MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium kluyveri NBRC 12016 plasmid pCKL1

Total Repeats: 311

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011836	T	6	6	13379	13384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011836	TAA	2	6	13402	13407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011836	TGAGG	2	10	13409	13418	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011836	AAGTTA	2	12	13461	13472	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011836	ATGA	2	8	13505	13512	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011836	T	7	7	13563	13569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011836	AGG	2	6	13591	13596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011836	AAT	2	6	14929	14934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011836	T	6	6	14974	14979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011836	T	6	6	15004	15009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011836	AGG	2	6	15033	15038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011836	T	6	6	15492	15497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011836	AGG	2	6	15539	15544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011836	GAA	2	6	16310	16315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011836	A	6	6	16350	16355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011836	TAC	2	6	16383	16388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011836	GAT	2	6	16414	16419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011836	GCAAA	2	10	16461	16470	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011836	TAA	2	6	16516	16521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011836	TA	3	6	16581	16586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011836	TA	3	6	16588	16593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011836	ATT	2	6	16596	16601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011836	AT	4	8	16614	16621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011836	GTG	2	6	16625	16630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011836	ATG	2	6	16632	16637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011836	TAA	2	6	16661	16666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011836	GAA	2	6	16680	16685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011836	AT	3	6	16686	16691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011836	A	6	6	16722	16727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011836	ATA	2	6	16744	16749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011836	TA	4	8	16748	16755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011836	AT	3	6	16809	16814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011836	A	6	6	16995	17000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011836	AGA	2	6	17004	17009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011836	ATT	2	6	17010	17015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011836	TTA	2	6	17074	17079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011836	AAT	2	6	17756	17761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011836	TA	3	6	17768	17773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011836	ATTT	2	8	17799	17806	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011836	TAT	2	6	17827	17832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011836	A	6	6	17861	17866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011836	TTA	2	6	17890	17895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011836	TAAT	2	8	17901	17908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011836	GAT	2	6	18863	18868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011836	TAG	2	6	18880	18885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011836	AGTT	2	8	18895	18902	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011836	A	8	8	18939	18946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011836	A	6	6	18968	18973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011836	AGA	2	6	18982	18987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011836	AAC	2	6	19014	19019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011836	AGA	2	6	19024	19029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011836	AAT	2	6	19030	19035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011836	ACA	2	6	19061	19066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011836	AGA	2	6	19072	19077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011836	ATA	2	6	19128	19133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011836	AT	4	8	19602	19609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011836	T	7	7	19638	19644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011836	AT	3	6	19697	19702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011836	GTA	2	6	19749	19754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011836	A	7	7	19761	19767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011836	TA	3	6	19786	19791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011836	GAA	2	6	19809	19814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011836	A	6	6	19813	19818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011836	TCA	2	6	19825	19830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011836	ATTA	2	8	19851	19858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011836	A	6	6	19862	19867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011836	A	6	6	19920	19925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011836	TAC	2	6	19953	19958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011836	TGTT	2	8	19970	19977	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011836	TA	3	6	21682	21687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011836	T	6	6	21783	21788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011836	AT	3	6	21790	21795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011836	GGA	2	6	21800	21805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011836	TA	3	6	22210	22215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011836	TAT	2	6	22609	22614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011836	TAT	2	6	22619	22624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011836	AT	3	6	22628	22633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011836	T	6	6	22651	22656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011836	TC	3	6	22679	22684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011836	TA	3	6	22721	22726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011836	ATG	2	6	22768	22773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011836	A	6	6	22822	22827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011836	TTA	2	6	22828	22833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011836	GT	3	6	22870	22875	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011836	TATAA	2	10	22886	22895	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011836	AGG	2	6	22901	22906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011836	AATT	2	8	22927	22934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011836	A	7	7	22943	22949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011836	GATG	2	8	22950	22957	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011836	A	7	7	22963	22969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011836	AAG	2	6	22972	22977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011836	CA	3	6	22981	22986	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_011836	CAC	2	6	23105	23110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_011836	TA	3	6	23119	23124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011836	ATT	2	6	23129	23134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011836	AGG	2	6	23139	23144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011836	TG	3	6	23615	23620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011836	TTATA	2	10	23628	23637	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011836	AT	3	6	23659	23664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011836	TAATA	2	10	23712	23721	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011836	TTA	2	6	23722	23727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011836	TA	4	8	23754	23761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011836	A	6	6	23767	23772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011836	GCA	2	6	23779	23784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011836	TGC	2	6	23809	23814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011836	AAG	2	6	23828	23833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011836	TA	3	6	23844	23849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011836	TCTAT	2	10	23850	23859	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_011836	TGA	2	6	23883	23888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011836	A	7	7	23928	23934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011836	T	6	6	23977	23982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011836	AG	3	6	24893	24898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011836	CA	3	6	24899	24904	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_011836	A	6	6	26273	26278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011836	TTA	2	6	26342	26347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011836	AT	3	6	26740	26745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011836	T	7	7	26795	26801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011836	AAC	2	6	26868	26873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011836	TAT	2	6	26941	26946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011836	TA	3	6	26995	27000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011836	TTA	3	9	27069	27077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011836	TA	3	6	27119	27124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011836	AT	3	6	27125	27130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011836	TA	3	6	27141	27146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011836	A	6	6	27146	27151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011836	A	7	7	27169	27175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011836	TG	4	8	27266	27273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011836	AATA	2	8	27275	27282	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011836	AAT	2	6	27286	27291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011836	A	6	6	27296	27301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011836	AC	3	6	27310	27315	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_011836	AT	3	6	27317	27322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011836	AAT	2	6	27323	27328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011836	TTA	2	6	27336	27341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011836	AATT	2	8	27362	27369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011836	ATT	2	6	27382	27387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011836	GAT	2	6	27390	27395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011836	AATT	2	8	27425	27432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011836	ATA	2	6	27848	27853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011836	CCT	2	6	27854	27859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_011836	T	6	6	27883	27888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011836	ACA	2	6	27902	27907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_011836	ATA	2	6	27933	27938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011836	TAT	2	6	27950	27955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011836	AGG	2	6	27996	28001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011836	AGAA	2	8	28026	28033	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011836	TATT	2	8	28107	28114	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011836	AGC	2	6	28139	28144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_011836	CAAG	2	8	28168	28175	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_011836	TTTG	2	8	28182	28189	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011836	AGG	2	6	28200	28205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011836	AAAG	2	8	28249	28256	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011836	ACT	2	6	28284	28289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_011836	A	6	6	29199	29204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011836	AGG	2	6	29549	29554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011836	GCA	2	6	30060	30065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_011836	AAG	2	6	30134	30139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_011836	GAG	2	6	30196	30201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_011836	AAGAT	2	10	30260	30269	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_011836	AAAG	2	8	30307	30314	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_011836	A	6	6	30317	30322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_011836	TTA	2	6	30371	30376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_011836	TA	3	6	31415	31420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_011836	A	7	7	31815	31821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_011836	AAAAT	2	10	31840	31849	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_011836	ACA	2	6	31867	31872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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175	NC_011836	AAATT	2	10	31941	31950	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_011836	A	6	6	31968	31973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_011836	AATA	2	8	32152	32159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_011836	TG	3	6	33078	33083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
181	NC_011836	GAAA	2	8	33112	33119	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
182	NC_011836	TAG	2	6	33228	33233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_011836	AAT	2	6	38753	38758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_011836	T	6	6	48196	48201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_011836	C	6	6	48572	48577	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
282	NC_011836	AATA	2	8	48582	48589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_011836	GTG	2	6	48615	48620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_011836	T	7	7	48653	48659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_011836	CAA	2	6	55315	55320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_011836	CAA	2	6	55465	55470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_011836	GA	3	6	55507	55512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
290	NC_011836	GAGG	2	8	56246	56253	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
291	NC_011836	T	6	6	56975	56980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_011836	A	7	7	56989	56995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_011836	ATTAA	2	10	57950	57959	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_011836	ATA	2	6	57962	57967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_011836	ATT	2	6	58370	58375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_011836	ACA	2	6	58382	58387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_011836	GAA	2	6	58403	58408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
298	NC_011836	AAC	2	6	58420	58425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_011836	AGA	2	6	58483	58488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
300	NC_011836	T	6	6	58512	58517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_011836	AT	3	6	58530	58535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_011836	AT	3	6	58558	58563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_011836	ATTT	2	8	58576	58583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_011836	TTAAAC	2	12	58963	58974	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
305	NC_011836	TA	3	6	58994	58999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_011836	TTG	2	6	59014	59019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
307	NC_011836	TAT	2	6	59020	59025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_011836	TAA	2	6	59113	59118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_011836	AAT	2	6	59119	59124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
310	NC_011836	T	6	6	59150	59155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_011836	AGG	2	6	59170	59175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.