MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 13023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011884	CAT	2	6	636628	636633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_011884	AGG	2	6	640011	640016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_011884	ATG	2	6	640030	640035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_011884	GCTTC	2	10	640141	640150	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1505	NC_011884	CTC	2	6	640183	640188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_011884	CAGA	2	8	640195	640202	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_011884	CTTT	2	8	640216	640223	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1508	NC_011884	GA	4	8	640267	640274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_011884	ATC	2	6	640284	640289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_011884	TGC	2	6	641563	641568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_011884	ATT	2	6	641596	641601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_011884	GTT	2	6	641657	641662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_011884	TCA	2	6	641678	641683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_011884	GAG	2	6	641707	641712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_011884	CCT	2	6	643623	643628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_011884	CGC	2	6	647729	647734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_011884	ATT	2	6	647745	647750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_011884	AGC	2	6	647851	647856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_011884	GGAT	2	8	647863	647870	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_011884	GA	3	6	648342	648347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_011884	AATGG	2	10	648364	648373	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_011884	ATC	2	6	648401	648406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_011884	TTGG	2	8	650773	650780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_011884	AGG	2	6	653368	653373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_011884	AT	4	8	653392	653399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_011884	TATT	2	8	653464	653471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_011884	AGAT	2	8	653584	653591	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_011884	AGT	2	6	653660	653665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_011884	TAA	2	6	653667	653672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_011884	TCC	2	6	653684	653689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_011884	TC	3	6	654105	654110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_011884	ACCTGA	2	12	655766	655777	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_011884	GAG	2	6	655787	655792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_011884	TACT	2	8	657489	657496	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1535	NC_011884	TTAT	2	8	657539	657546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_011884	CTC	2	6	657667	657672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_011884	CA	3	6	657933	657938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1538	NC_011884	CT	3	6	658666	658671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_011884	TTA	3	9	661995	662003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_011884	ACA	2	6	662375	662380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_011884	C	6	6	662425	662430	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1542	NC_011884	CAT	2	6	662480	662485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_011884	GAA	2	6	662519	662524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_011884	TTG	2	6	665795	665800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_011884	ATA	2	6	666160	666165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_011884	CTG	2	6	666205	666210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_011884	TTTC	3	12	666215	666226	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1548	NC_011884	TGG	2	6	666338	666343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_011884	ATAA	2	8	668128	668135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_011884	CTC	2	6	668136	668141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1551	NC_011884	GCTAA	2	10	668189	668198	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1552	NC_011884	TGG	2	6	669089	669094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_011884	TTG	2	6	669096	669101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_011884	ATGA	2	8	669110	669117	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_011884	GGT	2	6	669146	669151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_011884	CCG	2	6	670062	670067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_011884	TCC	2	6	670116	670121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_011884	ATT	2	6	670185	670190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_011884	TCG	2	6	670207	670212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_011884	CAC	2	6	670233	670238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_011884	A	7	7	670249	670255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_011884	GAA	2	6	670298	670303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_011884	GGTT	2	8	670317	670324	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_011884	TCT	2	6	670365	670370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_011884	ATG	2	6	670380	670385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_011884	T	6	6	673464	673469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_011884	GAT	2	6	675119	675124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_011884	GA	3	6	675816	675821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_011884	GGA	2	6	676187	676192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_011884	CTG	2	6	676921	676926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_011884	CAG	2	6	678066	678071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_011884	C	6	6	679334	679339	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1573	NC_011884	GAT	2	6	679360	679365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_011884	TTGA	2	8	679385	679392	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_011884	TAAT	2	8	679433	679440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_011884	ATT	2	6	679441	679446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_011884	TCAAA	2	10	679481	679490	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1578	NC_011884	A	7	7	679544	679550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_011884	ACC	2	6	681605	681610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_011884	GCTT	2	8	681934	681941	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1581	NC_011884	CTT	2	6	681967	681972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_011884	T	8	8	681982	681989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_011884	AAT	2	6	681993	681998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_011884	GCA	2	6	682090	682095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_011884	CAA	2	6	682105	682110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_011884	CTT	2	6	682164	682169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_011884	AAGG	2	8	682174	682181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_011884	GGA	2	6	682182	682187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_011884	TAA	2	6	682250	682255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_011884	AGG	2	6	682288	682293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_011884	T	6	6	684026	684031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_011884	TTC	2	6	684669	684674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_011884	GCCC	2	8	685567	685574	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1594	NC_011884	GAC	2	6	685597	685602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_011884	AGT	2	6	686384	686389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_011884	ATT	2	6	686426	686431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_011884	CGA	2	6	686434	686439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_011884	GTT	2	6	686485	686490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_011884	GAA	2	6	686549	686554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_011884	ATGTG	2	10	686796	686805	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_011884	GGA	2	6	686815	686820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_011884	CTG	2	6	686994	686999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_011884	TG	3	6	687026	687031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_011884	TGG	2	6	687142	687147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_011884	CTT	2	6	687186	687191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_011884	TTTA	2	8	689939	689946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_011884	GCT	2	6	689959	689964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_011884	GAG	2	6	689979	689984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_011884	AGT	2	6	692658	692663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_011884	CTG	2	6	693847	693852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_011884	ACT	2	6	694897	694902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_011884	CTG	2	6	695095	695100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_011884	TTC	2	6	695128	695133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_011884	CTCTGG	2	12	695176	695187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_011884	TGGC	2	8	695190	695197	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1616	NC_011884	AGA	2	6	695209	695214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_011884	CCAT	2	8	697468	697475	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_011884	GGT	2	6	698159	698164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_011884	TCG	2	6	699179	699184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_011884	CCAA	2	8	700217	700224	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1621	NC_011884	TA	3	6	700329	700334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_011884	AAG	2	6	700354	700359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_011884	TAC	2	6	700822	700827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_011884	GCT	2	6	700851	700856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_011884	TTTC	2	8	701635	701642	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1626	NC_011884	GA	3	6	701671	701676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_011884	TCA	2	6	701729	701734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_011884	AGCCA	2	10	701804	701813	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1629	NC_011884	AAGA	2	8	701833	701840	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_011884	TAC	2	6	701855	701860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_011884	AAC	2	6	701878	701883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_011884	GAA	2	6	702016	702021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_011884	AGA	2	6	702837	702842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_011884	AGC	2	6	702859	702864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_011884	ATA	2	6	702907	702912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1910	NC_011884	TAT	2	6	840854	840859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1911	NC_011884	AAT	2	6	840947	840952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1912	NC_011884	AT	3	6	841903	841908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1913	NC_011884	GATT	2	8	841938	841945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1914	NC_011884	TGGCT	2	10	841953	841962	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1917	NC_011884	CTAT	2	8	845225	845232	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1918	NC_011884	TTAA	2	8	845299	845306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1921	NC_011884	CAT	2	6	848300	848305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1923	NC_011884	TAT	2	6	848967	848972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1924	NC_011884	GTCA	2	8	848977	848984	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1928	NC_011884	AAAT	2	8	850455	850462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1932	NC_011884	GTA	2	6	851466	851471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1942	NC_011884	AGG	2	6	854837	854842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1943	NC_011884	TGG	2	6	854894	854899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1952	NC_011884	ATC	2	6	862736	862741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2000	NC_011884	GCCT	2	8	878832	878839	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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