MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium kluyveri NBRC 12016 plasmid pCKL1

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011836	ATGA	2	8	13505	13512	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011836	ATTT	2	8	17799	17806	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011836	TAAT	2	8	17901	17908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011836	AGTT	2	8	18895	18902	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011836	ATTA	2	8	19851	19858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011836	TGTT	2	8	19970	19977	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011836	AATT	2	8	22927	22934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011836	GATG	2	8	22950	22957	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011836	AATA	2	8	27275	27282	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011836	AATT	2	8	27362	27369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011836	AATT	2	8	27425	27432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011836	AGAA	2	8	28026	28033	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011836	TATT	2	8	28107	28114	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011836	CAAG	2	8	28168	28175	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011836	TTTG	2	8	28182	28189	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011836	AAAG	2	8	28249	28256	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011836	AAAG	2	8	30307	30314	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011836	GAAG	2	8	30409	30416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011836	AAAC	2	8	31479	31486	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011836	TAAA	2	8	31810	31817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011836	AAAT	2	8	31880	31887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011836	AATA	2	8	32152	32159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011836	GAAA	2	8	33112	33119	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011836	TACT	2	8	33313	33320	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011836	ATTT	2	8	39056	39063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011836	AAAT	2	8	39171	39178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011836	ATTT	2	8	39199	39206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011836	ATTA	2	8	40985	40992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011836	GATG	2	8	41887	41894	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011836	AAAT	2	8	41899	41906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011836	GCAA	2	8	41923	41930	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011836	TACG	2	8	46349	46356	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011836	GTTA	3	12	46409	46420	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011836	AAAT	2	8	46541	46548	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011836	AAAG	2	8	46604	46611	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011836	TAAA	2	8	47517	47524	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011836	AAAT	2	8	47611	47618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011836	ATTT	2	8	47667	47674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011836	TAAA	2	8	48551	48558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011836	AATA	2	8	48582	48589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011836	CCCT	2	8	48622	48629	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_011836	GGTG	2	8	55415	55422	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011836	GAGG	2	8	56246	56253	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011836	ATTT	2	8	58576	58583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.