MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 13023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011884	CGT	2	6	5202008	5202013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12502	NC_011884	GGA	2	6	5203017	5203022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_011884	GA	3	6	5203147	5203152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_011884	GGA	2	6	5203887	5203892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_011884	AT	3	6	5203942	5203947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_011884	CTC	2	6	5203973	5203978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12507	NC_011884	GCT	2	6	5203979	5203984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12508	NC_011884	GTAG	2	8	5204014	5204021	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_011884	AGC	2	6	5204032	5204037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_011884	TCC	2	6	5204066	5204071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12511	NC_011884	CGCC	2	8	5204098	5204105	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12512	NC_011884	TCGT	2	8	5204131	5204138	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12513	NC_011884	T	6	6	5204138	5204143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_011884	GAC	2	6	5204171	5204176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_011884	GCT	2	6	5204179	5204184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_011884	GTT	2	6	5204221	5204226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_011884	GCT	2	6	5204378	5204383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12518	NC_011884	CGG	2	6	5204397	5204402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_011884	GATG	2	8	5204497	5204504	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_011884	ACCGAA	2	12	5204525	5204536	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12521	NC_011884	TGA	2	6	5205486	5205491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_011884	GGC	2	6	5205505	5205510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12523	NC_011884	CGAA	2	8	5205542	5205549	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12524	NC_011884	TCC	2	6	5205666	5205671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12525	NC_011884	CTG	2	6	5205758	5205763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12526	NC_011884	ACGGT	2	10	5205884	5205893	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12527	NC_011884	TTA	2	6	5206010	5206015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_011884	ATC	2	6	5206023	5206028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12529	NC_011884	TGG	2	6	5206170	5206175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_011884	TTCC	2	8	5206273	5206280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12531	NC_011884	CAAA	2	8	5206282	5206289	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12532	NC_011884	GAC	3	9	5206294	5206302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12533	NC_011884	ACC	2	6	5206331	5206336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12534	NC_011884	CAA	2	6	5206451	5206456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12535	NC_011884	ATGG	2	8	5206492	5206499	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_011884	ACC	2	6	5206511	5206516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12537	NC_011884	CTG	2	6	5206539	5206544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12538	NC_011884	GGTT	2	8	5206558	5206565	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_011884	CGAT	2	8	5206572	5206579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12540	NC_011884	GCC	2	6	5206601	5206606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12541	NC_011884	TGGA	2	8	5206621	5206628	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_011884	AAC	2	6	5206689	5206694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12543	NC_011884	CTA	2	6	5206786	5206791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12544	NC_011884	ATCACT	2	12	5206851	5206862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12545	NC_011884	GGT	2	6	5206882	5206887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_011884	CCG	2	6	5206974	5206979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12547	NC_011884	GTTG	2	8	5207141	5207148	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12548	NC_011884	GCG	2	6	5207165	5207170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12549	NC_011884	C	6	6	5207177	5207182	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12550	NC_011884	G	6	6	5207218	5207223	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_011884	ATT	2	6	5207234	5207239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_011884	GGT	2	6	5207278	5207283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_011884	CTGC	2	8	5207319	5207326	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12554	NC_011884	GTG	3	9	5207333	5207341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_011884	GTG	2	6	5207441	5207446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_011884	GCA	2	6	5207450	5207455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12557	NC_011884	TTG	2	6	5207544	5207549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_011884	CCA	2	6	5207553	5207558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12559	NC_011884	C	6	6	5207573	5207578	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12560	NC_011884	GAA	2	6	5207597	5207602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_011884	CT	3	6	5207819	5207824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12562	NC_011884	ATT	2	6	5207853	5207858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_011884	GAT	2	6	5207933	5207938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_011884	TTG	2	6	5209174	5209179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_011884	TGC	2	6	5209184	5209189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12566	NC_011884	TAA	2	6	5209193	5209198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_011884	GCA	2	6	5210142	5210147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12568	NC_011884	GAT	2	6	5210202	5210207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_011884	TTGGC	2	10	5211815	5211824	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12570	NC_011884	ATT	2	6	5213577	5213582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_011884	C	6	6	5213613	5213618	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12572	NC_011884	CTG	2	6	5213639	5213644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12573	NC_011884	AAG	2	6	5213678	5213683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_011884	CGG	2	6	5214183	5214188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12575	NC_011884	TTG	2	6	5214220	5214225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12576	NC_011884	TATT	2	8	5215344	5215351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12577	NC_011884	ACTT	2	8	5215359	5215366	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12578	NC_011884	GTT	2	6	5215416	5215421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_011884	AATAGA	2	12	5215424	5215435	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12580	NC_011884	GAA	2	6	5215460	5215465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12581	NC_011884	GGAT	2	8	5216003	5216010	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12582	NC_011884	TTA	2	6	5216038	5216043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12583	NC_011884	GCA	2	6	5216992	5216997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12584	NC_011884	A	6	6	5217031	5217036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12585	NC_011884	TGG	2	6	5217107	5217112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12586	NC_011884	AAT	2	6	5221038	5221043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12587	NC_011884	GAA	2	6	5221093	5221098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12588	NC_011884	ATAG	2	8	5221219	5221226	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12589	NC_011884	A	7	7	5228915	5228921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12590	NC_011884	GTT	2	6	5228950	5228955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12591	NC_011884	GTGA	2	8	5230624	5230631	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_011884	ACC	2	6	5230685	5230690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12593	NC_011884	A	6	6	5230692	5230697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_011884	AT	3	6	5231095	5231100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_011884	TGG	2	6	5231102	5231107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_011884	AT	3	6	5231108	5231113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12597	NC_011884	GA	3	6	5231224	5231229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_011884	C	6	6	5231231	5231236	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12599	NC_011884	ATCG	2	8	5231270	5231277	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12600	NC_011884	TCA	2	6	5235803	5235808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12601	NC_011884	GCC	2	6	5235823	5235828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12602	NC_011884	CA	3	6	5235919	5235924	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12603	NC_011884	TTG	2	6	5237969	5237974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_011884	GGA	2	6	5237980	5237985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12605	NC_011884	GTT	2	6	5238981	5238986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12606	NC_011884	TCT	2	6	5239219	5239224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12607	NC_011884	CAA	2	6	5239235	5239240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12608	NC_011884	GCT	2	6	5240604	5240609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12609	NC_011884	TC	3	6	5240645	5240650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12610	NC_011884	GGC	2	6	5240663	5240668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12611	NC_011884	ATCG	2	8	5240695	5240702	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12612	NC_011884	TCAA	2	8	5240742	5240749	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12613	NC_011884	GGGAA	2	10	5242157	5242166	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_011884	CAA	2	6	5242222	5242227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12615	NC_011884	TAA	2	6	5242352	5242357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12616	NC_011884	CCT	2	6	5245806	5245811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12617	NC_011884	CAGG	2	8	5245884	5245891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12618	NC_011884	GA	3	6	5245921	5245926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12619	NC_011884	CTA	2	6	5250054	5250059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12620	NC_011884	CGG	2	6	5250154	5250159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12621	NC_011884	TCC	3	9	5250186	5250194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12622	NC_011884	GGGA	2	8	5251477	5251484	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12623	NC_011884	AT	3	6	5251561	5251566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12624	NC_011884	A	7	7	5251578	5251584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12625	NC_011884	ATAAA	2	10	5251594	5251603	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12626	NC_011884	A	6	6	5251625	5251630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12627	NC_011884	GAT	2	6	5251658	5251663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12628	NC_011884	TGT	2	6	5253412	5253417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12629	NC_011884	AACA	2	8	5253441	5253448	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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