	GTTG	2	8	36329	36336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011885	GAAC	2	8	36698	36705	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011885	GACT	2	8	38849	38856	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011885	GGAC	2	8	38953	38960	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011885	ATTA	2	8	42959	42966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011885	ATCG	2	8	43018	43025	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011885	GGAA	2	8	43327	43334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011885	GCTG	2	8	46535	46542	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011885	AGGT	2	8	46553	46560	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011885	TGAA	2	8	47230	47237	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011885	CTAT	2	8	50769	50776	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011885	ACTC	2	8	51391	51398	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011885	TACC	2	8	55115	55122	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011885	AGAC	2	8	55910	55917	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011885	TGAG	2	8	57247	57254	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011885	TCTA	2	8	60512	60519	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011885	ATTT	2	8	63662	63669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011885	AGGC	2	8	67654	67661	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011885	TTCC	2	8	67737	67744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011885	TCAA	2	8	68472	68479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011885	CACC	2	8	71014	71021	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_011885	CTCG	2	8	71107	71114	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011885	ACTC	2	8	71768	71775	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011885	TGCC	2	8	74817	74824	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011885	TTAG	2	8	75100	75107	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011885	TGAT	2	8	75151	75158	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011885	CTTG	2	8	75371	75378	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011885	TGAT	2	8	80503	80510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011885	GCAG	2	8	80622	80629	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011885	TTTA	2	8	80925	80932	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011885	GGGA	2	8	81157	81164	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011885	TAAA	2	8	81451	81458	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011885	GACC	2	8	81479	81486	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011885	TGGA	2	8	81727	81734	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011885	CTAA	2	8	81986	81993	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011885	AATG	2	8	83595	83602	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011885	GTCC	2	8	86086	86093	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011885	AGTC	2	8	86190	86197	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011885	CAAC	2	8	86460	86467	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011885	GCAA	2	8	89331	89338	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011885	GAAG	2	8	90071	90078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011885	GACG	2	8	90205	90212	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011885	GTTG	2	8	90245	90252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011885	CTAA	2	8	90667	90674	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011885	ATCT	2	8	92373	92380	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011885	ATGG	2	8	94517	94524	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011885	GATC	2	8	94546	94553	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011885	TCAA	2	8	106442	106449	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011885	CGGT	2	8	106826	106833	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_011885	TTAA	2	8	107154	107161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011885	CTTA	2	8	107628	107635	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011885	CCAT	2	8	108334	108341	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011885	TGGA	2	8	108534	108541	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011885	GAGT	2	8	112258	112265	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011885	CCCA	2	8	112405	112412	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_011885	GAAT	2	8	115569	115576	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011885	CCAG	2	8	116667	116674	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011885	TCCA	2	8	122276	122283	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011885	ATTT	2	8	122330	122337	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011885	TTGA	2	8	128291	128298	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011885	TGCT	2	8	128375	128382	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011885	TAGA	2	8	128409	128416	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011885	TTAC	2	8	128540	128547	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011885	ACAA	2	8	132473	132480	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011885	ACTC	2	8	132527	132534	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011885	TCGA	2	8	132855	132862	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011885	GATC	2	8	133268	133275	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011885	GCCT	2	8	133310	133317	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011885	CGAT	2	8	133841	133848	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011885	AATT	2	8	134124	134131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011885	CTGG	2	8	134846	134853	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011885	GGGA	2	8	134888	134895	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011885	AAAG	2	8	138716	138723	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011885	AACC	2	8	138898	138905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_011885	CAAT	2	8	150316	150323	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011885	GGGA	2	8	151094	151101	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011885	GTTC	2	8	156651	156658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011885	ATTT	2	8	156695	156702	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011885	CTTC	2	8	159307	159314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_011885	ATTT	2	8	163232	163239	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011885	TGAT	2	8	165953	165960	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011885	TGGT	2	8	166176	166183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011885	CTTA	2	8	168399	168406	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011885	AAAC	2	8	169991	169998	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011885	TTTG	2	8	171685	171692	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011885	TGAG	2	8	171713	171720	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011885	TTCA	2	8	171765	171772	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_011885	GAAT	2	8	171931	171938	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011885	AATA	2	8	171999	172006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011885	AATG	2	8	172023	172030	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011885	GACA	2	8	172182	172189	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011885	ATTG	2	8	172205	172212	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011885	TTTG	2	8	177898	177905	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.