MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 12718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_011831	GTG	2	6	4393687	4393692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12002	NC_011831	GCGG	2	8	4393793	4393800	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12003	NC_011831	GCT	2	6	4393806	4393811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12004	NC_011831	GTG	2	6	4393812	4393817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12005	NC_011831	GTA	2	6	4393863	4393868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12006	NC_011831	GCGG	2	8	4393918	4393925	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12007	NC_011831	GCT	2	6	4393931	4393936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12008	NC_011831	GTG	2	6	4393937	4393942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12009	NC_011831	GCGG	2	8	4394043	4394050	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12010	NC_011831	GCT	2	6	4394056	4394061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12011	NC_011831	GTG	2	6	4394062	4394067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12012	NC_011831	GTA	2	6	4394113	4394118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12013	NC_011831	GCT	2	6	4394181	4394186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12014	NC_011831	GTG	2	6	4394187	4394192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12015	NC_011831	GTA	2	6	4394238	4394243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12016	NC_011831	GCGG	2	8	4394293	4394300	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12017	NC_011831	GCT	2	6	4394306	4394311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12018	NC_011831	GTG	2	6	4394312	4394317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12019	NC_011831	GTA	2	6	4394363	4394368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12020	NC_011831	GCGG	2	8	4394418	4394425	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12021	NC_011831	GCT	2	6	4394431	4394436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12022	NC_011831	GTG	2	6	4394437	4394442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12023	NC_011831	GTA	2	6	4394488	4394493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12024	NC_011831	GCGG	2	8	4394543	4394550	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12025	NC_011831	CAC	2	6	4394580	4394585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12026	NC_011831	CAA	2	6	4394592	4394597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12027	NC_011831	TC	3	6	4394609	4394614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12028	NC_011831	ACT	2	6	4395323	4395328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12029	NC_011831	CA	3	6	4395335	4395340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12030	NC_011831	AGG	2	6	4395349	4395354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12031	NC_011831	ACC	2	6	4396455	4396460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12032	NC_011831	GGT	2	6	4396499	4396504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12034	NC_011831	TCT	2	6	4396549	4396554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12035	NC_011831	TCG	2	6	4396619	4396624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12036	NC_011831	GTTGCC	2	12	4396675	4396686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12037	NC_011831	GAG	2	6	4396703	4396708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12039	NC_011831	CG	3	6	4396748	4396753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12040	NC_011831	CGA	2	6	4396764	4396769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12041	NC_011831	GC	3	6	4396781	4396786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12042	NC_011831	ATCG	2	8	4396794	4396801	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12043	NC_011831	CGT	2	6	4396850	4396855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12044	NC_011831	CCA	2	6	4396935	4396940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12045	NC_011831	GTTG	2	8	4396956	4396963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12046	NC_011831	AT	3	6	4396984	4396989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12047	NC_011831	AGG	2	6	4397030	4397035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12048	NC_011831	CTTCCC	2	12	4398326	4398337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12049	NC_011831	CGC	2	6	4398376	4398381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12050	NC_011831	TCA	2	6	4398382	4398387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12051	NC_011831	C	7	7	4398389	4398395	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12052	NC_011831	TAT	2	6	4400717	4400722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12053	NC_011831	GGTAG	2	10	4400740	4400749	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12054	NC_011831	AGG	2	6	4400757	4400762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12055	NC_011831	GCG	2	6	4400796	4400801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12056	NC_011831	AAC	2	6	4400867	4400872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12058	NC_011831	TAC	2	6	4401680	4401685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12059	NC_011831	CTT	2	6	4401752	4401757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12060	NC_011831	ACC	2	6	4401766	4401771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12061	NC_011831	GGT	2	6	4401854	4401859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12062	NC_011831	ATT	2	6	4402003	4402008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12063	NC_011831	AT	3	6	4402016	4402021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12064	NC_011831	GT	3	6	4402027	4402032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12065	NC_011831	TGT	2	6	4402069	4402074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12069	NC_011831	AGG	2	6	4405271	4405276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12070	NC_011831	GCTC	2	8	4405657	4405664	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12071	NC_011831	AGCC	2	8	4405665	4405672	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12072	NC_011831	CGG	2	6	4405702	4405707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12073	NC_011831	CTA	2	6	4405730	4405735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12076	NC_011831	CCT	2	6	4406861	4406866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12077	NC_011831	AAC	2	6	4408208	4408213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12078	NC_011831	TGA	2	6	4408277	4408282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12079	NC_011831	TAA	2	6	4408290	4408295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12080	NC_011831	ATC	2	6	4408465	4408470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12081	NC_011831	CCGC	2	8	4408986	4408993	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12082	NC_011831	CAC	2	6	4409016	4409021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12083	NC_011831	GCC	2	6	4409031	4409036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12084	NC_011831	CCACC	2	10	4409049	4409058	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
12085	NC_011831	GCC	2	6	4409113	4409118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12086	NC_011831	GCC	2	6	4409176	4409181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12087	NC_011831	GCC	2	6	4409223	4409228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12088	NC_011831	GCC	2	6	4409254	4409259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12089	NC_011831	TCAAG	2	10	4409278	4409287	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12090	NC_011831	GTC	3	9	4409328	4409336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12092	NC_011831	TAT	2	6	4409940	4409945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12093	NC_011831	CAG	2	6	4409955	4409960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12094	NC_011831	TCCT	3	12	4410004	4410015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12095	NC_011831	CG	3	6	4411038	4411043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12096	NC_011831	CGC	2	6	4411155	4411160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12097	NC_011831	TGC	2	6	4411171	4411176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12098	NC_011831	CTT	2	6	4411184	4411189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12099	NC_011831	CCG	2	6	4411191	4411196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12100	NC_011831	TCC	2	6	4411201	4411206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12101	NC_011831	GTGA	2	8	4411245	4411252	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12102	NC_011831	CTG	3	9	4411273	4411281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12103	NC_011831	CGT	2	6	4411407	4411412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12104	NC_011831	TCG	2	6	4411425	4411430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12105	NC_011831	GCT	3	9	4411473	4411481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12106	NC_011831	TCC	2	6	4411502	4411507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12107	NC_011831	TTA	2	6	4411639	4411644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12108	NC_011831	GCA	2	6	4411707	4411712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12109	NC_011831	TGC	2	6	4411716	4411721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12110	NC_011831	TGC	2	6	4411742	4411747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12111	NC_011831	TCT	2	6	4411748	4411753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12112	NC_011831	TTC	2	6	4411771	4411776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12113	NC_011831	GTC	2	6	4411794	4411799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12114	NC_011831	GGT	2	6	4411942	4411947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12115	NC_011831	TGT	2	6	4413958	4413963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12116	NC_011831	T	6	6	4417029	4417034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12117	NC_011831	AGC	2	6	4419012	4419017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12118	NC_011831	GATG	2	8	4419021	4419028	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12119	NC_011831	CAT	2	6	4419088	4419093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12120	NC_011831	TAA	2	6	4419096	4419101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12121	NC_011831	ATG	2	6	4419106	4419111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12122	NC_011831	GTATC	2	10	4419131	4419140	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12123	NC_011831	GTT	2	6	4419150	4419155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12124	NC_011831	GT	3	6	4421358	4421363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12125	NC_011831	CT	3	6	4421402	4421407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12126	NC_011831	GA	3	6	4421445	4421450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12127	NC_011831	ACG	2	6	4424211	4424216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12129	NC_011831	TCC	2	6	4424298	4424303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12130	NC_011831	GA	3	6	4428146	4428151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12131	NC_011831	GCAA	2	8	4428170	4428177	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12132	NC_011831	AGT	2	6	4429353	4429358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12157	NC_011831	TCC	2	6	4448745	4448750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12239	NC_011831	GAGG	2	8	4485445	4485452	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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12244	NC_011831	TTG	2	6	4486695	4486700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12245	NC_011831	AGGT	2	8	4486764	4486771	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12246	NC_011831	GA	4	8	4486777	4486784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12247	NC_011831	A	6	6	4486894	4486899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12248	NC_011831	TGCT	2	8	4486931	4486938	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12249	NC_011831	GAG	2	6	4486953	4486958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12250	NC_011831	CTGT	2	8	4487274	4487281	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12251	NC_011831	CT	3	6	4493785	4493790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12252	NC_011831	CCA	2	6	4493835	4493840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12253	NC_011831	GC	3	6	4493855	4493860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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12258	NC_011831	GA	3	6	4495061	4495066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12259	NC_011831	TCCG	2	8	4495153	4495160	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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12500	NC_011831	TACTA	2	10	4558261	4558270	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

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