MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 13023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011884	GGA	2	6	436414	436419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011884	GCT	2	6	436436	436441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_011884	AT	3	6	436473	436478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011884	ATT	2	6	436527	436532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_011884	ATT	2	6	437281	437286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011884	GAC	2	6	438821	438826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_011884	CTG	2	6	438857	438862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_011884	GAT	2	6	438886	438891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_011884	TTC	2	6	438901	438906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_011884	TGG	2	6	438960	438965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_011884	TGGA	2	8	439426	439433	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_011884	CTT	2	6	440257	440262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_011884	TGAGG	2	10	440298	440307	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_011884	A	6	6	440308	440313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011884	TTA	2	6	441610	441615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_011884	GATC	2	8	441639	441646	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_011884	CAA	2	6	441722	441727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_011884	CAT	2	6	442937	442942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_011884	TTC	2	6	444038	444043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_011884	GAG	2	6	444099	444104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_011884	AGA	2	6	445317	445322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_011884	CTC	2	6	445355	445360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_011884	TACC	2	8	445861	445868	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_011884	ATTT	2	8	447613	447620	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_011884	CACAG	2	10	447625	447634	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1026	NC_011884	AAGG	2	8	447651	447658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_011884	TCT	2	6	447968	447973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_011884	AGG	2	6	448012	448017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_011884	GCT	2	6	448037	448042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_011884	TCGA	2	8	448045	448052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_011884	AGT	2	6	448062	448067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_011884	CTAA	2	8	448117	448124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_011884	TC	3	6	449700	449705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_011884	GAA	2	6	449735	449740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_011884	TGG	2	6	452490	452495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_011884	AAT	2	6	454304	454309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_011884	GTT	2	6	454333	454338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_011884	CAG	2	6	454829	454834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_011884	ATCG	2	8	454840	454847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_011884	CAA	2	6	454879	454884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_011884	CAGG	2	8	454970	454977	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_011884	GA	3	6	454987	454992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_011884	TGAGGT	2	12	455101	455112	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_011884	AGT	2	6	455146	455151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_011884	CTT	2	6	455159	455164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_011884	G	6	6	455280	455285	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_011884	TTA	2	6	455288	455293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_011884	TA	3	6	455893	455898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_011884	CT	3	6	455925	455930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_011884	GATC	2	8	455991	455998	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_011884	ATT	2	6	456027	456032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_011884	A	7	7	456037	456043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_011884	GTA	2	6	456059	456064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_011884	AGC	2	6	456808	456813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_011884	GAG	2	6	459894	459899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_011884	TC	3	6	464212	464217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_011884	G	7	7	465537	465543	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_011884	A	6	6	466438	466443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_011884	TCT	2	6	469897	469902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_011884	CTAAGC	2	12	471009	471020	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_011884	TTCAT	2	10	471068	471077	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1062	NC_011884	AT	3	6	471470	471475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_011884	TAAT	2	8	473241	473248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_011884	GA	4	8	474624	474631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_011884	CCT	2	6	477173	477178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_011884	C	7	7	477227	477233	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1067	NC_011884	CT	3	6	477378	477383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_011884	CTTAG	2	10	479724	479733	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1069	NC_011884	ATT	2	6	479771	479776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_011884	TAA	2	6	479795	479800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_011884	TC	3	6	483502	483507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_011884	ATGG	2	8	483604	483611	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_011884	TAC	2	6	483633	483638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_011884	AAG	2	6	485805	485810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_011884	GTT	2	6	485833	485838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_011884	TTC	2	6	485897	485902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_011884	GAT	2	6	485927	485932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_011884	ATG	2	6	486052	486057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_011884	GCTC	2	8	486066	486073	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_011884	AGA	2	6	488640	488645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_011884	GTT	2	6	488688	488693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_011884	GTT	2	6	488825	488830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_011884	CTG	2	6	491065	491070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_011884	AAG	2	6	491537	491542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_011884	AAAT	2	8	491562	491569	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_011884	AAT	2	6	491632	491637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_011884	ATT	3	9	491675	491683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_011884	ACT	2	6	491696	491701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_011884	ATA	2	6	491715	491720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_011884	CT	3	6	492380	492385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_011884	T	6	6	492424	492429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_011884	TC	3	6	492431	492436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_011884	GCCT	2	8	493361	493368	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_011884	CTC	2	6	493381	493386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_011884	CAAT	2	8	493414	493421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1096	NC_011884	TAAT	2	8	493429	493436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_011884	GAC	2	6	493556	493561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_011884	TAA	2	6	495858	495863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_011884	GTT	2	6	495893	495898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_011884	GGA	2	6	495910	495915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_011884	TCTT	2	8	496021	496028	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_011884	A	6	6	499694	499699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_011884	CGAT	2	8	499770	499777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_011884	A	8	8	499872	499879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_011884	A	7	7	499959	499965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_011884	TAT	2	6	499996	500001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_011884	GCT	2	6	500265	500270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_011884	A	7	7	500279	500285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_011884	TGG	2	6	500424	500429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_011884	ATGG	2	8	500439	500446	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011884	CAAT	2	8	500448	500455	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_011884	AATC	2	8	500461	500468	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_011884	AATA	2	8	500527	500534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_011884	TCT	2	6	500610	500615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_011884	CAAAA	2	10	501864	501873	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1116	NC_011884	A	6	6	501870	501875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_011884	ATT	2	6	501912	501917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_011884	G	6	6	502096	502101	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_011884	GGC	2	6	502121	502126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_011884	TGC	2	6	502223	502228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_011884	AGC	2	6	502247	502252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_011884	GAAA	2	8	503516	503523	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_011884	AAAAT	2	10	503767	503776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_011884	TTC	2	6	504666	504671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_011884	TCAT	2	8	504704	504711	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1126	NC_011884	TGA	2	6	504735	504740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_011884	TAAG	2	8	504807	504814	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_011884	GCT	2	6	505183	505188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_011884	AAT	2	6	505194	505199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_011884	CAG	2	6	505225	505230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_011884	T	6	6	505239	505244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_011884	CCT	2	6	505249	505254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_011884	TAA	2	6	505311	505316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_011884	AGC	2	6	505331	505336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_011884	TGGC	2	8	505338	505345	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1136	NC_011884	TAT	2	6	509069	509074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_011884	T	6	6	509118	509123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1407	NC_011884	TAAGA	2	10	610191	610200	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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