MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 7506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011884	CGT	2	6	28	33	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011884	CAA	2	6	1453	1458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011884	CTA	4	12	1693	1704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011884	AGT	3	9	1727	1735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011884	TAA	2	6	1813	1818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011884	CCG	2	6	1853	1858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_011884	GCT	2	6	1860	1865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011884	CTG	2	6	3110	3115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011884	ATT	2	6	3120	3125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011884	AGC	2	6	3284	3289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011884	AGA	2	6	3511	3516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011884	GAG	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011884	GGT	2	6	3885	3890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011884	TGA	2	6	3958	3963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011884	GAA	3	9	4033	4041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011884	TTG	2	6	4216	4221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011884	ATG	2	6	4242	4247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011884	GAG	2	6	8015	8020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011884	CAG	2	6	8114	8119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011884	ACC	2	6	8201	8206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_011884	CGC	2	6	9550	9555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_011884	AAT	2	6	9665	9670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011884	TGC	2	6	10456	10461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011884	AGC	2	6	12855	12860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011884	TTG	2	6	14045	14050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011884	AAG	2	6	15243	15248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011884	CTC	2	6	15298	15303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_011884	TCA	2	6	15316	15321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011884	TCA	2	6	15338	15343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011884	GAA	2	6	15376	15381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011884	GCT	2	6	17444	17449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011884	CAG	2	6	19727	19732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011884	TTC	2	6	20636	20641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011884	GCT	2	6	21405	21410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011884	GGT	2	6	22400	22405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011884	ATT	2	6	25324	25329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011884	TGA	2	6	25336	25341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011884	TAC	2	6	25486	25491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011884	GAA	2	6	25511	25516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011884	GAA	2	6	25653	25658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011884	ATC	2	6	25753	25758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011884	GCC	2	6	25826	25831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_011884	AAC	2	6	26091	26096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011884	ATA	2	6	26326	26331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011884	GTT	2	6	26384	26389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011884	GAC	2	6	28937	28942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011884	TGC	2	6	29356	29361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011884	AGC	2	6	30351	30356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011884	CAG	2	6	31034	31039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011884	CTG	2	6	31471	31476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011884	CCA	2	6	31621	31626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_011884	ATA	2	6	33562	33567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011884	TGA	2	6	34337	34342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011884	TGA	2	6	37518	37523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011884	TGG	2	6	38506	38511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011884	CTA	2	6	39506	39511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011884	CAG	2	6	39552	39557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011884	CCT	2	6	39619	39624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_011884	GTC	2	6	39675	39680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011884	TCT	2	6	41681	41686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011884	TCT	2	6	41739	41744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011884	CAA	2	6	43253	43258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011884	AAC	2	6	43306	43311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011884	TTG	2	6	43540	43545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011884	ATT	2	6	43569	43574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011884	CGC	2	6	43576	43581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_011884	ACC	2	6	43926	43931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_011884	AAT	3	9	43945	43953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011884	TAG	2	6	44059	44064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011884	ACA	2	6	47350	47355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011884	GAA	2	6	47390	47395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011884	ACC	2	6	47576	47581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_011884	ATA	3	9	47599	47607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011884	GCT	2	6	47612	47617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011884	AAG	2	6	47746	47751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011884	TTG	2	6	47757	47762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011884	TTG	2	6	47837	47842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011884	TGG	2	6	50499	50504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011884	CAG	2	6	50533	50538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011884	GAG	2	6	52451	52456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011884	CCA	2	6	52537	52542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_011884	CTG	2	6	52626	52631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011884	AAT	2	6	52936	52941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011884	CCA	2	6	53325	53330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_011884	CTG	3	9	53543	53551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011884	GTA	2	6	53572	53577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011884	GAG	2	6	53631	53636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011884	CAT	2	6	53638	53643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011884	AGT	2	6	53658	53663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011884	AAT	2	6	53842	53847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011884	CAG	2	6	54254	54259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011884	GGT	2	6	54267	54272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011884	TGG	2	6	54301	54306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011884	GTC	2	6	54311	54316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011884	TGT	2	6	54331	54336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011884	TGA	2	6	54337	54342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011884	CAG	2	6	54438	54443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011884	TGA	2	6	54503	54508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011884	GTT	3	9	54569	54577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011884	TTC	2	6	54600	54605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011884	CCT	2	6	54829	54834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_011884	CCG	2	6	54843	54848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_011884	GGT	2	6	54906	54911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011884	CTG	2	6	54945	54950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011884	GGA	2	6	55042	55047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011884	TGA	2	6	55123	55128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011884	GCC	2	6	55174	55179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_011884	CTG	2	6	56482	56487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011884	CTG	2	6	56491	56496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011884	GGA	2	6	59366	59371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011884	TCT	2	6	59480	59485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011884	TAA	2	6	59673	59678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011884	CAA	2	6	61039	61044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011884	TGC	2	6	61163	61168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011884	ACC	2	6	61205	61210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_011884	TGG	2	6	61239	61244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011884	AAG	2	6	62856	62861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011884	TGC	2	6	64247	64252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011884	GAA	2	6	64323	64328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011884	GAA	2	6	64341	64346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011884	AGA	2	6	64970	64975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011884	GTT	2	6	65289	65294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011884	GTA	2	6	68275	68280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011884	TTC	2	6	68323	68328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011884	TAT	2	6	71673	71678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011884	TCT	2	6	71809	71814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011884	TAC	2	6	71926	71931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011884	TGG	2	6	71975	71980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011884	GCT	2	6	71989	71994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011884	ATT	2	6	72028	72033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011884	TGC	2	6	72194	72199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011884	TTC	2	6	72247	72252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011884	TCC	2	6	72281	72286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_011884	CGA	2	6	72407	72412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011884	GTT	2	6	72438	72443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011884	CGT	2	6	72571	72576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011884	GCT	2	6	72722	72727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011884	CTG	2	6	72832	72837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011884	CTG	2	6	72885	72890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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