MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 12718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011831	CAC	2	6	1311472	1311477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_011831	AG	3	6	1311525	1311530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_011831	A	6	6	1311579	1311584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_011831	TTTG	2	8	1311685	1311692	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_011831	AGC	2	6	1312146	1312151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_011831	CCG	2	6	1312164	1312169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3507	NC_011831	GAG	2	6	1312217	1312222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_011831	GCGA	2	8	1312619	1312626	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3509	NC_011831	GCAG	2	8	1312654	1312661	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3510	NC_011831	GGGC	2	8	1312683	1312690	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3511	NC_011831	CAA	2	6	1312743	1312748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_011831	GAC	2	6	1312857	1312862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_011831	CCG	2	6	1312872	1312877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3514	NC_011831	TGA	2	6	1312908	1312913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_011831	ATC	2	6	1316990	1316995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_011831	CCCT	2	8	1327927	1327934	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3517	NC_011831	ACT	2	6	1327996	1328001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_011831	CTG	2	6	1328025	1328030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_011831	TTC	2	6	1328032	1328037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_011831	TCA	2	6	1328039	1328044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_011831	CTG	2	6	1328048	1328053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_011831	GTTG	2	8	1332404	1332411	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_011831	AAC	2	6	1332436	1332441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_011831	ACG	2	6	1332468	1332473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_011831	CT	3	6	1334166	1334171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_011831	GCCAG	2	10	1334206	1334215	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3527	NC_011831	TGT	2	6	1336773	1336778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_011831	CTC	2	6	1338595	1338600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3529	NC_011831	CAA	2	6	1339170	1339175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_011831	ACG	2	6	1339223	1339228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_011831	CAC	2	6	1339305	1339310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_011831	CGTGC	2	10	1339325	1339334	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3533	NC_011831	CGTGC	2	10	1339373	1339382	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3534	NC_011831	GCACG	2	10	1339415	1339424	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3535	NC_011831	GA	3	6	1339433	1339438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_011831	ACC	2	6	1339452	1339457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3537	NC_011831	TC	3	6	1340509	1340514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_011831	TTTA	2	8	1340538	1340545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_011831	TTTG	2	8	1340588	1340595	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_011831	A	6	6	1340598	1340603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_011831	TAAAC	2	10	1341732	1341741	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3542	NC_011831	GAT	2	6	1341746	1341751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_011831	T	6	6	1342455	1342460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_011831	GAT	2	6	1342478	1342483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_011831	TGT	2	6	1342510	1342515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_011831	TGT	2	6	1342521	1342526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_011831	GTT	2	6	1342541	1342546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_011831	CCGCA	2	10	1343372	1343381	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3549	NC_011831	CGG	2	6	1343386	1343391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_011831	CGA	2	6	1343523	1343528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_011831	CAC	2	6	1343553	1343558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3552	NC_011831	CCCA	2	8	1343566	1343573	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3553	NC_011831	CACGG	2	10	1343581	1343590	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3554	NC_011831	ACC	2	6	1343611	1343616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_011831	CTG	2	6	1343627	1343632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_011831	GC	3	6	1343729	1343734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3557	NC_011831	CGAT	2	8	1343746	1343753	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3558	NC_011831	GC	4	8	1343756	1343763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3559	NC_011831	ATC	2	6	1343767	1343772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_011831	ACG	2	6	1343842	1343847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_011831	CGC	2	6	1343873	1343878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_011831	GGATG	2	10	1343933	1343942	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_011831	CCG	2	6	1343955	1343960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_011831	TGCGG	2	10	1343983	1343992	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3565	NC_011831	CG	3	6	1343993	1343998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_011831	GCAGC	2	10	1344007	1344016	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3567	NC_011831	GC	3	6	1344015	1344020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3568	NC_011831	GAA	2	6	1344056	1344061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_011831	AG	3	6	1344089	1344094	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_011831	ATA	2	6	1344134	1344139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_011831	GGC	2	6	1344223	1344228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_011831	GACG	2	8	1344253	1344260	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3573	NC_011831	TCTA	2	8	1344266	1344273	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3574	NC_011831	CGG	2	6	1344293	1344298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_011831	GGC	2	6	1344305	1344310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_011831	ATAG	2	8	1344332	1344339	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_011831	GTA	2	6	1344357	1344362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_011831	CTGG	2	8	1344363	1344370	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3579	NC_011831	GGT	2	6	1344381	1344386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_011831	ATC	2	6	1344454	1344459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_011831	TAACA	2	10	1344472	1344481	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3582	NC_011831	TCT	2	6	1344496	1344501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_011831	ATGC	2	8	1344526	1344533	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3584	NC_011831	GCAT	2	8	1344563	1344570	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3585	NC_011831	CAA	2	6	1350434	1350439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_011831	TGC	2	6	1350463	1350468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_011831	TGC	2	6	1350896	1350901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_011831	CAGG	2	8	1350954	1350961	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3589	NC_011831	CGGT	2	8	1350967	1350974	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3590	NC_011831	GCTT	2	8	1350979	1350986	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3591	NC_011831	ACT	2	6	1351025	1351030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_011831	AC	3	6	1351349	1351354	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3593	NC_011831	CGG	2	6	1351372	1351377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_011831	TGA	2	6	1351378	1351383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_011831	TTGA	2	8	1351409	1351416	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_011831	ATG	2	6	1351428	1351433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_011831	TGG	2	6	1351631	1351636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_011831	AGC	2	6	1351669	1351674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_011831	GTGA	2	8	1351713	1351720	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_011831	TGA	2	6	1352454	1352459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_011831	C	7	7	1352526	1352532	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3602	NC_011831	GC	3	6	1352534	1352539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3603	NC_011831	GACG	2	8	1352552	1352559	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3604	NC_011831	GC	3	6	1352577	1352582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_011831	CCA	2	6	1352610	1352615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3606	NC_011831	CG	4	8	1352627	1352634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3607	NC_011831	TCC	2	6	1352675	1352680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3608	NC_011831	CG	3	6	1352711	1352716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3609	NC_011831	CACC	2	8	1352728	1352735	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3610	NC_011831	CGTG	2	8	1352749	1352756	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3611	NC_011831	GTC	2	6	1352763	1352768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_011831	AAT	2	6	1352964	1352969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_011831	CCG	2	6	1353063	1353068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3614	NC_011831	CGC	2	6	1353081	1353086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3615	NC_011831	CGC	2	6	1353130	1353135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3616	NC_011831	AACGTA	2	12	1353187	1353198	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3617	NC_011831	GA	3	6	1353199	1353204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_011831	ATGG	2	8	1353241	1353248	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_011831	GTT	2	6	1353260	1353265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_011831	CGG	2	6	1353275	1353280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_011831	GGT	2	6	1353352	1353357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_011831	CA	3	6	1353553	1353558	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3623	NC_011831	TCA	2	6	1353586	1353591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_011831	CAA	3	9	1353823	1353831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_011831	CAAAG	2	10	1353853	1353862	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3626	NC_011831	GCA	2	6	1353879	1353884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_011831	CTTT	2	8	1353977	1353984	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3628	NC_011831	T	6	6	1353982	1353987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_011831	AGGA	2	8	1353989	1353996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_011831	CT	3	6	1354008	1354013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3631	NC_011831	ATG	2	6	1354031	1354036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_011831	CTG	2	6	1354049	1354054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_011831	ATG	2	6	1354082	1354087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3635	NC_011831	TCT	2	6	1354249	1354254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3665	NC_011831	TGG	2	6	1356457	1356462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3759	NC_011831	CG	3	6	1403801	1403806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3764	NC_011831	GCT	2	6	1405075	1405080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3766	NC_011831	GTT	2	6	1409366	1409371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3772	NC_011831	CCAATT	2	12	1411034	1411045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3775	NC_011831	CCAT	2	8	1412204	1412211	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3776	NC_011831	GAG	2	6	1412213	1412218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3803	NC_011831	AC	3	6	1421261	1421266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3887	NC_011831	GAAA	2	8	1438996	1439003	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3888	NC_011831	AAC	2	6	1439849	1439854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3889	NC_011831	AC	3	6	1439853	1439858	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3890	NC_011831	CAATA	2	10	1442394	1442403	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3891	NC_011831	TCGCC	2	10	1442423	1442432	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3892	NC_011831	ACCG	2	8	1442440	1442447	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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