MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 8346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011831	ATG	2	6	60	65	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011831	TGC	2	6	87	92	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011831	AGG	2	6	196	201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011831	CGC	2	6	1645	1650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_011831	GCG	2	6	1658	1663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011831	GCG	2	6	1680	1685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011831	GCG	2	6	1726	1731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011831	CAG	2	6	1754	1759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011831	CTA	2	6	3192	3197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011831	TAA	2	6	5403	5408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011831	TGA	2	6	7669	7674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011831	TGA	3	9	7678	7686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011831	ACG	2	6	7800	7805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011831	GAC	2	6	7870	7875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011831	CGT	2	6	7917	7922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011831	GAC	2	6	7933	7938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011831	CAT	2	6	9205	9210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011831	TTG	2	6	9264	9269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011831	GCT	2	6	21342	21347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011831	CGG	2	6	22365	22370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011831	ATC	2	6	23909	23914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011831	TGC	2	6	26839	26844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011831	TTC	2	6	26884	26889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011831	TAA	2	6	26905	26910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011831	ATC	2	6	26947	26952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011831	GCT	2	6	27035	27040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011831	GGA	2	6	27158	27163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011831	ATG	2	6	27882	27887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011831	TTG	2	6	29527	29532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011831	TCT	2	6	29565	29570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011831	TGC	2	6	29667	29672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011831	AGC	2	6	29718	29723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011831	TGC	3	9	29727	29735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011831	CTG	2	6	30970	30975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011831	GAG	2	6	30979	30984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011831	GAG	2	6	31728	31733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011831	CCG	2	6	33844	33849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_011831	TAC	2	6	34663	34668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011831	CAC	2	6	34686	34691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_011831	CGA	2	6	34713	34718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011831	CAA	2	6	34767	34772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011831	ATG	2	6	34809	34814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011831	GTC	2	6	37893	37898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011831	ACC	2	6	37970	37975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_011831	ATG	2	6	38105	38110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011831	TTC	2	6	38134	38139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011831	GAT	2	6	38167	38172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011831	TGG	2	6	38187	38192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011831	TGA	2	6	38210	38215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011831	GAT	2	6	38226	38231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011831	ATG	2	6	38277	38282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011831	TCG	2	6	38319	38324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011831	TGC	2	6	38408	38413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011831	AGC	2	6	38617	38622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011831	GTT	2	6	42806	42811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011831	GTG	2	6	42868	42873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011831	CGG	2	6	42920	42925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011831	TCA	2	6	45272	45277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011831	CCT	2	6	47653	47658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_011831	CAA	2	6	47729	47734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011831	GGC	2	6	47851	47856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011831	AGG	2	6	47873	47878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011831	TCA	2	6	47881	47886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011831	TAT	2	6	48588	48593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011831	TGT	2	6	48621	48626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011831	ATG	2	6	56540	56545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011831	ATC	2	6	58096	58101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011831	TCA	2	6	58105	58110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011831	CGG	2	6	60887	60892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011831	CAT	2	6	62097	62102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011831	AAC	2	6	62227	62232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011831	GTT	2	6	62269	62274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011831	TAT	2	6	62332	62337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011831	GAG	2	6	62360	62365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011831	GTG	2	6	62394	62399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011831	AAC	2	6	62441	62446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011831	CAT	2	6	63920	63925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011831	AAG	2	6	64353	64358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011831	CGC	2	6	64598	64603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_011831	CGG	2	6	64710	64715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011831	CAA	2	6	66134	66139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011831	AGC	2	6	66171	66176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011831	GTT	2	6	69674	69679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011831	TTC	2	6	71406	71411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011831	GTA	2	6	73289	73294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011831	TCA	2	6	74027	74032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011831	GTC	2	6	74038	74043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011831	CAA	2	6	74051	74056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011831	GGT	2	6	74074	74079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011831	ACA	2	6	75384	75389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011831	CTG	2	6	76222	76227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011831	TCA	2	6	76283	76288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011831	TCA	2	6	76294	76299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011831	AGG	2	6	77579	77584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011831	TTC	3	9	80215	80223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011831	TCG	2	6	80224	80229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011831	ATG	2	6	82966	82971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011831	TAA	2	6	85815	85820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011831	AGC	2	6	85838	85843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011831	ACC	2	6	87402	87407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_011831	TGT	2	6	89266	89271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011831	AAC	2	6	89333	89338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011831	AGG	2	6	89357	89362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011831	CAC	2	6	89937	89942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_011831	GCT	2	6	89959	89964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011831	ACG	2	6	89980	89985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011831	GGC	2	6	89994	89999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011831	TAC	2	6	90556	90561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011831	ACG	2	6	93010	93015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011831	ACG	2	6	93049	93054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011831	TAT	2	6	94963	94968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011831	GCA	2	6	95015	95020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011831	GCG	3	9	97069	97077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011831	CCG	2	6	100173	100178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_011831	TCT	2	6	100180	100185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011831	CGG	2	6	102492	102497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011831	CCG	2	6	102514	102519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_011831	TCT	2	6	102523	102528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011831	TCC	2	6	103546	103551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_011831	ACT	2	6	103564	103569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011831	CAT	2	6	103592	103597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011831	TCC	2	6	104395	104400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_011831	ACG	2	6	104490	104495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011831	CGT	2	6	104554	104559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011831	CCT	2	6	104596	104601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_011831	CAC	2	6	104717	104722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_011831	ATC	2	6	104784	104789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011831	ACC	2	6	106728	106733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_011831	TGA	2	6	106786	106791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011831	CCT	2	6	108049	108054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_011831	CAA	2	6	108064	108069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011831	GCG	2	6	108108	108113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011831	TGG	2	6	108116	108121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011831	TCA	2	6	108199	108204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011831	CTG	3	9	108225	108233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011831	TGA	2	6	108253	108258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011831	GAC	2	6	110448	110453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011831	CAC	2	6	110473	110478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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