MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742501

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011880	TCGA	2	8	3031	3038	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011880	CTTT	2	8	3076	3083	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011880	ATTT	2	8	3199	3206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011880	TCCC	2	8	3366	3373	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_011880	TCAA	2	8	3958	3965	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011880	CGGT	2	8	4342	4349	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011880	TTAA	2	8	4670	4677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011880	CTTA	2	8	5144	5151	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011880	GGGT	2	8	5664	5671	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011880	AGGG	2	8	5797	5804	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011880	GCTG	2	8	5897	5904	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011880	GCAA	2	8	7972	7979	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011880	TAAG	2	8	9231	9238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011880	TTGC	2	8	10854	10861	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011880	GACT	2	8	30249	30256	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011880	AGTA	2	8	43306	43313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011880	TCAA	2	8	43327	43334	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011880	GTAC	2	8	44323	44330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011880	TTGA	2	8	44944	44951	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011880	TCAA	2	8	45247	45254	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011880	CGCA	2	8	45784	45791	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011880	GTCC	2	8	45898	45905	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011880	CGGG	2	8	46182	46189	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011880	GTTA	2	8	46354	46361	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011880	TTAG	2	8	48791	48798	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011880	TTCG	2	8	50635	50642	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011880	AGGA	2	8	52904	52911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011880	AGAC	2	8	52971	52978	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011880	TGAA	2	8	54035	54042	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011880	TTTG	2	8	62969	62976	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011880	CAAT	2	8	83030	83037	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011880	GGGA	2	8	88811	88818	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011880	GTAT	2	8	96795	96802	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011880	TGAA	2	8	98258	98265	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011880	TTTC	2	8	99223	99230	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011880	TTTA	2	8	99284	99291	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011880	ATCA	2	8	100639	100646	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011880	ATTT	2	8	102435	102442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011880	TCAA	2	8	103702	103709	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011880	GTTT	2	8	106225	106232	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011880	TCAC	2	8	106519	106526	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011880	AGGA	3	12	107770	107781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011880	GGAC	2	8	107801	107808	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011880	CCGG	2	8	107877	107884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011880	AGCG	2	8	130551	130558	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011880	TCCC	2	8	130793	130800	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_011880	GAAG	2	8	131081	131088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011880	ACTC	2	8	132687	132694	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011880	AGCG	2	8	132743	132750	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011880	ATCA	2	8	134540	134547	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011880	ATTT	2	8	137133	137140	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011880	CGAC	2	8	150712	150719	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011880	ATTT	2	8	150853	150860	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011880	ACTT	2	8	151530	151537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011880	CATT	2	8	153154	153161	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011880	GATC	2	8	158199	158206	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011880	CTGC	2	8	169634	169641	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011880	TGAT	2	8	170518	170525	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011880	ATAA	2	8	170564	170571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011880	CCAA	2	8	171242	171249	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011880	TCAT	2	8	171370	171377	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011880	TATC	2	8	177518	177525	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011880	CATG	2	8	177540	177547	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011880	ATCA	2	8	177952	177959	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011880	ACAA	2	8	179796	179803	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011880	AAGC	2	8	181267	181274	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011880	AATC	2	8	181551	181558	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011880	CGGA	2	8	181982	181989	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011880	GACT	2	8	183415	183422	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011880	CACC	2	8	185917	185924	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_011880	ACTG	3	12	186173	186184	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011880	CATC	2	8	186207	186214	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011880	GCCA	2	8	186357	186364	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011880	TAGT	2	8	186593	186600	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011880	CTTT	2	8	188467	188474	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011880	GTTT	2	8	188774	188781	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011880	GCTG	2	8	188838	188845	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011880	CAGC	2	8	189120	189127	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011880	ATTG	2	8	190024	190031	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011880	AAGG	2	8	190058	190065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011880	GCTG	2	8	190802	190809	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011880	TCAC	2	8	191604	191611	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011880	AATC	2	8	192115	192122	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011880	CAGG	2	8	193439	193446	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011880	GAAG	2	8	193546	193553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011880	GTGG	2	8	195176	195183	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011880	TTAT	2	8	195185	195192	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011880	CAAA	2	8	195487	195494	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011880	TGAG	2	8	195717	195724	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011880	TTTG	2	8	195731	195738	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011880	GAAA	2	8	196002	196009	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.