MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 12718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011831	GCATT	2	10	1941154	1941163	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5002	NC_011831	CTAT	2	8	1941226	1941233	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5003	NC_011831	ACC	2	6	1941298	1941303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5004	NC_011831	T	7	7	1941305	1941311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_011831	TCG	2	6	1941321	1941326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_011831	AC	3	6	1941363	1941368	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5007	NC_011831	CAT	2	6	1943449	1943454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_011831	GCA	2	6	1943456	1943461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_011831	CTG	2	6	1943473	1943478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_011831	GCA	2	6	1943519	1943524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_011831	CAA	2	6	1943545	1943550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_011831	CGA	2	6	1943588	1943593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_011831	AAC	2	6	1944737	1944742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_011831	GC	4	8	1946347	1946354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5015	NC_011831	TGC	2	6	1946385	1946390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_011831	CGC	2	6	1948802	1948807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5017	NC_011831	GAT	2	6	1948876	1948881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_011831	ATC	2	6	1948901	1948906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_011831	CGA	2	6	1948921	1948926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_011831	ACA	2	6	1948947	1948952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_011831	GTTAC	2	10	1951041	1951050	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5022	NC_011831	ATC	2	6	1951077	1951082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_011831	ATG	2	6	1951140	1951145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_011831	CAA	2	6	1951151	1951156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_011831	TTC	2	6	1951191	1951196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_011831	AAGC	2	8	1954218	1954225	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_011831	TA	3	6	1955674	1955679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_011831	A	7	7	1955698	1955704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_011831	GCA	3	9	1955744	1955752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_011831	CCGG	2	8	1955800	1955807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5031	NC_011831	AG	3	6	1955821	1955826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_011831	TCC	2	6	1956571	1956576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5033	NC_011831	TCG	2	6	1956590	1956595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_011831	CAC	2	6	1956620	1956625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5035	NC_011831	CTCC	2	8	1959086	1959093	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5036	NC_011831	TCAC	2	8	1959114	1959121	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5037	NC_011831	GCGG	2	8	1959181	1959188	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5038	NC_011831	CGC	2	6	1959320	1959325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5039	NC_011831	TAA	2	6	1959354	1959359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_011831	GTT	2	6	1959360	1959365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_011831	GT	3	6	1959371	1959376	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_011831	ACA	2	6	1959384	1959389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_011831	CA	3	6	1960459	1960464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5044	NC_011831	T	6	6	1960493	1960498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_011831	AGA	2	6	1960522	1960527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_011831	TAC	2	6	1960540	1960545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_011831	TCA	2	6	1960549	1960554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_011831	TCT	2	6	1960571	1960576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_011831	GCAC	2	8	1961116	1961123	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5050	NC_011831	A	6	6	1961148	1961153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_011831	CCT	2	6	1961164	1961169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5052	NC_011831	TCA	2	6	1961177	1961182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_011831	GCT	2	6	1962566	1962571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_011831	GCT	2	6	1962653	1962658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_011831	CA	3	6	1962680	1962685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5056	NC_011831	CGG	2	6	1962688	1962693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_011831	CCA	2	6	1962722	1962727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5058	NC_011831	ACT	2	6	1963240	1963245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_011831	ACC	2	6	1964092	1964097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5060	NC_011831	GTA	2	6	1964107	1964112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_011831	TAT	2	6	1964223	1964228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_011831	CCA	2	6	1964263	1964268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5063	NC_011831	TAGT	2	8	1966099	1966106	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_011831	GA	3	6	1966154	1966159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_011831	GGA	2	6	1966172	1966177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_011831	ACAT	2	8	1966860	1966867	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5067	NC_011831	TGA	2	6	1966869	1966874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_011831	GGT	2	6	1966901	1966906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_011831	GCC	2	6	1966950	1966955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5070	NC_011831	TACC	2	8	1967114	1967121	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5071	NC_011831	CGC	2	6	1968948	1968953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5072	NC_011831	AAT	2	6	1969025	1969030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_011831	GAG	2	6	1969567	1969572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_011831	GCA	2	6	1969576	1969581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_011831	AG	3	6	1969592	1969597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_011831	GAG	2	6	1969618	1969623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_011831	CT	3	6	1969673	1969678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5078	NC_011831	TCT	2	6	1969694	1969699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_011831	CGGT	2	8	1970860	1970867	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5080	NC_011831	CA	3	6	1973278	1973283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5081	NC_011831	CGG	2	6	1973313	1973318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_011831	CGG	2	6	1973350	1973355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_011831	GCC	2	6	1973407	1973412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5084	NC_011831	CAG	2	6	1973429	1973434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_011831	CGG	2	6	1973470	1973475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_011831	CGG	2	6	1973507	1973512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_011831	GC	3	6	1973532	1973537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5088	NC_011831	GCC	2	6	1973564	1973569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5089	NC_011831	CAG	2	6	1973586	1973591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_011831	CAG	2	6	1973626	1973631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_011831	TCC	2	6	1973639	1973644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_011831	CAG	2	6	1973666	1973671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_011831	A	6	6	1973780	1973785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_011831	AGGA	2	8	1973825	1973832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_011831	ACG	2	6	1974720	1974725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_011831	CTT	2	6	1974779	1974784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_011831	CCA	2	6	1975576	1975581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5098	NC_011831	AAC	2	6	1975606	1975611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_011831	ACC	2	6	1975638	1975643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5100	NC_011831	TCA	2	6	1975712	1975717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_011831	CAA	2	6	1975735	1975740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_011831	AAC	2	6	1977371	1977376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_011831	CCG	2	6	1977451	1977456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5104	NC_011831	GC	3	6	1977471	1977476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5105	NC_011831	CCG	2	6	1977532	1977537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_011831	GC	3	6	1977552	1977557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5107	NC_011831	CCG	2	6	1977638	1977643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_011831	GGT	2	6	1977654	1977659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_011831	CCG	2	6	1977736	1977741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5110	NC_011831	GC	3	6	1977756	1977761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5111	NC_011831	CCG	2	6	1977828	1977833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5112	NC_011831	GGT	2	6	1977844	1977849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_011831	CCG	2	6	1977917	1977922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5114	NC_011831	GGT	2	6	1977933	1977938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_011831	ATCC	2	8	1979563	1979570	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5116	NC_011831	GGT	2	6	1979581	1979586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_011831	ATG	2	6	1979595	1979600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_011831	GC	3	6	1983572	1983577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5119	NC_011831	TGC	2	6	1985973	1985978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_011831	GGTA	2	8	1988392	1988399	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_011831	ACT	2	6	1988420	1988425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_011831	CAT	2	6	1988442	1988447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_011831	TC	3	6	1988448	1988453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5124	NC_011831	CTC	2	6	1990149	1990154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5125	NC_011831	GAA	2	6	1990249	1990254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_011831	GC	3	6	1990291	1990296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5127	NC_011831	GA	3	6	1990320	1990325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_011831	CTC	2	6	1991536	1991541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5129	NC_011831	GCAAC	2	10	1992842	1992851	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5131	NC_011831	TCC	3	9	1993287	1993295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5250	NC_011831	CTACA	2	10	2017175	2017184	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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5255	NC_011831	TTC	2	6	2018351	2018356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5257	NC_011831	AC	3	6	2018385	2018390	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5258	NC_011831	CGT	3	9	2021985	2021993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5260	NC_011831	CA	3	6	2022059	2022064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5261	NC_011831	CAA	2	6	2022148	2022153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5262	NC_011831	GCA	2	6	2022708	2022713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5265	NC_011831	GTATA	2	10	2027472	2027481	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5271	NC_011831	ATCT	2	8	2029765	2029772	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5272	NC_011831	TCGA	2	8	2030988	2030995	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5390	NC_011831	AGCGC	2	10	2073267	2073276	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5391	NC_011831	GCA	2	6	2073310	2073315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5392	NC_011831	GCA	2	6	2073330	2073335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5393	NC_011831	GCA	2	6	2073350	2073355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5394	NC_011831	AGCGC	2	10	2073456	2073465	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5395	NC_011831	AACC	2	8	2073477	2073484	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5396	NC_011831	GCA	2	6	2073500	2073505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5397	NC_011831	GCA	2	6	2073520	2073525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5398	NC_011831	GCA	2	6	2073560	2073565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5399	NC_011831	AGCGC	2	10	2073666	2073675	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5400	NC_011831	AACC	2	8	2073687	2073694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5401	NC_011831	GCA	2	6	2073710	2073715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5403	NC_011831	A	7	7	2073817	2073823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5404	NC_011831	GCA	2	6	2073841	2073846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5411	NC_011831	GCA	2	6	2074104	2074109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5412	NC_011831	A	7	7	2074191	2074197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5413	NC_011831	AGCGC	2	10	2074293	2074302	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5414	NC_011831	AACC	2	8	2074314	2074321	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5415	NC_011831	AGCG	2	8	2074330	2074337	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5416	NC_011831	GCA	2	6	2074446	2074451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5421	NC_011831	CAT	2	6	2075847	2075852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5422	NC_011831	TAC	2	6	2077255	2077260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5424	NC_011831	ACA	2	6	2078146	2078151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5428	NC_011831	AAGGT	2	10	2084755	2084764	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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5434	NC_011831	GTCG	2	8	2087809	2087816	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5480	NC_011831	AAG	2	6	2112089	2112094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5482	NC_011831	TCG	2	6	2112147	2112152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5494	NC_011831	CGG	2	6	2130085	2130090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5496	NC_011831	GCCC	2	8	2130273	2130280	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5497	NC_011831	TAC	2	6	2131682	2131687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5498	NC_011831	CCA	2	6	2131696	2131701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5499	NC_011831	CG	3	6	2131720	2131725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5500	NC_011831	GGTC	2	8	2133438	2133445	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

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