MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 13023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011884	GAA	2	6	212691	212696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_011884	TCT	2	6	212717	212722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_011884	ACC	2	6	212724	212729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_011884	TAATC	2	10	212764	212773	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
505	NC_011884	TGT	2	6	216256	216261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_011884	GCA	2	6	216357	216362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_011884	ATT	2	6	216481	216486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_011884	T	6	6	216491	216496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_011884	GTC	2	6	216521	216526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_011884	ATC	2	6	216538	216543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_011884	TAA	2	6	216567	216572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_011884	TCCGT	2	10	216680	216689	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
513	NC_011884	ATTC	2	8	219037	219044	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
514	NC_011884	A	6	6	219062	219067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_011884	GGA	2	6	219129	219134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_011884	AAT	2	6	219143	219148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_011884	CAA	2	6	220563	220568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_011884	ATT	2	6	220623	220628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011884	GTG	2	6	220679	220684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_011884	GT	3	6	221844	221849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_011884	ATCA	2	8	221863	221870	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
522	NC_011884	AT	3	6	223054	223059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_011884	CAC	2	6	223086	223091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_011884	CAAT	2	8	224297	224304	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
525	NC_011884	T	6	6	224308	224313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_011884	AGC	2	6	224328	224333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_011884	T	6	6	224360	224365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_011884	TC	3	6	226016	226021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
529	NC_011884	CAGAG	2	10	227278	227287	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
530	NC_011884	TGC	2	6	227293	227298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_011884	TC	3	6	229387	229392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_011884	ATAG	2	8	229496	229503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
533	NC_011884	CAAC	2	8	229558	229565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_011884	CCT	2	6	229604	229609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_011884	AATTT	2	10	229625	229634	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_011884	G	7	7	235778	235784	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
537	NC_011884	GAT	2	6	235806	235811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_011884	TTA	2	6	235851	235856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_011884	GGA	2	6	236748	236753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_011884	GA	3	6	236760	236765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011884	TGC	2	6	237379	237384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_011884	GGT	2	6	237391	237396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_011884	AG	3	6	237456	237461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011884	G	6	6	237466	237471	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011884	CTG	2	6	237472	237477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_011884	GTA	2	6	237499	237504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_011884	CTT	2	6	237512	237517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_011884	TCC	2	6	237551	237556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_011884	A	6	6	237589	237594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_011884	GAT	2	6	237614	237619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011884	AGG	2	6	237623	237628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_011884	GTTT	2	8	237776	237783	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
553	NC_011884	TTGA	2	8	237798	237805	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
554	NC_011884	CTA	2	6	237832	237837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_011884	TGA	2	6	238379	238384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_011884	ATTTT	2	10	238429	238438	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_011884	GTT	2	6	238457	238462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_011884	CT	3	6	238465	238470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_011884	TACTCA	2	12	239000	239011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_011884	T	7	7	240628	240634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_011884	CAT	2	6	240654	240659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_011884	GGA	2	6	240715	240720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_011884	CCT	2	6	241172	241177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_011884	GCA	2	6	241885	241890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_011884	GGT	2	6	242450	242455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_011884	AAC	2	6	242469	242474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_011884	CATC	2	8	242537	242544	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_011884	CG	3	6	242578	242583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
569	NC_011884	CGAT	2	8	242615	242622	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
570	NC_011884	GCT	2	6	243907	243912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_011884	GTT	2	6	243986	243991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_011884	TCTG	2	8	244004	244011	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
573	NC_011884	A	6	6	244168	244173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_011884	A	7	7	244175	244181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_011884	CTTT	2	8	244708	244715	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
576	NC_011884	AGC	2	6	246290	246295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_011884	G	7	7	247256	247262	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
578	NC_011884	GTTGGA	2	12	248259	248270	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
579	NC_011884	GCT	2	6	250330	250335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_011884	T	6	6	250337	250342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_011884	AGT	2	6	250947	250952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_011884	CTTC	2	8	250962	250969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_011884	GCT	2	6	250997	251002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_011884	AGG	2	6	251029	251034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_011884	A	6	6	251047	251052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_011884	GAT	2	6	251121	251126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_011884	AGC	2	6	251173	251178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_011884	AGT	2	6	251225	251230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_011884	GAA	2	6	251318	251323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_011884	AAG	2	6	251362	251367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_011884	ATTT	2	8	251460	251467	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_011884	AGT	2	6	252616	252621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011884	TGG	2	6	252624	252629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
594	NC_011884	GGTGTG	2	12	253950	253961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_011884	GCT	2	6	254030	254035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_011884	CAG	2	6	254278	254283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_011884	TCGA	2	8	254304	254311	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
598	NC_011884	CCTA	2	8	254344	254351	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
599	NC_011884	CCCT	2	8	254432	254439	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
600	NC_011884	ACC	2	6	254470	254475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_011884	ACT	2	6	255206	255211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_011884	CAT	2	6	255259	255264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_011884	ATA	2	6	255273	255278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_011884	GA	3	6	255281	255286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_011884	TTG	2	6	255291	255296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_011884	CCAAAG	2	12	255340	255351	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_011884	T	7	7	255372	255378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_011884	GCA	2	6	255391	255396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_011884	GAT	2	6	255564	255569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_011884	AAG	2	6	255633	255638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_011884	ATG	2	6	257053	257058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_011884	TAG	2	6	257082	257087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011884	AGCT	2	8	258718	258725	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
614	NC_011884	AAGTG	2	10	259340	259349	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011884	GAA	2	6	261053	261058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_011884	GTC	2	6	261609	261614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_011884	GCC	2	6	261620	261625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_011884	CCTG	2	8	261687	261694	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
619	NC_011884	TCC	2	6	261808	261813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_011884	TTC	2	6	261822	261827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_011884	CCAG	2	8	264205	264212	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
622	NC_011884	CGGAG	2	10	264292	264301	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
623	NC_011884	GAT	2	6	264316	264321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_011884	TCCG	2	8	264328	264335	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
625	NC_011884	GTTC	2	8	265651	265658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
626	NC_011884	TCG	2	6	265692	265697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_011884	GCTG	2	8	265712	265719	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
628	NC_011884	TAG	2	6	265760	265765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_011884	AAT	2	6	265796	265801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_011884	CTG	2	6	265808	265813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_011884	CTA	2	6	266317	266322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_011884	T	6	6	266350	266355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_011884	TA	3	6	266358	266363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_011884	AAC	2	6	266999	267004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_011884	CATC	2	8	267006	267013	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
636	NC_011884	GTG	2	6	267036	267041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_011884	TA	3	6	267075	267080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_011884	CAT	2	6	267085	267090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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