MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 12718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011831	CTT	3	9	4558315	4558323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12502	NC_011831	CGCTT	2	10	4558337	4558346	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12503	NC_011831	AGC	2	6	4563007	4563012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12504	NC_011831	ATC	2	6	4563030	4563035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_011831	GAC	2	6	4563116	4563121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12506	NC_011831	ATC	2	6	4563131	4563136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12507	NC_011831	CTT	2	6	4563184	4563189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12508	NC_011831	TCG	2	6	4566725	4566730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12509	NC_011831	TTA	2	6	4566740	4566745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_011831	CAGG	2	8	4566829	4566836	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12511	NC_011831	GC	3	6	4566857	4566862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12512	NC_011831	TGA	2	6	4567407	4567412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_011831	GTT	2	6	4567430	4567435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_011831	TCC	2	6	4567495	4567500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12515	NC_011831	CTA	2	6	4568655	4568660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_011831	GAG	2	6	4568697	4568702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_011831	GTT	2	6	4570084	4570089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_011831	TGC	2	6	4570150	4570155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_011831	TGG	2	6	4572371	4572376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_011831	ATC	2	6	4572450	4572455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12521	NC_011831	GTA	2	6	4572504	4572509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_011831	GGT	2	6	4572517	4572522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_011831	AT	3	6	4575375	4575380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_011831	AGT	2	6	4575388	4575393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_011831	GCA	2	6	4576084	4576089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12526	NC_011831	AAC	2	6	4576134	4576139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12527	NC_011831	AAG	2	6	4576159	4576164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_011831	TTGTC	2	10	4576172	4576181	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12529	NC_011831	AAGT	2	8	4576225	4576232	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_011831	CGG	2	6	4576239	4576244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12531	NC_011831	CGG	2	6	4579165	4579170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12532	NC_011831	GTG	2	6	4579180	4579185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_011831	GT	3	6	4579200	4579205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_011831	GTG	2	6	4579208	4579213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_011831	TCT	2	6	4581823	4581828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12536	NC_011831	A	7	7	4581837	4581843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_011831	TGT	2	6	4583596	4583601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_011831	CTTG	2	8	4583633	4583640	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12539	NC_011831	ACC	2	6	4584944	4584949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12540	NC_011831	CTTC	2	8	4587146	4587153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12541	NC_011831	GAA	2	6	4587183	4587188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_011831	GC	3	6	4587220	4587225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12543	NC_011831	AAGGA	2	10	4587321	4587330	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_011831	GTG	2	6	4587404	4587409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_011831	AAGG	2	8	4587465	4587472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_011831	CGT	3	9	4589400	4589408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12547	NC_011831	CAC	2	6	4589409	4589414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12548	NC_011831	ATC	2	6	4589442	4589447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12549	NC_011831	T	6	6	4589796	4589801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_011831	AGGC	2	8	4590009	4590016	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12551	NC_011831	ATG	2	6	4590054	4590059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_011831	AGG	2	6	4590062	4590067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_011831	TCG	2	6	4590521	4590526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12554	NC_011831	CCT	2	6	4590556	4590561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12555	NC_011831	ATT	2	6	4590656	4590661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_011831	AGG	2	6	4591687	4591692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_011831	GATAA	2	10	4592832	4592841	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_011831	TC	3	6	4596786	4596791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12559	NC_011831	ACC	2	6	4596834	4596839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12560	NC_011831	TCGG	2	8	4596878	4596885	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12561	NC_011831	CCT	2	6	4597661	4597666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12562	NC_011831	CTG	2	6	4597706	4597711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12563	NC_011831	CGGT	2	8	4597729	4597736	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12564	NC_011831	ACC	2	6	4601075	4601080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12565	NC_011831	ATC	2	6	4601112	4601117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12566	NC_011831	CTC	2	6	4601912	4601917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12567	NC_011831	GGC	2	6	4604451	4604456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12568	NC_011831	CTG	2	6	4604459	4604464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12569	NC_011831	GCG	2	6	4604496	4604501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12570	NC_011831	CCA	2	6	4604679	4604684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12571	NC_011831	CAT	2	6	4604694	4604699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12572	NC_011831	ATG	2	6	4604704	4604709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_011831	T	6	6	4604715	4604720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_011831	TCC	2	6	4610658	4610663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12575	NC_011831	GTA	2	6	4610771	4610776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12576	NC_011831	TTG	2	6	4610777	4610782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12577	NC_011831	CA	3	6	4611810	4611815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12578	NC_011831	CGG	2	6	4611830	4611835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12579	NC_011831	TTGA	2	8	4613224	4613231	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12580	NC_011831	AG	3	6	4613236	4613241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12581	NC_011831	TGC	2	6	4613705	4613710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12582	NC_011831	TCG	2	6	4614691	4614696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12583	NC_011831	AGAGG	2	10	4614866	4614875	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12584	NC_011831	GCG	2	6	4614879	4614884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12585	NC_011831	CCT	2	6	4614953	4614958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12586	NC_011831	GAAG	2	8	4614982	4614989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12587	NC_011831	CGG	2	6	4614996	4615001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12588	NC_011831	CAC	2	6	4615096	4615101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12589	NC_011831	CCT	2	6	4616712	4616717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12590	NC_011831	ATA	2	6	4616721	4616726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12591	NC_011831	TAT	2	6	4616747	4616752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_011831	ACA	2	6	4616766	4616771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12593	NC_011831	GCG	2	6	4618689	4618694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12594	NC_011831	ATC	2	6	4618696	4618701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12595	NC_011831	GT	3	6	4621401	4621406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_011831	GC	3	6	4621455	4621460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12597	NC_011831	GCT	2	6	4621493	4621498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12598	NC_011831	CG	3	6	4621593	4621598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12599	NC_011831	CAT	2	6	4621613	4621618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12600	NC_011831	GC	3	6	4621682	4621687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12601	NC_011831	A	6	6	4623224	4623229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12602	NC_011831	CCT	2	6	4625231	4625236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12603	NC_011831	TCC	2	6	4627334	4627339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12604	NC_011831	TTA	2	6	4627386	4627391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12605	NC_011831	GCT	2	6	4627425	4627430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12606	NC_011831	TATCCT	2	12	4629491	4629502	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12607	NC_011831	GTT	2	6	4629524	4629529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_011831	TGATA	2	10	4629539	4629548	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12609	NC_011831	GAT	2	6	4629552	4629557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_011831	AG	3	6	4629571	4629576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12611	NC_011831	TTC	2	6	4629578	4629583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12612	NC_011831	GC	3	6	4630946	4630951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12613	NC_011831	GCA	2	6	4631639	4631644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12614	NC_011831	GGT	2	6	4631649	4631654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_011831	ATTC	2	8	4631657	4631664	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12616	NC_011831	AGT	2	6	4633031	4633036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_011831	ATG	2	6	4634308	4634313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12618	NC_011831	ATT	2	6	4635621	4635626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12619	NC_011831	GCTAT	2	10	4635633	4635642	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12620	NC_011831	AATG	2	8	4636865	4636872	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12621	NC_011831	CGC	2	6	4636895	4636900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12622	NC_011831	CCAA	2	8	4636933	4636940	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12623	NC_011831	GA	3	6	4636941	4636946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12624	NC_011831	AC	3	6	4636960	4636965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12625	NC_011831	CAT	2	6	4639703	4639708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12626	NC_011831	CAC	2	6	4639819	4639824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12628	NC_011831	CAC	2	6	4639902	4639907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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