MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 13023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011884	TA	3	6	1100183	1100188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_011884	CCAG	2	8	1102993	1103000	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2503	NC_011884	GCA	2	6	1104276	1104281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_011884	GTT	2	6	1104372	1104377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_011884	CCT	2	6	1104378	1104383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2506	NC_011884	TGTTT	2	10	1104519	1104528	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_011884	CTC	2	6	1107870	1107875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2508	NC_011884	TCC	2	6	1109496	1109501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2509	NC_011884	GA	3	6	1109530	1109535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_011884	CCT	2	6	1109553	1109558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2511	NC_011884	TGA	2	6	1109576	1109581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_011884	TGC	2	6	1109593	1109598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_011884	T	6	6	1109670	1109675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_011884	TC	3	6	1110236	1110241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2515	NC_011884	G	6	6	1110260	1110265	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_011884	CCG	2	6	1111215	1111220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2517	NC_011884	CCTG	2	8	1111731	1111738	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2518	NC_011884	GATT	2	8	1113573	1113580	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_011884	T	6	6	1113579	1113584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_011884	TGAT	2	8	1113608	1113615	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_011884	CAG	2	6	1113637	1113642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_011884	ACCTG	2	10	1113666	1113675	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2523	NC_011884	GT	3	6	1113679	1113684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_011884	TTTTGA	2	12	1114053	1114064	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_011884	GAT	2	6	1114072	1114077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_011884	TCT	2	6	1114143	1114148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_011884	CTAATC	2	12	1114253	1114264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_011884	CAG	2	6	1114290	1114295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2529	NC_011884	AGG	2	6	1114307	1114312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_011884	AAG	2	6	1114337	1114342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_011884	GCA	2	6	1114350	1114355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_011884	TAA	2	6	1114365	1114370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_011884	AGA	2	6	1115313	1115318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_011884	TGC	2	6	1115321	1115326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_011884	GTT	2	6	1115995	1116000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_011884	TC	3	6	1116081	1116086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2537	NC_011884	CAG	2	6	1118715	1118720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_011884	TC	3	6	1118759	1118764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2539	NC_011884	TC	3	6	1120834	1120839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2540	NC_011884	TA	3	6	1120919	1120924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_011884	A	6	6	1120942	1120947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_011884	AT	3	6	1121041	1121046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_011884	GCT	2	6	1121057	1121062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2544	NC_011884	AAC	2	6	1121146	1121151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_011884	CTG	2	6	1121171	1121176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_011884	CTA	2	6	1121233	1121238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_011884	AAT	2	6	1121252	1121257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_011884	CTG	2	6	1121294	1121299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_011884	CGGG	2	8	1121341	1121348	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2550	NC_011884	CTAC	2	8	1122999	1123006	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2551	NC_011884	TGA	2	6	1123033	1123038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_011884	GCG	2	6	1123086	1123091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_011884	TCC	2	6	1123100	1123105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2554	NC_011884	AGACGA	2	12	1123108	1123119	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2555	NC_011884	TTGC	2	8	1123144	1123151	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2556	NC_011884	TGT	2	6	1123204	1123209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_011884	CAG	2	6	1125149	1125154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_011884	GCGAT	2	10	1125224	1125233	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2559	NC_011884	TCC	2	6	1128132	1128137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2560	NC_011884	AAG	2	6	1128216	1128221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_011884	GA	3	6	1128231	1128236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_011884	CTG	2	6	1128273	1128278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_011884	TAA	2	6	1128279	1128284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_011884	TG	3	6	1128331	1128336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_011884	GGT	2	6	1128395	1128400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_011884	ATAA	2	8	1128443	1128450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_011884	CCA	2	6	1128523	1128528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2568	NC_011884	TTGG	2	8	1128538	1128545	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_011884	GAT	2	6	1128556	1128561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_011884	TAC	2	6	1128585	1128590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_011884	TCGAGG	2	12	1129257	1129268	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2572	NC_011884	A	6	6	1129269	1129274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_011884	CTT	2	6	1132663	1132668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2574	NC_011884	AAT	2	6	1133603	1133608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_011884	AGG	2	6	1134951	1134956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_011884	T	6	6	1134960	1134965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_011884	TTAGG	2	10	1136398	1136407	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_011884	CTGAA	2	10	1137451	1137460	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2579	NC_011884	ATA	2	6	1139609	1139614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_011884	CCT	2	6	1139627	1139632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2581	NC_011884	AAAG	2	8	1139634	1139641	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_011884	ATCC	2	8	1139765	1139772	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2583	NC_011884	GTTA	2	8	1140302	1140309	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_011884	GGA	2	6	1140740	1140745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_011884	CTG	2	6	1145658	1145663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2586	NC_011884	TTTA	2	8	1146614	1146621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_011884	A	6	6	1146621	1146626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_011884	ATG	2	6	1146679	1146684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_011884	TGG	2	6	1146693	1146698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_011884	TGT	2	6	1147489	1147494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_011884	ATT	2	6	1147869	1147874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_011884	AAGA	2	8	1147980	1147987	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_011884	GCT	2	6	1148705	1148710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_011884	CCT	2	6	1149839	1149844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2595	NC_011884	GAT	2	6	1149921	1149926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_011884	GAG	2	6	1150048	1150053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_011884	CAG	2	6	1152253	1152258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_011884	TAAAG	2	10	1152326	1152335	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_011884	T	6	6	1152337	1152342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_011884	AGAC	2	8	1152367	1152374	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2601	NC_011884	CCT	2	6	1152419	1152424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2602	NC_011884	AGC	2	6	1152429	1152434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_011884	T	6	6	1152453	1152458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_011884	AT	3	6	1154809	1154814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_011884	TCT	3	9	1156184	1156192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_011884	G	6	6	1157242	1157247	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_011884	TTA	2	6	1157251	1157256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_011884	GATA	2	8	1157274	1157281	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_011884	A	6	6	1157344	1157349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_011884	CTG	2	6	1157389	1157394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_011884	CT	4	8	1157481	1157488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2612	NC_011884	G	6	6	1157527	1157532	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_011884	TTGT	2	8	1157545	1157552	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_011884	TTA	2	6	1157613	1157618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_011884	TTGT	2	8	1158865	1158872	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_011884	CACAA	2	10	1158948	1158957	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
2617	NC_011884	CTA	2	6	1158962	1158967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_011884	AG	3	6	1159008	1159013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_011884	GCA	2	6	1159031	1159036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_011884	GCA	2	6	1159088	1159093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2621	NC_011884	TTA	2	6	1160757	1160762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_011884	GGT	2	6	1160834	1160839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_011884	CAA	2	6	1160840	1160845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_011884	CAG	2	6	1160863	1160868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_011884	GTC	2	6	1160987	1160992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2626	NC_011884	ACC	2	6	1161011	1161016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2627	NC_011884	GCC	2	6	1161060	1161065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2628	NC_011884	TGC	2	6	1161078	1161083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_011884	ATCG	2	8	1161103	1161110	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2630	NC_011884	CCG	2	6	1161229	1161234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2631	NC_011884	GTTGTG	2	12	1161263	1161274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_011884	GGC	2	6	1161361	1161366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2633	NC_011884	GATG	2	8	1161454	1161461	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_011884	TGG	2	6	1161558	1161563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2644	NC_011884	CGTG	2	8	1162179	1162186	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2645	NC_011884	AAGC	2	8	1162204	1162211	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2759	NC_011884	TTTC	2	8	1208333	1208340	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2762	NC_011884	TCAA	2	8	1210168	1210175	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2763	NC_011884	ATT	2	6	1211167	1211172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2765	NC_011884	ATT	2	6	1211268	1211273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2774	NC_011884	AAAT	2	8	1217110	1217117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2877	NC_011884	TAGCA	2	10	1248406	1248415	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2878	NC_011884	TCTA	2	8	1250364	1250371	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2884	NC_011884	GCC	2	6	1250652	1250657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2888	NC_011884	ATT	2	6	1250935	1250940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2889	NC_011884	ATC	2	6	1250964	1250969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2893	NC_011884	GAAC	2	8	1251942	1251949	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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