MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 12718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011831	ATGGA	2	10	2133610	2133619	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_011831	ATG	2	6	2134312	2134317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_011831	CT	3	6	2134342	2134347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5504	NC_011831	ACA	2	6	2135022	2135027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_011831	CAC	2	6	2135066	2135071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5506	NC_011831	TAT	2	6	2135863	2135868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_011831	CTC	2	6	2136933	2136938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5508	NC_011831	GC	3	6	2137112	2137117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5509	NC_011831	TCA	2	6	2137137	2137142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_011831	GAT	2	6	2137156	2137161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_011831	CCTA	2	8	2137201	2137208	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5512	NC_011831	ACC	2	6	2137865	2137870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5513	NC_011831	CGA	2	6	2139542	2139547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_011831	ACG	2	6	2142446	2142451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_011831	TCAGC	2	10	2143918	2143927	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5516	NC_011831	ATC	2	6	2144022	2144027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_011831	CA	3	6	2144136	2144141	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5518	NC_011831	CAT	2	6	2144143	2144148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_011831	AAG	2	6	2145703	2145708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_011831	GCG	2	6	2145729	2145734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_011831	AG	3	6	2145739	2145744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_011831	TCG	2	6	2146854	2146859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_011831	GAC	2	6	2146861	2146866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_011831	AG	3	6	2146867	2146872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_011831	TAC	2	6	2150879	2150884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_011831	CGG	2	6	2155496	2155501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_011831	ACAGG	2	10	2155512	2155521	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5528	NC_011831	CG	3	6	2155522	2155527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5529	NC_011831	CA	3	6	2155593	2155598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5530	NC_011831	CAT	2	6	2155600	2155605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_011831	GCC	2	6	2156101	2156106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_011831	GAGC	2	8	2156126	2156133	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5533	NC_011831	GCCT	2	8	2156191	2156198	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5534	NC_011831	GAG	2	6	2156266	2156271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_011831	CG	3	6	2156274	2156279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5536	NC_011831	CGTT	2	8	2156287	2156294	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5537	NC_011831	CGG	2	6	2156295	2156300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_011831	ATC	2	6	2156481	2156486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_011831	GGAT	2	8	2156498	2156505	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_011831	CA	3	6	2156512	2156517	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5541	NC_011831	GT	3	6	2156520	2156525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_011831	CGC	2	6	2156642	2156647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5543	NC_011831	ACGC	2	8	2156651	2156658	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5544	NC_011831	ACG	2	6	2156672	2156677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_011831	GCTC	2	8	2156678	2156685	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5546	NC_011831	GCAC	2	8	2156718	2156725	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5547	NC_011831	TTGC	2	8	2156727	2156734	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5548	NC_011831	CA	3	6	2156778	2156783	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5549	NC_011831	GTG	2	6	2156946	2156951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_011831	GC	4	8	2156983	2156990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5551	NC_011831	TGC	2	6	2157074	2157079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_011831	AAG	2	6	2157093	2157098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_011831	GGGC	2	8	2157134	2157141	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5554	NC_011831	AGA	2	6	2157184	2157189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_011831	A	6	6	2157216	2157221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_011831	CCT	2	6	2157241	2157246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5557	NC_011831	TCC	2	6	2158801	2158806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5558	NC_011831	GC	3	6	2158808	2158813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5559	NC_011831	ACGA	2	8	2161192	2161199	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5560	NC_011831	C	7	7	2161235	2161241	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5561	NC_011831	GTC	2	6	2161248	2161253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_011831	ACCC	2	8	2164028	2164035	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5563	NC_011831	TCC	2	6	2171797	2171802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5564	NC_011831	TCG	2	6	2171840	2171845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_011831	GAT	2	6	2171886	2171891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_011831	CGTGAG	2	12	2171922	2171933	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5567	NC_011831	TAA	2	6	2171939	2171944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_011831	A	7	7	2171968	2171974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_011831	GAT	2	6	2176790	2176795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_011831	CAT	2	6	2176808	2176813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_011831	AAC	2	6	2176851	2176856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_011831	TTGC	2	8	2176887	2176894	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5573	NC_011831	CAAG	2	8	2177039	2177046	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5574	NC_011831	TCAA	2	8	2179186	2179193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5575	NC_011831	ATT	2	6	2179905	2179910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_011831	ACG	2	6	2179960	2179965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_011831	A	6	6	2179983	2179988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_011831	GCGGTA	2	12	2180017	2180028	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5579	NC_011831	TAC	2	6	2180045	2180050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_011831	GTA	2	6	2180056	2180061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_011831	CAA	2	6	2180120	2180125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_011831	TCC	2	6	2181703	2181708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5583	NC_011831	GCG	2	6	2181715	2181720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_011831	AC	3	6	2181741	2181746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5585	NC_011831	CA	3	6	2181791	2181796	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5586	NC_011831	A	6	6	2181867	2181872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_011831	CCA	2	6	2181948	2181953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5588	NC_011831	GCAT	2	8	2181961	2181968	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5589	NC_011831	CG	3	6	2181994	2181999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5590	NC_011831	TGT	2	6	2182002	2182007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_011831	ACG	3	9	2182078	2182086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_011831	GT	3	6	2182119	2182124	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_011831	G	6	6	2182168	2182173	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_011831	AGG	2	6	2182269	2182274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_011831	TGC	2	6	2182321	2182326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_011831	TGC	2	6	2183948	2183953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_011831	ATC	2	6	2183984	2183989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_011831	CTC	2	6	2184028	2184033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5599	NC_011831	AGGG	2	8	2184065	2184072	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_011831	GCCA	2	8	2184084	2184091	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5601	NC_011831	GC	3	6	2184175	2184180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5602	NC_011831	TTCG	2	8	2184181	2184188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5603	NC_011831	ACCG	2	8	2184196	2184203	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5604	NC_011831	GA	3	6	2184222	2184227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_011831	AGCGAC	2	12	2184317	2184328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_011831	CGTGG	2	10	2184385	2184394	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5607	NC_011831	TAG	2	6	2184535	2184540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_011831	AAC	2	6	2188519	2188524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_011831	TTC	2	6	2189426	2189431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_011831	GAA	2	6	2189459	2189464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_011831	TCA	2	6	2189619	2189624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_011831	A	7	7	2189624	2189630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_011831	CGC	2	6	2189655	2189660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5614	NC_011831	GCA	2	6	2189671	2189676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_011831	TCC	2	6	2189880	2189885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5616	NC_011831	ACT	2	6	2189914	2189919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_011831	GAT	2	6	2189937	2189942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_011831	AG	3	6	2190025	2190030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_011831	C	6	6	2190089	2190094	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5620	NC_011831	CAG	2	6	2190119	2190124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_011831	GCC	2	6	2190223	2190228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5622	NC_011831	GCA	2	6	2191499	2191504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_011831	TAC	2	6	2191524	2191529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_011831	GC	3	6	2191537	2191542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5625	NC_011831	CCA	2	6	2191559	2191564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5626	NC_011831	CAA	2	6	2191614	2191619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_011831	CAAC	2	8	2191691	2191698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5628	NC_011831	CGCT	2	8	2191734	2191741	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5629	NC_011831	CCG	2	6	2191755	2191760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5630	NC_011831	GCT	2	6	2191895	2191900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5631	NC_011831	CG	3	6	2191946	2191951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5632	NC_011831	CCGC	2	8	2191997	2192004	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5633	NC_011831	GCA	2	6	2192011	2192016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5634	NC_011831	ACC	2	6	2192077	2192082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5635	NC_011831	ACT	2	6	2192104	2192109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5636	NC_011831	ACC	2	6	2192233	2192238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5639	NC_011831	CG	3	6	2192552	2192557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5640	NC_011831	ATG	2	6	2192596	2192601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5752	NC_011831	GCT	2	6	2217924	2217929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5754	NC_011831	CATAC	2	10	2219018	2219027	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5755	NC_011831	GAA	2	6	2219045	2219050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5757	NC_011831	G	7	7	2219118	2219124	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5758	NC_011831	G	7	7	2219155	2219161	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5759	NC_011831	G	6	6	2219205	2219210	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5892	NC_011831	CAT	2	6	2258682	2258687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5893	NC_011831	TCCTT	2	10	2259899	2259908	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5894	NC_011831	ACC	2	6	2259939	2259944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5895	NC_011831	GATA	2	8	2262396	2262403	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5896	NC_011831	GTA	2	6	2262404	2262409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5897	NC_011831	ACC	2	6	2262415	2262420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5898	NC_011831	GCC	2	6	2264061	2264066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5899	NC_011831	CGGTG	2	10	2264076	2264085	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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5916	NC_011831	CGG	2	6	2264871	2264876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5978	NC_011831	CAG	2	6	2299987	2299992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5999	NC_011831	GTTA	2	8	2312812	2312819	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6000	NC_011831	GTG	2	6	2313698	2313703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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