MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 12718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011831	CCG	2	6	894357	894362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2502	NC_011831	CAT	2	6	894888	894893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_011831	CGC	2	6	894934	894939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2504	NC_011831	CA	3	6	894940	894945	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2505	NC_011831	GTG	2	6	901262	901267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_011831	C	6	6	901413	901418	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2507	NC_011831	G	6	6	901422	901427	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_011831	AGG	2	6	901430	901435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_011831	CTC	2	6	902712	902717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2510	NC_011831	CGA	2	6	902761	902766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_011831	CAG	2	6	902775	902780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_011831	CAG	2	6	902816	902821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_011831	ATG	2	6	902822	902827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_011831	AGG	2	6	902862	902867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_011831	AGA	2	6	903354	903359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_011831	TCC	2	6	904204	904209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2517	NC_011831	AGT	2	6	904304	904309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_011831	AGA	2	6	904363	904368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_011831	AAC	2	6	904384	904389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_011831	CTG	2	6	904411	904416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_011831	ACC	2	6	907312	907317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2522	NC_011831	CTC	2	6	907381	907386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2523	NC_011831	GC	3	6	908777	908782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2524	NC_011831	ACA	2	6	908783	908788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_011831	AGTACA	2	12	908823	908834	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2526	NC_011831	GTG	2	6	908839	908844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_011831	TA	3	6	908853	908858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_011831	GTT	2	6	908859	908864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_011831	ACG	2	6	908908	908913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_011831	GAT	2	6	908975	908980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_011831	GAGT	2	8	908997	909004	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_011831	GCCC	2	8	909132	909139	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2533	NC_011831	TCA	2	6	909140	909145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_011831	TAC	2	6	909169	909174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_011831	CTC	2	6	913876	913881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2536	NC_011831	CAA	2	6	913890	913895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_011831	ACC	2	6	913928	913933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2538	NC_011831	TCA	2	6	913973	913978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_011831	ATAGA	2	10	914002	914011	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_011831	GC	3	6	915598	915603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2541	NC_011831	CA	3	6	915670	915675	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2542	NC_011831	CAT	2	6	915677	915682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_011831	TGC	2	6	915706	915711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2544	NC_011831	CCT	2	6	918452	918457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2545	NC_011831	TTG	2	6	918481	918486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_011831	AAT	2	6	918497	918502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_011831	AC	3	6	918558	918563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2548	NC_011831	TGC	2	6	918602	918607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_011831	AGCGG	2	10	919967	919976	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2550	NC_011831	GGT	2	6	919977	919982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_011831	CATC	2	8	919996	920003	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2552	NC_011831	CGCT	2	8	920515	920522	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2553	NC_011831	CCA	2	6	920623	920628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2554	NC_011831	CGG	2	6	920631	920636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_011831	GT	3	6	920655	920660	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_011831	TAT	2	6	920690	920695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_011831	ATG	2	6	920702	920707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_011831	GCC	2	6	922545	922550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2559	NC_011831	TCT	2	6	925402	925407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_011831	GAT	2	6	925410	925415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_011831	TAT	2	6	925437	925442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_011831	GTA	2	6	925493	925498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_011831	ACAA	2	8	925521	925528	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2564	NC_011831	ACA	2	6	925554	925559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_011831	ATAA	2	8	928061	928068	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_011831	TGC	2	6	928076	928081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_011831	AC	3	6	928082	928087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2568	NC_011831	GCT	2	6	930898	930903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_011831	TG	3	6	930973	930978	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_011831	CGT	2	6	930980	930985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_011831	ATGC	2	8	931047	931054	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2572	NC_011831	TTGC	2	8	936815	936822	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2573	NC_011831	AAC	2	6	936832	936837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2574	NC_011831	AC	3	6	938395	938400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2575	NC_011831	GGT	2	6	938874	938879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_011831	ACC	2	6	941341	941346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2577	NC_011831	CAA	2	6	941416	941421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_011831	ACC	2	6	941481	941486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2579	NC_011831	TAT	2	6	941496	941501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_011831	CGC	2	6	941514	941519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2581	NC_011831	ATT	2	6	941529	941534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_011831	CAA	2	6	945032	945037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_011831	CAC	2	6	945900	945905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2584	NC_011831	ACC	3	9	945933	945941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2585	NC_011831	TGG	3	9	945943	945951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_011831	GCCC	2	8	946670	946677	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2587	NC_011831	GC	3	6	947485	947490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2588	NC_011831	GTTC	2	8	947568	947575	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2589	NC_011831	TAT	2	6	947612	947617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_011831	GTCG	2	8	947682	947689	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2591	NC_011831	GCC	2	6	954876	954881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2592	NC_011831	TGT	2	6	955000	955005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_011831	CCT	2	6	955373	955378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2594	NC_011831	CCA	2	6	955409	955414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2595	NC_011831	TTG	2	6	956485	956490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_011831	TACCAA	2	12	956491	956502	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_011831	ATCA	2	8	956543	956550	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2598	NC_011831	G	6	6	956576	956581	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_011831	CGGAT	2	10	957111	957120	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2600	NC_011831	CCT	2	6	960340	960345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2601	NC_011831	TAT	2	6	960357	960362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_011831	AC	3	6	960443	960448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2603	NC_011831	ACC	2	6	960477	960482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2604	NC_011831	TCA	3	9	960504	960512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_011831	TG	3	6	960735	960740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_011831	GCA	2	6	960781	960786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2607	NC_011831	ACA	2	6	960823	960828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2608	NC_011831	AGT	2	6	960929	960934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_011831	CAC	2	6	960935	960940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2610	NC_011831	TGT	2	6	960987	960992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_011831	TGT	2	6	961003	961008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_011831	AAGA	2	8	961022	961029	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_011831	AC	3	6	962702	962707	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2614	NC_011831	AGTA	2	8	962769	962776	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_011831	CAA	2	6	964494	964499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_011831	GC	3	6	964527	964532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2617	NC_011831	TA	4	8	964543	964550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_011831	TGC	2	6	965296	965301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2619	NC_011831	TC	3	6	966810	966815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2620	NC_011831	GTG	2	6	966817	966822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_011831	CAG	2	6	969146	969151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2622	NC_011831	ATG	2	6	969203	969208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_011831	TCG	2	6	971098	971103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_011831	ACA	2	6	972961	972966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_011831	ATA	2	6	972991	972996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_011831	TA	3	6	973044	973049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_011831	GAA	2	6	977055	977060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_011831	TGA	2	6	977069	977074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_011831	AG	3	6	978209	978214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_011831	G	6	6	978263	978268	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_011831	AG	3	6	984404	984409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_011831	TGA	2	6	986951	986956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_011831	GC	3	6	987000	987005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2634	NC_011831	AGG	2	6	987034	987039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2635	NC_011831	CCA	2	6	988215	988220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2636	NC_011831	CAA	2	6	988235	988240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2637	NC_011831	ACA	2	6	988295	988300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2639	NC_011831	GAC	2	6	994450	994455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2641	NC_011831	G	6	6	1001412	1001417	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2642	NC_011831	AGGGG	2	10	1001418	1001427	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
2643	NC_011831	GGA	2	6	1001516	1001521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2764	NC_011831	ACCGC	2	10	1064191	1064200	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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2892	NC_011831	GCCTTT	2	12	1085528	1085539	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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