MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 13023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011884	TGCC	2	8	1722555	1722562	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4002	NC_011884	CT	3	6	1725140	1725145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4003	NC_011884	ATT	2	6	1725164	1725169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_011884	AGC	2	6	1725211	1725216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_011884	AG	3	6	1725228	1725233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_011884	TATT	2	8	1725240	1725247	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_011884	T	7	7	1725262	1725268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_011884	GTAA	2	8	1725316	1725323	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_011884	TCC	2	6	1725339	1725344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4010	NC_011884	GAT	2	6	1725410	1725415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_011884	GGCA	2	8	1725504	1725511	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4012	NC_011884	ATGG	2	8	1725528	1725535	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_011884	CGA	2	6	1725641	1725646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_011884	CTG	2	6	1728143	1728148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_011884	GTCA	2	8	1728209	1728216	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4016	NC_011884	GGA	2	6	1729694	1729699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_011884	CA	3	6	1730893	1730898	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_011884	TTAAA	2	10	1730961	1730970	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_011884	TAA	2	6	1731078	1731083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_011884	C	6	6	1731085	1731090	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4021	NC_011884	GGT	2	6	1731091	1731096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_011884	ATT	2	6	1731115	1731120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_011884	TCC	2	6	1733008	1733013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_011884	GAT	2	6	1733120	1733125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_011884	CAAT	2	8	1734395	1734402	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4026	NC_011884	TTTA	2	8	1735018	1735025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_011884	GCT	3	9	1735649	1735657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_011884	GTAA	2	8	1735829	1735836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_011884	ATA	2	6	1735846	1735851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_011884	GGA	2	6	1735881	1735886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_011884	TGT	2	6	1737685	1737690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_011884	T	7	7	1737746	1737752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_011884	AGA	2	6	1737794	1737799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_011884	GAT	2	6	1737840	1737845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_011884	A	6	6	1737849	1737854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_011884	C	6	6	1740867	1740872	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4037	NC_011884	AAAGA	2	10	1740969	1740978	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_011884	AAGC	2	8	1742322	1742329	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4039	NC_011884	ACT	2	6	1742385	1742390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_011884	TCG	2	6	1742433	1742438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_011884	TAGA	2	8	1742582	1742589	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_011884	AGA	2	6	1742642	1742647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_011884	CAAT	2	8	1742682	1742689	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4044	NC_011884	AGTT	2	8	1742693	1742700	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_011884	CAGA	2	8	1743053	1743060	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4046	NC_011884	TA	3	6	1743093	1743098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_011884	AGA	2	6	1743124	1743129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_011884	GCT	2	6	1743255	1743260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_011884	AGG	2	6	1743327	1743332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_011884	T	6	6	1744775	1744780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_011884	GAG	2	6	1745369	1745374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_011884	ATC	2	6	1746805	1746810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_011884	AGC	2	6	1746866	1746871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_011884	GT	3	6	1746885	1746890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_011884	AGG	2	6	1746921	1746926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_011884	GGAT	2	8	1746973	1746980	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_011884	GTA	2	6	1747109	1747114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_011884	AAT	2	6	1747161	1747166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_011884	ATTG	2	8	1747182	1747189	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_011884	AGC	2	6	1747269	1747274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_011884	TCTCTA	2	12	1747301	1747312	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_011884	ATT	2	6	1747363	1747368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_011884	CTT	2	6	1747378	1747383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_011884	A	6	6	1747406	1747411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_011884	TAA	2	6	1747466	1747471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_011884	TG	3	6	1749235	1749240	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_011884	ATG	2	6	1750687	1750692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_011884	AGGG	2	8	1750697	1750704	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_011884	CT	3	6	1750724	1750729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4070	NC_011884	TA	3	6	1750749	1750754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_011884	CTA	2	6	1752961	1752966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_011884	ACT	2	6	1752976	1752981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_011884	CCT	2	6	1753052	1753057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4074	NC_011884	CGAT	2	8	1754793	1754800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4075	NC_011884	T	6	6	1754903	1754908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_011884	GTT	2	6	1754923	1754928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_011884	TGTC	2	8	1754995	1755002	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4078	NC_011884	AAACC	2	10	1755011	1755020	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4079	NC_011884	GA	3	6	1757078	1757083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_011884	TAG	2	6	1758417	1758422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_011884	GGGAT	2	10	1758426	1758435	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_011884	GAG	2	6	1758443	1758448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_011884	GA	4	8	1759586	1759593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_011884	AG	3	6	1759594	1759599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_011884	TAT	2	6	1759649	1759654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_011884	TGC	2	6	1759687	1759692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_011884	TTC	2	6	1759712	1759717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_011884	GCGCCT	2	12	1759740	1759751	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_011884	GGT	2	6	1759809	1759814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_011884	CCT	2	6	1759830	1759835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4091	NC_011884	AGC	2	6	1759857	1759862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_011884	CCCAGC	2	12	1759895	1759906	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4093	NC_011884	CATCTT	2	12	1759920	1759931	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_011884	CAG	2	6	1760531	1760536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_011884	TAA	2	6	1760542	1760547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_011884	AAT	2	6	1760553	1760558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_011884	AGG	2	6	1760663	1760668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_011884	TC	3	6	1760941	1760946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4099	NC_011884	TTAA	2	8	1763011	1763018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_011884	AGG	2	6	1763029	1763034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_011884	CAG	2	6	1763042	1763047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_011884	A	6	6	1763060	1763065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_011884	AG	3	6	1763077	1763082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_011884	GA	3	6	1763168	1763173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_011884	TG	3	6	1764228	1764233	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_011884	AG	3	6	1764242	1764247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_011884	C	6	6	1764300	1764305	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4108	NC_011884	TAA	2	6	1764349	1764354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_011884	TTGA	2	8	1765457	1765464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_011884	CTG	2	6	1765842	1765847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_011884	TTCC	2	8	1767226	1767233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4112	NC_011884	TGAG	2	8	1767269	1767276	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_011884	CT	3	6	1767308	1767313	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4114	NC_011884	AG	3	6	1770128	1770133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_011884	GTGG	2	8	1770271	1770278	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_011884	TCGA	2	8	1771652	1771659	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4117	NC_011884	TTA	2	6	1771676	1771681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_011884	CAA	2	6	1771724	1771729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_011884	A	7	7	1771758	1771764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_011884	CAG	2	6	1771793	1771798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_011884	GAC	2	6	1771818	1771823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_011884	G	6	6	1772773	1772778	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_011884	AGT	2	6	1772785	1772790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_011884	TTG	2	6	1772792	1772797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_011884	TAG	2	6	1772870	1772875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_011884	TAC	2	6	1772909	1772914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_011884	TCT	2	6	1772979	1772984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_011884	TTG	2	6	1772990	1772995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_011884	CCT	2	6	1773033	1773038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4130	NC_011884	ATAA	2	8	1773136	1773143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_011884	TGG	2	6	1773211	1773216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_011884	GA	3	6	1773267	1773272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_011884	G	6	6	1773407	1773412	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_011884	CTGA	2	8	1773439	1773446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4256	NC_011884	T	7	7	1834080	1834086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_011884	TGAT	2	8	1834132	1834139	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4264	NC_011884	CAG	2	6	1834743	1834748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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