MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 12718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011831	AG	3	6	540527	540532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011831	TTG	2	6	542010	542015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_011831	TTG	2	6	542039	542044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011831	ACA	2	6	543057	543062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_011831	TGA	2	6	543143	543148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011831	TGA	2	6	543197	543202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_011831	TTC	2	6	543255	543260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_011831	CAT	2	6	543268	543273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_011831	TCC	2	6	543415	543420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_011831	GAT	2	6	543435	543440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_011831	TGA	2	6	543461	543466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_011831	A	7	7	543512	543518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_011831	A	6	6	543544	543549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_011831	GGAC	2	8	543656	543663	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_011831	GGC	2	6	543666	543671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_011831	GAA	2	6	543694	543699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_011831	CGTGG	2	10	543770	543779	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1018	NC_011831	CGC	2	6	543815	543820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_011831	TCG	2	6	543879	543884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_011831	ATC	2	6	544015	544020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_011831	TGT	2	6	544044	544049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_011831	GGATCG	2	12	544112	544123	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1023	NC_011831	CAC	2	6	544146	544151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_011831	TCGCT	2	10	544158	544167	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1025	NC_011831	GAA	2	6	544197	544202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_011831	CA	3	6	544209	544214	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_011831	TGCAC	2	10	544257	544266	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1028	NC_011831	TGA	2	6	544293	544298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_011831	AC	3	6	544338	544343	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_011831	CGC	2	6	544344	544349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_011831	GCG	2	6	544395	544400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_011831	ACGGT	2	10	544427	544436	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1033	NC_011831	AGC	2	6	544444	544449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_011831	GCG	2	6	544472	544477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_011831	CGA	2	6	544517	544522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_011831	CAT	2	6	544584	544589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_011831	CAT	2	6	544676	544681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_011831	CTC	2	6	544682	544687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_011831	GGA	2	6	544728	544733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_011831	GATT	2	8	544740	544747	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_011831	CAC	2	6	544784	544789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_011831	CGC	2	6	544876	544881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_011831	GGC	2	6	544886	544891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_011831	TGC	2	6	545002	545007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_011831	CGG	2	6	546360	546365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_011831	AAT	2	6	551746	551751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_011831	AAC	2	6	551768	551773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_011831	TAG	2	6	551890	551895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_011831	CAA	2	6	551896	551901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_011831	GTT	2	6	551915	551920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_011831	AGCG	2	8	551936	551943	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_011831	CAA	2	6	552687	552692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_011831	ACC	2	6	554234	554239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_011831	GTTC	2	8	554277	554284	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_011831	GTC	2	6	554380	554385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_011831	ATC	2	6	554403	554408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_011831	CG	3	6	554418	554423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_011831	TAC	2	6	554453	554458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_011831	GAG	3	9	554994	555002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_011831	CCG	2	6	555675	555680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_011831	AACC	2	8	555705	555712	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_011831	ATT	2	6	555741	555746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_011831	ACA	2	6	555906	555911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_011831	GAT	2	6	556302	556307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_011831	GTA	2	6	556347	556352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_011831	TGT	2	6	556393	556398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_011831	TCG	2	6	556427	556432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_011831	GTT	2	6	556490	556495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_011831	TCT	2	6	556507	556512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_011831	GT	3	6	556579	556584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_011831	TTCG	2	8	556667	556674	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_011831	TTG	2	6	556693	556698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_011831	GTT	2	6	556761	556766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_011831	TC	3	6	556789	556794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_011831	GT	3	6	556830	556835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_011831	GAGC	2	8	556893	556900	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1077	NC_011831	GCC	2	6	556929	556934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_011831	CTAT	2	8	559496	559503	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_011831	GGATTG	2	12	559562	559573	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_011831	GGC	2	6	559585	559590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_011831	C	7	7	559711	559717	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1082	NC_011831	AAC	3	9	559741	559749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_011831	CCT	2	6	559760	559765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_011831	CAC	2	6	559857	559862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_011831	A	8	8	559927	559934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_011831	TCCTCT	2	12	559973	559984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_011831	TCC	2	6	559994	559999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_011831	CAT	2	6	560025	560030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_011831	GCG	2	6	560105	560110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_011831	CAT	2	6	560231	560236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_011831	GAC	2	6	560259	560264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_011831	TCC	2	6	560275	560280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_011831	CCA	2	6	560333	560338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_011831	ACCG	2	8	560340	560347	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_011831	C	7	7	560371	560377	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1096	NC_011831	CCA	2	6	560490	560495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_011831	CTCC	2	8	560505	560512	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1098	NC_011831	CCG	2	6	560531	560536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_011831	CGC	2	6	560558	560563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_011831	AGCGA	2	10	561549	561558	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1101	NC_011831	TTG	2	6	561610	561615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_011831	AAC	2	6	561659	561664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_011831	CA	3	6	561703	561708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_011831	AGCA	2	8	561723	561730	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_011831	ATGC	2	8	561744	561751	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1106	NC_011831	A	6	6	561824	561829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_011831	T	6	6	561848	561853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_011831	ATT	2	6	561954	561959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_011831	CCA	2	6	561960	561965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_011831	TAGAA	2	10	562784	562793	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011831	GGA	2	6	562859	562864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_011831	TGA	2	6	562877	562882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_011831	TCC	2	6	562893	562898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_011831	AAGC	2	8	562985	562992	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_011831	CTT	2	6	563147	563152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_011831	GTA	2	6	563201	563206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_011831	CAA	2	6	563246	563251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_011831	AC	3	6	564042	564047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_011831	AG	3	6	564097	564102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_011831	ATT	2	6	564231	564236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_011831	CAA	2	6	564292	564297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_011831	GCT	2	6	564320	564325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_011831	TCC	2	6	564339	564344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_011831	CTC	2	6	564404	564409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_011831	GTG	2	6	564440	564445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_011831	CT	3	6	564546	564551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_011831	GAG	2	6	564626	564631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_011831	CCT	2	6	564637	564642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_011831	TCCCA	2	10	564733	564742	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1130	NC_011831	CAT	2	6	564783	564788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_011831	CAG	2	6	564797	564802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_011831	CAG	2	6	564804	564809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_011831	CCAC	2	8	564886	564893	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1134	NC_011831	CTG	2	6	564894	564899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_011831	CAT	2	6	564976	564981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1399	NC_011831	CATT	2	8	616728	616735	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1400	NC_011831	AGAA	2	8	616753	616760	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1401	NC_011831	C	6	6	618126	618131	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1409	NC_011831	TAAGG	2	10	619798	619807	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_011831	CTG	2	6	620569	620574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1412	NC_011831	GCC	2	6	620670	620675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1432	NC_011831	CAA	2	6	626855	626860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1441	NC_011831	CAA	2	6	627477	627482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1452	NC_011831	CAA	2	6	628227	628232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1478	NC_011831	CTTGA	2	10	655251	655260	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1483	NC_011831	TGC	2	6	657273	657278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1488	NC_011831	TGA	2	6	658730	658735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1500	NC_011831	GCTC	2	8	663898	663905	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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