MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 12718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_011831	AGC	2	6	2983627	2983632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_011831	ACA	2	6	2983699	2983704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_011831	TTG	2	6	2983726	2983731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_011831	GAG	2	6	2986908	2986913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_011831	AGCAA	2	10	2991744	2991753	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8006	NC_011831	TGA	2	6	2991783	2991788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_011831	TCGG	2	8	2992583	2992590	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8008	NC_011831	GTG	2	6	2992610	2992615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_011831	CG	3	6	2992624	2992629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8010	NC_011831	CCA	2	6	2992696	2992701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8011	NC_011831	TAG	2	6	2992703	2992708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_011831	ATG	2	6	2992710	2992715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_011831	CCG	2	6	2992777	2992782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8014	NC_011831	AAT	2	6	2992823	2992828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_011831	TAAT	2	8	2994500	2994507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_011831	ACC	2	6	2994543	2994548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8017	NC_011831	GTC	2	6	2999528	2999533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_011831	CAT	2	6	2999647	2999652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_011831	TTG	2	6	2999740	2999745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_011831	ATT	2	6	2999774	2999779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_011831	ATTT	2	8	2999790	2999797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_011831	GT	3	6	2999829	2999834	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_011831	CGG	2	6	2999837	2999842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_011831	CGG	2	6	2999847	2999852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_011831	CGG	2	6	2999855	2999860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_011831	CGG	2	6	2999879	2999884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_011831	CCT	2	6	3004011	3004016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8028	NC_011831	TCC	2	6	3006846	3006851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8029	NC_011831	AT	3	6	3007225	3007230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_011831	GAC	2	6	3007283	3007288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_011831	GC	3	6	3007348	3007353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8032	NC_011831	GGGA	2	8	3007364	3007371	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_011831	TAC	2	6	3007379	3007384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_011831	CAC	2	6	3007409	3007414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8035	NC_011831	GCG	2	6	3007418	3007423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_011831	GC	3	6	3007445	3007450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8037	NC_011831	T	6	6	3007486	3007491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_011831	CAAG	2	8	3007516	3007523	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8039	NC_011831	GTG	2	6	3007525	3007530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_011831	GGC	2	6	3007589	3007594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_011831	ATGC	2	8	3007602	3007609	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8042	NC_011831	CAC	2	6	3007669	3007674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8043	NC_011831	GGA	2	6	3007730	3007735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_011831	GCA	3	9	3007879	3007887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_011831	CGC	2	6	3007926	3007931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8046	NC_011831	GGA	2	6	3007934	3007939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_011831	ACC	2	6	3007990	3007995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8048	NC_011831	AGC	2	6	3007999	3008004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_011831	CAG	2	6	3008022	3008027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_011831	CTG	2	6	3008093	3008098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_011831	GC	3	6	3008135	3008140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8052	NC_011831	GTG	2	6	3008171	3008176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_011831	GGA	2	6	3008213	3008218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_011831	GCG	2	6	3008261	3008266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_011831	GC	3	6	3008340	3008345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8056	NC_011831	GCCG	2	8	3008380	3008387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8057	NC_011831	AGC	2	6	3008444	3008449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_011831	GAA	2	6	3008479	3008484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_011831	TGC	2	6	3008553	3008558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_011831	GTC	2	6	3008565	3008570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_011831	TCGTG	2	10	3008574	3008583	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8062	NC_011831	GCC	2	6	3008650	3008655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8063	NC_011831	CGG	2	6	3008661	3008666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_011831	AC	4	8	3008716	3008723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8065	NC_011831	CGC	2	6	3008753	3008758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8066	NC_011831	GGC	2	6	3008761	3008766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_011831	AC	3	6	3008885	3008890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8068	NC_011831	CGTCA	2	10	3008895	3008904	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8069	NC_011831	CCT	2	6	3009030	3009035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8070	NC_011831	CAC	2	6	3009088	3009093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8071	NC_011831	CGGTCG	2	12	3009124	3009135	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_011831	TG	3	6	3009169	3009174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_011831	C	6	6	3009190	3009195	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8074	NC_011831	CGG	2	6	3009271	3009276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8075	NC_011831	CAC	2	6	3009306	3009311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8076	NC_011831	TGC	2	6	3009318	3009323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8077	NC_011831	GCC	2	6	3009405	3009410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8078	NC_011831	GGT	2	6	3009540	3009545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_011831	GCG	2	6	3009569	3009574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_011831	TG	4	8	3009589	3009596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_011831	C	6	6	3009602	3009607	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8082	NC_011831	CCA	2	6	3009635	3009640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8083	NC_011831	CA	3	6	3009639	3009644	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8084	NC_011831	CTTGC	2	10	3009655	3009664	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8085	NC_011831	GCC	2	6	3009743	3009748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8086	NC_011831	GCC	2	6	3009777	3009782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8087	NC_011831	GCC	2	6	3009919	3009924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8088	NC_011831	ACC	2	6	3009980	3009985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8089	NC_011831	CGA	2	6	3010036	3010041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8090	NC_011831	GGT	2	6	3010055	3010060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_011831	GCA	2	6	3010061	3010066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8092	NC_011831	TG	3	6	3010104	3010109	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_011831	C	6	6	3010115	3010120	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8094	NC_011831	CCA	2	6	3010149	3010154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8095	NC_011831	CA	3	6	3010153	3010158	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8096	NC_011831	CTG	2	6	3010183	3010188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8097	NC_011831	CGG	2	6	3010230	3010235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8098	NC_011831	CGG	2	6	3010304	3010309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_011831	CAC	2	6	3010339	3010344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8100	NC_011831	TGC	2	6	3010351	3010356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_011831	GCC	2	6	3010438	3010443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8102	NC_011831	GGT	2	6	3010573	3010578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_011831	TG	4	8	3010622	3010629	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_011831	C	6	6	3010635	3010640	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8105	NC_011831	CAC	2	6	3010669	3010674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8106	NC_011831	CAG	2	6	3010676	3010681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8107	NC_011831	CTG	2	6	3010703	3010708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8108	NC_011831	TAGC	2	8	3010725	3010732	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8109	NC_011831	GT	3	6	3010735	3010740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_011831	ACT	2	6	3010759	3010764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8111	NC_011831	GTC	2	6	3010773	3010778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_011831	GTT	2	6	3011317	3011322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_011831	ATG	2	6	3011346	3011351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_011831	T	6	6	3011369	3011374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_011831	ATC	2	6	3012861	3012866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_011831	TGA	2	6	3016273	3016278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_011831	TTGG	2	8	3016301	3016308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8119	NC_011831	TCG	2	6	3016401	3016406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_011831	CGGCG	2	10	3018793	3018802	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8121	NC_011831	ATT	2	6	3018865	3018870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_011831	AGT	2	6	3018937	3018942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8126	NC_011831	CCT	2	6	3019973	3019978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8127	NC_011831	GCT	2	6	3019983	3019988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8128	NC_011831	TCT	2	6	3019990	3019995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8129	NC_011831	TGA	2	6	3023245	3023250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_011831	GTAT	2	8	3023261	3023268	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_011831	TAT	2	6	3023281	3023286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_011831	ACA	2	6	3023317	3023322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8133	NC_011831	GACT	2	8	3023389	3023396	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8134	NC_011831	CGC	2	6	3023662	3023667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8136	NC_011831	TGAT	2	8	3023782	3023789	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8140	NC_011831	TAC	2	6	3024530	3024535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8144	NC_011831	GCACG	2	10	3028391	3028400	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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8146	NC_011831	GGCAC	2	10	3028469	3028478	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8147	NC_011831	GCACG	2	10	3028551	3028560	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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8152	NC_011831	CTTG	2	8	3032935	3032942	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8153	NC_011831	ATT	2	6	3032978	3032983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8162	NC_011831	TGA	2	6	3036004	3036009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8164	NC_011831	TCC	2	6	3036058	3036063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8171	NC_011831	A	6	6	3036281	3036286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8247	NC_011831	CCG	2	6	3058309	3058314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8248	NC_011831	CCG	2	6	3058407	3058412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8249	NC_011831	CCG	2	6	3058505	3058510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8250	NC_011831	CCG	2	6	3058603	3058608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8251	NC_011831	CCG	2	6	3058740	3058745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8252	NC_011831	CCG	2	6	3058838	3058843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8255	NC_011831	TG	3	6	3059017	3059022	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8256	NC_011831	CCG	2	6	3059034	3059039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8259	NC_011831	GC	3	6	3059426	3059431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8260	NC_011831	CCCT	2	8	3059448	3059455	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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