MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 12718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_011831	GCT	3	9	2833922	2833930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7502	NC_011831	ATG	2	6	2834005	2834010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7503	NC_011831	GTT	2	6	2836617	2836622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7504	NC_011831	TAG	2	6	2836642	2836647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7505	NC_011831	CA	3	6	2836695	2836700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7506	NC_011831	GTTT	2	8	2836796	2836803	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7507	NC_011831	AGTCG	2	10	2836816	2836825	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7508	NC_011831	TA	3	6	2838988	2838993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_011831	GCCCC	2	10	2839190	2839199	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
7510	NC_011831	GGTT	2	8	2839237	2839244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_011831	ACT	2	6	2839339	2839344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7512	NC_011831	CCA	2	6	2839369	2839374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7513	NC_011831	CAG	2	6	2839392	2839397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7514	NC_011831	GAA	2	6	2839533	2839538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7515	NC_011831	CCG	2	6	2839570	2839575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7516	NC_011831	TCT	2	6	2839585	2839590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7517	NC_011831	GGC	2	6	2839598	2839603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7518	NC_011831	CAAGGG	2	12	2839671	2839682	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7519	NC_011831	GCC	2	6	2839713	2839718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7520	NC_011831	CGGG	2	8	2839721	2839728	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7521	NC_011831	CAA	2	6	2839736	2839741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7522	NC_011831	AAT	2	6	2839914	2839919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_011831	CT	3	6	2839984	2839989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7524	NC_011831	GTG	2	6	2839999	2840004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_011831	GCA	2	6	2840007	2840012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7526	NC_011831	CTA	2	6	2845581	2845586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7527	NC_011831	GCT	2	6	2848088	2848093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7528	NC_011831	TGTT	2	8	2849484	2849491	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7529	NC_011831	TGGT	2	8	2852553	2852560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_011831	GATGTT	2	12	2852571	2852582	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_011831	AT	3	6	2852598	2852603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_011831	GAC	2	6	2852623	2852628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7533	NC_011831	CCT	2	6	2853617	2853622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7534	NC_011831	CTC	3	9	2854311	2854319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7535	NC_011831	GC	3	6	2854321	2854326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7536	NC_011831	A	6	6	2854406	2854411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7537	NC_011831	GAC	2	6	2854419	2854424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7538	NC_011831	CGT	2	6	2854431	2854436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7539	NC_011831	TCG	2	6	2854456	2854461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7540	NC_011831	TCC	2	6	2855621	2855626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7541	NC_011831	AC	3	6	2858491	2858496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7542	NC_011831	TGA	2	6	2858510	2858515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7543	NC_011831	TGA	2	6	2858520	2858525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_011831	AGT	2	6	2858641	2858646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_011831	GTC	2	6	2858699	2858704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7546	NC_011831	TG	3	6	2858772	2858777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_011831	GTG	2	6	2858856	2858861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7548	NC_011831	GTGAG	2	10	2858872	2858881	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7549	NC_011831	CGGCAT	2	12	2858882	2858893	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7550	NC_011831	GCC	2	6	2858965	2858970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7551	NC_011831	CT	3	6	2859015	2859020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7552	NC_011831	GTCC	2	8	2859107	2859114	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7553	NC_011831	AC	3	6	2859170	2859175	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7554	NC_011831	TGA	2	6	2860382	2860387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7555	NC_011831	TCC	2	6	2860683	2860688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7556	NC_011831	TGG	2	6	2860689	2860694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7557	NC_011831	GT	3	6	2860700	2860705	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_011831	GAT	2	6	2860730	2860735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_011831	CGA	2	6	2860813	2860818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7560	NC_011831	CTC	2	6	2863113	2863118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7561	NC_011831	CTG	2	6	2863131	2863136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7562	NC_011831	GCTT	2	8	2863147	2863154	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7563	NC_011831	GTC	2	6	2863315	2863320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7564	NC_011831	ACG	2	6	2863321	2863326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7565	NC_011831	GA	3	6	2863345	2863350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_011831	T	6	6	2863978	2863983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7567	NC_011831	AGG	2	6	2865602	2865607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7568	NC_011831	TGT	2	6	2870011	2870016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7569	NC_011831	TGGC	2	8	2870043	2870050	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7570	NC_011831	AT	3	6	2870087	2870092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7571	NC_011831	TTG	2	6	2870101	2870106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7572	NC_011831	AAC	2	6	2870127	2870132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7573	NC_011831	CGC	2	6	2870187	2870192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7574	NC_011831	GCG	2	6	2870303	2870308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7575	NC_011831	TTG	2	6	2870373	2870378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7576	NC_011831	AGG	2	6	2870391	2870396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7577	NC_011831	AAGT	2	8	2872340	2872347	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7578	NC_011831	CTAC	2	8	2872352	2872359	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7579	NC_011831	CGG	2	6	2872369	2872374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7580	NC_011831	CGC	2	6	2872394	2872399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7581	NC_011831	GCTT	2	8	2872400	2872407	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7582	NC_011831	GAG	2	6	2872484	2872489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7583	NC_011831	TAC	2	6	2873735	2873740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7584	NC_011831	TCA	2	6	2873763	2873768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7585	NC_011831	GAG	2	6	2873773	2873778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7586	NC_011831	GC	3	6	2875839	2875844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7587	NC_011831	ACG	2	6	2876953	2876958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7588	NC_011831	GTG	2	6	2876977	2876982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7589	NC_011831	GCT	2	6	2876990	2876995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7590	NC_011831	AG	3	6	2877006	2877011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7591	NC_011831	GAT	3	9	2878258	2878266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7592	NC_011831	AGA	2	6	2878299	2878304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7593	NC_011831	ATA	2	6	2878418	2878423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7594	NC_011831	AGGT	2	8	2878533	2878540	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7595	NC_011831	CAC	2	6	2878658	2878663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7596	NC_011831	CAA	2	6	2878721	2878726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7597	NC_011831	GAA	2	6	2878761	2878766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7598	NC_011831	GTT	2	6	2878773	2878778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7599	NC_011831	GACA	2	8	2878796	2878803	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7600	NC_011831	GGC	2	6	2878808	2878813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7601	NC_011831	GCG	2	6	2878832	2878837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7602	NC_011831	CCG	2	6	2878859	2878864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7603	NC_011831	GGC	2	6	2878871	2878876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7604	NC_011831	CCG	2	6	2878929	2878934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7605	NC_011831	AT	3	6	2879006	2879011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7606	NC_011831	TG	3	6	2879047	2879052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7607	NC_011831	ACC	2	6	2879071	2879076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7608	NC_011831	ATC	2	6	2879089	2879094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7611	NC_011831	GGC	3	9	2879189	2879197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7612	NC_011831	AGG	2	6	2879216	2879221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7613	NC_011831	GTT	2	6	2880289	2880294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7614	NC_011831	GCCC	2	8	2880320	2880327	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7615	NC_011831	GGC	2	6	2880331	2880336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7616	NC_011831	CTA	2	6	2880342	2880347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7617	NC_011831	GAT	2	6	2880394	2880399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7619	NC_011831	GAT	2	6	2880552	2880557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7620	NC_011831	GTG	3	9	2880587	2880595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7621	NC_011831	GCA	2	6	2880607	2880612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7623	NC_011831	TGGG	2	8	2880725	2880732	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7624	NC_011831	CGA	2	6	2880743	2880748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7625	NC_011831	TAG	2	6	2880781	2880786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7626	NC_011831	ATC	2	6	2880819	2880824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7627	NC_011831	GGC	2	6	2880872	2880877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7629	NC_011831	ATC	2	6	2881116	2881121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7632	NC_011831	TCG	2	6	2881281	2881286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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