MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 12718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011831	CAG	2	6	1726692	1726697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_011831	GGA	2	6	1726719	1726724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_011831	ATGGA	2	10	1729651	1729660	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_011831	CGGA	2	8	1729722	1729729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4505	NC_011831	ATC	2	6	1729812	1729817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_011831	CGC	2	6	1729823	1729828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4507	NC_011831	AAAAG	2	10	1731157	1731166	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_011831	TAGC	2	8	1731206	1731213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4509	NC_011831	CCA	2	6	1731249	1731254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NC_011831	AGT	2	6	1733405	1733410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_011831	ATG	2	6	1733418	1733423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_011831	AAT	2	6	1735469	1735474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_011831	AT	3	6	1735562	1735567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_011831	GAT	2	6	1735572	1735577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_011831	AGT	2	6	1735595	1735600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_011831	CGC	2	6	1735637	1735642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4517	NC_011831	TCA	2	6	1735647	1735652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_011831	TCA	2	6	1735672	1735677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_011831	ACC	2	6	1735719	1735724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4520	NC_011831	CAAC	2	8	1735725	1735732	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4521	NC_011831	AGC	2	6	1735748	1735753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_011831	TGAGT	2	10	1735827	1735836	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_011831	GCT	2	6	1735927	1735932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_011831	TCA	2	6	1735944	1735949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_011831	AGG	2	6	1735973	1735978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_011831	ACA	2	6	1738915	1738920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_011831	AGGAT	2	10	1739982	1739991	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_011831	CAAC	2	8	1740430	1740437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4529	NC_011831	TTG	2	6	1741656	1741661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_011831	GA	3	6	1744967	1744972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_011831	AGC	3	9	1744974	1744982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_011831	CAA	2	6	1745017	1745022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_011831	CGC	2	6	1745023	1745028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4534	NC_011831	TAT	2	6	1745049	1745054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_011831	GCT	2	6	1747293	1747298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_011831	TTCG	2	8	1747299	1747306	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4537	NC_011831	GTA	2	6	1747317	1747322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_011831	ATG	2	6	1747336	1747341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_011831	AAG	2	6	1747443	1747448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_011831	TTG	2	6	1747458	1747463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_011831	AGG	2	6	1747464	1747469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_011831	ACG	2	6	1754184	1754189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_011831	AGCG	2	8	1754926	1754933	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4544	NC_011831	ACG	2	6	1755034	1755039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_011831	TGT	2	6	1755041	1755046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_011831	ACCG	2	8	1755055	1755062	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4547	NC_011831	CCG	2	6	1755066	1755071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4548	NC_011831	GTT	2	6	1756347	1756352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_011831	ACA	2	6	1756358	1756363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_011831	CGC	2	6	1756398	1756403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4551	NC_011831	TTC	2	6	1756410	1756415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_011831	TTC	2	6	1756442	1756447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_011831	CCG	2	6	1756455	1756460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4554	NC_011831	CCG	2	6	1757843	1757848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4555	NC_011831	TTGC	2	8	1758438	1758445	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4556	NC_011831	ATT	2	6	1758967	1758972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_011831	CCG	2	6	1758996	1759001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4558	NC_011831	TA	3	6	1759120	1759125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_011831	TCC	2	6	1759160	1759165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4560	NC_011831	CAA	2	6	1759172	1759177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_011831	GCT	2	6	1759216	1759221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_011831	TCA	2	6	1759225	1759230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_011831	GCT	2	6	1759398	1759403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_011831	TCA	2	6	1759407	1759412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_011831	GCT	2	6	1759486	1759491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_011831	TCA	2	6	1759495	1759500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_011831	GCT	2	6	1759574	1759579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_011831	TCA	2	6	1759583	1759588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_011831	GCT	2	6	1759663	1759668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_011831	TCA	2	6	1759672	1759677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_011831	AAAGG	2	10	1759679	1759688	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_011831	TG	3	6	1760882	1760887	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_011831	CCA	2	6	1762856	1762861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4574	NC_011831	CCT	2	6	1762878	1762883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4575	NC_011831	TCC	2	6	1762884	1762889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4576	NC_011831	GCC	2	6	1762899	1762904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4577	NC_011831	GCC	2	6	1762979	1762984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4578	NC_011831	GCC	2	6	1763067	1763072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4579	NC_011831	GCC	2	6	1763163	1763168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4580	NC_011831	GAAC	2	8	1763834	1763841	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4581	NC_011831	GAG	2	6	1764258	1764263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_011831	GCG	2	6	1765583	1765588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_011831	CGC	2	6	1765600	1765605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4584	NC_011831	TCA	2	6	1765606	1765611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_011831	GGA	2	6	1768145	1768150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_011831	AAC	2	6	1768182	1768187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_011831	GCG	3	9	1769468	1769476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_011831	CGA	2	6	1771529	1771534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_011831	TAA	2	6	1772940	1772945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_011831	CAT	2	6	1772960	1772965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_011831	TCG	2	6	1773600	1773605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_011831	ATT	2	6	1773681	1773686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_011831	GAC	2	6	1774209	1774214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_011831	AGG	2	6	1778931	1778936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_011831	CGC	2	6	1779135	1779140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4596	NC_011831	CA	3	6	1779164	1779169	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4597	NC_011831	AGT	2	6	1780117	1780122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_011831	ACG	2	6	1780157	1780162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_011831	GGA	2	6	1780173	1780178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_011831	CGG	2	6	1780236	1780241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_011831	GT	3	6	1780260	1780265	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_011831	CG	3	6	1780306	1780311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4603	NC_011831	T	7	7	1780350	1780356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_011831	AGG	2	6	1780367	1780372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_011831	TAG	2	6	1782942	1782947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_011831	TCG	2	6	1782955	1782960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_011831	CGGC	2	8	1783026	1783033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4608	NC_011831	TAG	2	6	1783053	1783058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_011831	GTA	2	6	1783117	1783122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_011831	TTTA	2	8	1783126	1783133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_011831	CTAA	2	8	1783140	1783147	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4612	NC_011831	GTC	2	6	1783595	1783600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_011831	CT	3	6	1787538	1787543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4614	NC_011831	GTA	2	6	1787547	1787552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_011831	GCCG	2	8	1787595	1787602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4616	NC_011831	CTGCG	2	10	1787605	1787614	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4617	NC_011831	GT	3	6	1787632	1787637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_011831	GTCA	2	8	1787664	1787671	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4619	NC_011831	T	7	7	1787685	1787691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_011831	CAA	2	6	1787822	1787827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_011831	TGC	2	6	1787986	1787991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_011831	CGC	2	6	1788007	1788012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_011831	ACG	2	6	1788070	1788075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_011831	CAG	2	6	1788152	1788157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_011831	TCA	2	6	1788162	1788167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_011831	A	7	7	1788167	1788173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_011831	CCA	2	6	1788201	1788206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4628	NC_011831	AAC	2	6	1792421	1792426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_011831	GA	3	6	1792504	1792509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4890	NC_011831	C	6	6	1912219	1912224	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4891	NC_011831	GGA	2	6	1912246	1912251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4893	NC_011831	GGA	2	6	1912383	1912388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4895	NC_011831	C	6	6	1912629	1912634	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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