MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 12718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011831	AAATG	2	10	663918	663927	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_011831	CAG	2	6	663983	663988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_011831	CTT	2	6	664035	664040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_011831	TCG	2	6	664098	664103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_011831	A	6	6	664120	664125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_011831	GCT	2	6	664146	664151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_011831	GAG	2	6	664180	664185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_011831	CTCGCA	2	12	668590	668601	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_011831	CTGA	2	8	668633	668640	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1510	NC_011831	GCA	2	6	668659	668664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_011831	T	6	6	668737	668742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_011831	AC	3	6	670450	670455	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_011831	TGA	2	6	675561	675566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_011831	TAT	2	6	678205	678210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_011831	T	6	6	678323	678328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_011831	A	6	6	678334	678339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_011831	GCG	2	6	683511	683516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_011831	CCG	2	6	683534	683539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_011831	GCT	2	6	685774	685779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_011831	GCG	2	6	685781	685786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_011831	TAC	2	6	685800	685805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_011831	CAA	2	6	685828	685833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_011831	GAG	2	6	685919	685924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_011831	CAT	2	6	685999	686004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_011831	AGAC	2	8	686042	686049	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1526	NC_011831	AGCG	2	8	686089	686096	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_011831	GAT	2	6	686100	686105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_011831	GTC	2	6	686154	686159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_011831	CCA	2	6	686201	686206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_011831	AAGCG	2	10	686272	686281	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1531	NC_011831	GCT	2	6	686341	686346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_011831	CA	3	6	686374	686379	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_011831	GCT	2	6	687982	687987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_011831	TCG	2	6	688122	688127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_011831	GAT	2	6	688128	688133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_011831	GCC	2	6	688144	688149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_011831	CG	3	6	688190	688195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1538	NC_011831	GGC	2	6	688198	688203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_011831	GCGGT	3	15	688211	688225	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1540	NC_011831	TCG	2	6	688282	688287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_011831	TCA	2	6	688288	688293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_011831	TCG	2	6	688343	688348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_011831	GAT	2	6	688349	688354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_011831	GCC	2	6	688365	688370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_011831	GGT	2	6	688442	688447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_011831	GTT	2	6	688564	688569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_011831	CGCTC	2	10	688580	688589	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1548	NC_011831	ACC	2	6	688629	688634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_011831	TCAC	2	8	688660	688667	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1550	NC_011831	GTT	2	6	688786	688791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_011831	CGCTC	2	10	688802	688811	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1552	NC_011831	ACC	2	6	688851	688856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_011831	TCAC	2	8	688882	688889	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_011831	GTT	2	6	689008	689013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_011831	CGCTC	2	10	689024	689033	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1556	NC_011831	ACC	2	6	689073	689078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_011831	TCAC	2	8	689104	689111	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1558	NC_011831	GTT	2	6	689230	689235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_011831	CGCTC	2	10	689246	689255	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1560	NC_011831	ACC	2	6	689295	689300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_011831	TCAC	2	8	689326	689333	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_011831	GC	3	6	689464	689469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_011831	CGA	2	6	689523	689528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_011831	CTCGT	2	10	689681	689690	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1565	NC_011831	AGT	2	6	689698	689703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_011831	CG	3	6	689912	689917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_011831	TCT	2	6	689970	689975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_011831	TTC	2	6	689978	689983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_011831	TTC	2	6	689987	689992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_011831	TG	3	6	690065	690070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_011831	GCA	2	6	690126	690131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_011831	TAC	2	6	690200	690205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_011831	CTCC	2	8	690206	690213	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1574	NC_011831	GGTA	2	8	690332	690339	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_011831	CGT	2	6	690347	690352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_011831	GTC	2	6	690405	690410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_011831	AGC	2	6	690472	690477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_011831	GC	3	6	690484	690489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_011831	TCT	2	6	690500	690505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_011831	GT	3	6	690559	690564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_011831	TAA	2	6	690567	690572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_011831	GTTG	2	8	690579	690586	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_011831	CG	3	6	690646	690651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_011831	AAC	2	6	690652	690657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_011831	TCGGT	2	10	690703	690712	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1586	NC_011831	TGC	2	6	690851	690856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_011831	CGC	2	6	690928	690933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1588	NC_011831	CAC	2	6	690941	690946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1589	NC_011831	ACG	2	6	691001	691006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_011831	CGTGT	2	10	691153	691162	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1591	NC_011831	TGT	2	6	691221	691226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_011831	CCAA	2	8	691238	691245	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1593	NC_011831	AGA	2	6	691321	691326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_011831	CAA	2	6	691442	691447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_011831	CAA	2	6	691457	691462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_011831	AC	3	6	691467	691472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_011831	GAAA	2	8	691579	691586	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_011831	GAAA	2	8	691653	691660	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_011831	GCT	2	6	691804	691809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_011831	ACCG	2	8	691975	691982	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_011831	TAG	2	6	692035	692040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_011831	TGT	2	6	692060	692065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_011831	GACC	2	8	692109	692116	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_011831	T	6	6	692192	692197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_011831	CCT	2	6	692344	692349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1606	NC_011831	GTTT	2	8	692352	692359	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_011831	GACC	2	8	692401	692408	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1608	NC_011831	CTT	2	6	692480	692485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_011831	ACCGT	2	10	692489	692498	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1610	NC_011831	CGG	2	6	692538	692543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_011831	CAC	2	6	692627	692632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_011831	TCG	2	6	692687	692692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_011831	CG	3	6	692708	692713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_011831	TGC	2	6	692903	692908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_011831	GCC	2	6	693130	693135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1616	NC_011831	CGC	2	6	693150	693155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1617	NC_011831	CGACC	2	10	693204	693213	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1618	NC_011831	AAG	2	6	693272	693277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_011831	GTG	2	6	693358	693363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_011831	GCG	2	6	693368	693373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_011831	TCG	2	6	693456	693461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_011831	CCGTC	2	10	693504	693513	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1623	NC_011831	TTC	2	6	693578	693583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_011831	GACGG	2	10	693596	693605	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1625	NC_011831	GTC	2	6	693895	693900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_011831	GC	3	6	694032	694037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1627	NC_011831	GTT	2	6	694053	694058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_011831	CGCA	2	8	694192	694199	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_011831	AGCCA	2	10	694309	694318	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1630	NC_011831	TAC	2	6	694396	694401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_011831	GCCGA	2	10	694559	694568	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1632	NC_011831	CGC	2	6	694697	694702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1633	NC_011831	CGA	2	6	694934	694939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_011831	GAG	2	6	695217	695222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_011831	GAT	2	6	695275	695280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1753	NC_011831	TGCGC	2	10	721011	721020	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1762	NC_011831	GTTT	2	8	725858	725865	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1763	NC_011831	CCT	2	6	727311	727316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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